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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6swr | |||||||||
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タイトル | Crystal structure of the lysosomal potassium channel MtTMEM175 T38A mutant soaked with zinc | |||||||||
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![]() | TRANSPORT PROTEIN / lysosome / TMEM175 / potassium channel / Parkinson disease | |||||||||
機能・相同性 | ![]() potassium ion leak channel activity / proton channel activity / detection of maltose stimulus / maltose transport complex / carbohydrate transport / carbohydrate transmembrane transporter activity / maltose binding / maltose transport / maltodextrin transmembrane transport / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex, substrate-binding subunit-containing ...potassium ion leak channel activity / proton channel activity / detection of maltose stimulus / maltose transport complex / carbohydrate transport / carbohydrate transmembrane transporter activity / maltose binding / maltose transport / maltodextrin transmembrane transport / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex, substrate-binding subunit-containing / potassium ion transmembrane transport / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex / cell chemotaxis / outer membrane-bounded periplasmic space / protein homotetramerization / periplasmic space / DNA damage response / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() Marivirga tractuosa | |||||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Brunner, J.D. / Jakob, R.P. / Schulze, T. / Neldner, Y. / Moroni, A. / Thiel, G. / Maier, T. / Schenck, S. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis for ion selectivity in TMEM175 K + channels. 著者: Brunner, J.D. / Jakob, R.P. / Schulze, T. / Neldner, Y. / Moroni, A. / Thiel, G. / Maier, T. / Schenck, S. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 919.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
-抗体 / タンパク質 , 2種, 4分子 ADBE
#1: 抗体 | 分子量: 53267.004 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() 遺伝子: malE, b4034, JW3994 / プラスミド: pBXNPHM3 / 株: K12 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 29450.943 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: ATCC 23168 / DSM 4126 / NBRC 15989 / NCIMB 1408 / VKM B-1430 / H-43 遺伝子: Ftrac_2467 / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-糖 , 2種, 4分子 ![](data/chem/img/LMT.gif)
#3: 多糖 | #4: 糖 | |
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-非ポリマー , 2種, 32分子 ![](data/chem/img/K.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#5: 化合物 | ChemComp-K / |
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#6: 水 | ChemComp-HOH / |
-詳細
研究の焦点であるリガンドがあるか | Y |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.24 Å3/Da / 溶媒含有率: 70.96 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 詳細: 100 mM Tris-HCl pH 8.5, 150 mM NaCl, 150 mM MgCl2 and 28-30 % PEG400 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS EIGER X 16M / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年2月9日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.280961 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.2→49.72 Å / Num. obs: 43526 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 51.8 % / Biso Wilson estimate: 76.29 Å2 / CC1/2: 0.993 / Net I/σ(I): 6.5 |
反射 シェル | 解像度: 3.2→3.32 Å / Num. unique obs: 4510 / CC1/2: 0.663 |