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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6trq | |||||||||
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タイトル | S.c. Scavenger Decapping Enzyme DcpS in complex with the capped RNA dinucleotide m7G-GU | |||||||||
要素 | m7GpppX diphosphatase | |||||||||
キーワード | HYDROLASE / mRNA decapping / mRNA degradation / decapping | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 exoribonuclease activator activity / m7G(5')pppN diphosphatase complex / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-independent decay / 5'-(N7-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase / mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease / 5'-(N(7)-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase activity / deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA / hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides / RNA 7-methylguanosine cap binding / response to osmotic stress ...exoribonuclease activator activity / m7G(5')pppN diphosphatase complex / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-independent decay / 5'-(N7-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase / mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease / 5'-(N(7)-methyl 5'-triphosphoguanosine)-[mRNA] diphosphatase activity / deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA / hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides / RNA 7-methylguanosine cap binding / response to osmotic stress / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay / nuclear-transcribed mRNA catabolic process / cellular response to starvation / response to nutrient / P-body / response to heat / response to oxidative stress / protein heterodimerization activity / perinuclear region of cytoplasm / protein homodimerization activity / mitochondrion / identical protein binding / nucleus / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Saccharomyces cerevisiae (パン酵母) | |||||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.944 Å | |||||||||
データ登録者 | Fuchs, A.-L. / Neu, A. / Sprangers, R. | |||||||||
資金援助 | ドイツ, 2件
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引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2020 タイトル: Molecular basis of the selective processing of short mRNA substrates by the DcpS mRNA decapping enzyme. 著者: Fuchs, A.L. / Wurm, J.P. / Neu, A. / Sprangers, R. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 6trq.cif.gz | 562.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb6trq.ent.gz | 466.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 6trq.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 6trq_validation.pdf.gz | 2.4 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 6trq_full_validation.pdf.gz | 2.4 MB | 表示 | |
XML形式データ | 6trq_validation.xml.gz | 51.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 6trq_validation.cif.gz | 68.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tr/6trq ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tr/6trq | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域: Ens-ID: 1
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