登録情報 | データベース: PDB / ID: 6spn |
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タイトル | Structure of the Escherichia coli methionyl-tRNA synthetase complexed with beta-methionine |
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要素 | Methionine--tRNA ligase |
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キーワード | TRANSLATION / tRNA aminoacylation |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
methionine-tRNA ligase / methionine-tRNA ligase activity / methionyl-tRNA aminoacylation / tRNA binding / protein homodimerization activity / zinc ion binding / ATP binding / membrane / metal ion binding / cytosol / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Methionine-tRNA ligase, type 1 / Methionyl-tRNA synthetase, Zn-domain / Methionyl-tRNA synthetase, beta subunit, C-terminal / Anticodon binding domain of methionyl tRNA ligase / Methionyl-tRNA synthetase / Methioninyl-tRNA synthetase core domain / Methionyl-tRNA synthetase, anticodon-binding domain / Isoleucyl-tRNA Synthetase; Domain 1 / Isoleucyl-tRNA Synthetase; Domain 1 / tRNA-binding domain ...Methionine-tRNA ligase, type 1 / Methionyl-tRNA synthetase, Zn-domain / Methionyl-tRNA synthetase, beta subunit, C-terminal / Anticodon binding domain of methionyl tRNA ligase / Methionyl-tRNA synthetase / Methioninyl-tRNA synthetase core domain / Methionyl-tRNA synthetase, anticodon-binding domain / Isoleucyl-tRNA Synthetase; Domain 1 / Isoleucyl-tRNA Synthetase; Domain 1 / tRNA-binding domain / Putative tRNA binding domain / tRNA-binding domain profile. / Methionyl/Leucyl tRNA synthetase / tRNA synthetases class I (M) / Aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia, anticodon-binding / Aminoacyl-tRNA synthetase, class I, conserved site / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-I signature. / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold / Nucleic acid-binding, OB-fold / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 (3R)-3-amino-5-(methylsulfanyl)pentanoic acid / CITRIC ACID / Methionine--tRNA ligase / Methionine--tRNA ligase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.45 Å |
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データ登録者 | Nigro, G. / Schmitt, E. / Mechulam, Y. |
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引用 | ジャーナル: J.Struct.Biol. / 年: 2020 タイトル: Use of beta3-methionine as an amino acid substrate of Escherichia coli methionyl-tRNA synthetase. 著者: Nigro, G. / Bourcier, S. / Lazennec-Schurdevin, C. / Schmitt, E. / Marliere, P. / Mechulam, Y. |
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履歴 | 登録 | 2019年9月2日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2020年1月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2020年3月11日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.title / _citation.year |
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改定 2.0 | 2023年11月15日 | Group: Atomic model / Data collection / Database references カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_alt_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _atom_site_anisotrop.id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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