[English] 日本語
Yorodumi- PDB-6scf: A viral anti-CRISPR subverts type III CRISPR immunity by rapid de... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6scf | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | A viral anti-CRISPR subverts type III CRISPR immunity by rapid degradation of cyclic oligoadenylate | |||||||||
Components |
| |||||||||
Keywords | DNA / CRISPR cyclic oligoadenylate DNA anti-CRISPR viral | |||||||||
Function / homology | STIV B116-like / STIV B116-like superfamily / STIV B116-like / Uncharacterised protein PF08960, DUF1874 / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta / RNA / Uncharacterized protein 114 Function and homology information | |||||||||
Biological species | Sulfolobus islandicus rod-shaped virus 1 synthetic construct (others) | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.55 Å | |||||||||
Authors | McMahon, S.A. / Athukoralage, J.S. / Graham, S. / White, M.F. / Gloster, T.M. | |||||||||
Funding support | United Kingdom, 2items
| |||||||||
Citation | Journal: Nature / Year: 2020 Title: An anti-CRISPR viral ring nuclease subverts type III CRISPR immunity. Authors: Athukoralage, J.S. / McMahon, S.A. / Zhang, C. / Gruschow, S. / Graham, S. / Krupovic, M. / Whitaker, R.J. / Gloster, T.M. / White, M.F. | |||||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6scf.cif.gz | 417.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb6scf.ent.gz | 339.8 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6scf.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 6scf_validation.pdf.gz | 529.4 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 6scf_full_validation.pdf.gz | 534.4 KB | Display | |
Data in XML | 6scf_validation.xml.gz | 38.9 KB | Display | |
Data in CIF | 6scf_validation.cif.gz | 57.3 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sc/6scf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sc/6scf | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 2x4iS S: Starting model for refinement |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
|