[日本語] English
- PDB-6s7g: Cfucosylated linker peptide SBL1 bound to Fucose binding Lectin L... -

+
データを開く


IDまたはキーワード:

読み込み中...

-
基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6s7g
タイトルCfucosylated linker peptide SBL1 bound to Fucose binding Lectin LecB (PA-IIL) from Pseudomonas aeruginosa at 1.84 Angstrom resolution
要素
  • Fucose-binding lectin
  • SBL1
キーワードSUGAR BINDING PROTEIN / Lectin / Fucosylated
機能・相同性
機能・相同性情報


single-species biofilm formation / carbohydrate binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能
Lectin, sugar-binding / Calcium-mediated lectin / Calcium-mediated lectin / Calcium-mediated lectin superfamily / Fucose-binding lectin II (PA-IIL) / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Chem-ZDC / Fucose-binding lectin / Fucose-binding lectin PA-IIL
類似検索 - 構成要素
生物種Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)
synthetic construct (人工物)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.841 Å
データ登録者Baeriswyl, S. / Stocker, A. / Reymond, J.-L.
資金援助 スイス, 1件
組織認可番号
Swiss National Science Foundation スイス
引用ジャーナル: Helv.Chim.Acta / : 2019
タイトル: X-Ray Crystal Structure of a Second Generation Peptide Dendrimer in Complex with Pseudomonas aeruginosa Lectin LecB
著者: Baeriswyl, S. / Javor, S. / Stocker, A. / Darbre, T. / Reymond, J.-L.
履歴
登録2019年7月4日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02019年8月21日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12020年7月29日Group: Data collection / Derived calculations
カテゴリ: chem_comp / pdbx_struct_conn_angle ...chem_comp / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_site / struct_site_gen
Item: _chem_comp.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id ..._chem_comp.type / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id
解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.22024年1月24日Group: Data collection / Database references / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: Fucose-binding lectin
B: Fucose-binding lectin
F: SBL1
C: Fucose-binding lectin
G: SBL1
D: Fucose-binding lectin
H: SBL1
E: SBL1
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)50,16320
ポリマ-49,0188
非ポリマー1,14512
8,251458
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
  • 根拠: mass spectrometry
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
Buried area11040 Å2
ΔGint-145 kcal/mol
Surface area15850 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)123.230, 56.742, 70.622
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number18
Space group name H-MP21212
Components on special symmetry positions
IDモデル要素
11A-465-

HOH

21D-437-

HOH

31D-500-

HOH

-
要素

#1: タンパク質
Fucose-binding lectin / Fucose-binding lectin II (PA-IIL) / Fucose-binding lectin PA-IIL


分子量: 11734.707 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現
詳細: Fucose binding Lectin LecB from Pseudomonas aeruginosa (PA-IIL)
由来: (組換発現) Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)
遺伝子: lecB, C0043_24310, C0044_25260, C0046_23510, CAZ10_21840, CW299_25270, DI492_13230, DT376_00595, PAERUG_E15_London_28_01_14_00983, PAMH19_1713, RW109_RW109_02453
発現宿主: Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' (大腸菌)
参照: UniProt: A0A069Q9V4, UniProt: Q9HYN5*PLUS
#2: タンパク質・ペプチド
SBL1


分子量: 519.681 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: Cfucosylated Linker peptide SBL1 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#3: 化合物
ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン


分子量: 40.078 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現 / : Ca
#4: 糖
ChemComp-ZDC / 3,7-anhydro-2,8-dideoxy-L-glycero-D-gluco-octonic acid


タイプ: D-saccharide / 分子量: 206.193 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / : C8H14O6 / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#5: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 458 / 由来タイプ: 天然 / : H2O
研究の焦点であるリガンドがあるかY

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.54 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.5 %
結晶化温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5
詳細: 0.5 M Ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 30% v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol

-
データ収集

回折平均測定温度: 80 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 0.799998 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 2M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年6月28日
放射プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.799998 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.841→46.428 Å / Num. obs: 82590 / % possible obs: 99.5 % / 冗長度: 3.4 % / Biso Wilson estimate: 23.4 Å2 / CC1/2: 0.98 / Rrim(I) all: 0.286 / Net I/σ(I): 4.69
反射 シェル解像度: 1.841→1.85 Å / 冗長度: 2.8 % / Mean I/σ(I) obs: 0.77 / Num. unique obs: 13122 / CC1/2: 0.29 / Rrim(I) all: 1.58 / % possible all: 97.8

-
位相決定

位相決定手法: 分子置換
Phasing MR
最高解像度最低解像度
Rotation2.86 Å46.43 Å
Translation2.86 Å46.43 Å

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類NB
PHENIX精密化
XDSデータ削減
XSCALEデータスケーリング
PHASER2.8.3位相決定
PDB_EXTRACT3.25データ抽出
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 1OXC
解像度: 1.841→46.428 Å / SU ML: 0.21 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.17 / 位相誤差: 20.3 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2107 4093 4.96 %
Rwork0.1884 78434 -
obs0.1895 82527 99.48 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
原子変位パラメータBiso max: 96.63 Å2 / Biso mean: 23.8839 Å2 / Biso min: 8.4 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 1.841→46.428 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数3394 0 90 458 3942
Biso mean--29.82 32.39 -
残基数----470
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0033453
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.6014726
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.051605
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.002626
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d11.3261980
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection Rwork% reflection obs (%)
1.841-1.86220.31741350.3112258194
1.8622-1.88490.3221380.2991269699
1.8849-1.90870.34131400.3048263998
1.9087-1.93390.29591430.291271299
1.9339-1.96040.31851420.2869271799
1.9604-1.98840.28191390.26382672100
1.9884-2.0180.271440.25842734100
2.018-2.04960.25671410.2402267099
2.0496-2.08320.24721420.23732724100
2.0832-2.11910.23541400.22552720100
2.1191-2.15760.2551400.22342701100
2.1576-2.19910.23721420.21322722100
2.1991-2.2440.24021430.20772688100
2.244-2.29280.25641380.20372713100
2.2928-2.34610.23991420.1942721100
2.3461-2.40480.22881410.1972707100
2.4048-2.46980.2541440.19492729100
2.4698-2.54250.22521410.18542715100
2.5425-2.62460.22131450.18182720100
2.6246-2.71830.19281430.16932739100
2.7183-2.82720.18421410.16132726100
2.8272-2.95580.19091430.16062703100
2.9558-3.11160.17821400.14982709100
3.1116-3.30650.21370.14462723100
3.3065-3.56170.16061470.1332720100
3.5617-3.920.13881400.12862706100
3.92-4.48680.15381380.13652698100
4.4868-5.65140.15721420.15342730100
5.6514-46.4280.2061420.2432269999
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL112)L122)L132)L222)L232)L332)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T112)T122)T132)T222)T232)T332)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
11.24820.1551-0.61861.06080.12762.4392-0.0021-0.0473-0.170.1053-0.0146-0.20710.29390.13320.04430.18010.013-0.02480.14330.00510.207-11.79055.6805-16.3258
20.1353-0.0630.21430.3232-0.34085.9954-0.0044-0.1435-0.0528-0.02090.1245-0.074-0.04460.0449-0.1640.21830.04740.02270.2360.00410.2645-7.9354-1.2806-19.0522
33.7689-1.4688-4.47517.9032-0.53786.10990.14230.7027-0.3018-0.4344-0.0584-0.10130.147-0.4767-0.13440.2297-00.00010.2303-0.02550.1581-11.42476.0637-35.0316
41.58970.7646-1.73551.3931-0.72414.03970.0883-0.2654-0.1877-0.0067-0.1035-0.1850.18150.2470.00880.17190.0411-0.03140.14210.0070.1767-12.40932.6044-15.024
53.80320.17653.19233.2874.57598.6495-0.11090.5246-0.1284-0.8430.2045-0.3752-0.15180.8816-0.11940.23510.01160.08980.2930.00590.29641.74757.9641-24.8898
63.6716-1.5053-1.32441.43251.11611.16230.1930.07220.11440.0274-0.0828-0.0451-0.01720.0073-0.07840.1652-0.0043-0.00490.12820.01520.1311-18.438313.9021-16.2747
72.0355-0.2583-1.31350.8553-0.21542.12660.03660.01550.2642-0.08570.0657-0.09360.01990.1516-0.08290.1710.00030.00970.1375-0.02950.1793-13.077611.1966-23.0324
83.8278-0.05123.16240.86730.2814.5250.1429-0.0921-0.1564-0.0657-0.023-0.05430.2688-0.1679-0.06090.21710.00630.02930.1344-0.00240.1511-28.913519.3126-3.4248
91.8183-0.39091.10771.9656-1.82573.2298-0.09640.02690.16840.2216-0.01810.0457-0.27480.02730.16880.15790.01340.0080.1255-0.03840.1404-29.865934.949-7.6899
100.6992-1.1001-0.14888.9009-6.4196.27080.05650.0334-0.20980.45740.21950.5846-0.2712-0.041-0.2950.26420.01020.02520.1482-0.0240.1952-35.915828.4132-1.4274
110.66090.23390.20892.0556-1.74932.0722-0.1033-0.01380.0274-0.15460.0752-0.01170.0409-0.10350.03480.25910.00830.03080.1393-0.01820.1852-33.633237.7474-6.6789
122.9361-4.1444.47515.7143-6.146.5894-0.145-0.0778-0.02350.7316-0.03140.0634-0.494-0.12220.11670.2446-0.00420.03530.1562-0.02290.1418-26.93334.7613-1.313
132.4745-2.29923.03373.2993-3.44474.7477-0.2464-0.4717-0.1630.12890.40620.2667-0.232-0.602-0.2570.20320.03420.03020.19750.00660.1901-34.147724.2817-1.9447
141.9281-1.9886-2.37712.6513.26214.0401-0.45530.51410.91180.4632-0.32421.3443-0.1871-0.69430.55620.29770.03270.05920.1942-0.0530.4515-45.045832.5136-10.5821
154.2568-2.475-0.37012.51230.14270.5335-0.13630.1243-0.10280.20150.0970.0596-0.10270.07780.02670.1636-0.02120.01350.13430.00110.1205-24.693923.1855-11.3364
161.077-0.76750.74870.6691-0.67521.59630.19530.0089-0.1224-0.0966-0.07870.0630.1693-0.0436-0.12230.1697-0.0128-0.00570.1347-0.00170.1724-30.153930.3031-12.8002
176.78121.447-6.70280.8134-1.12757.660.02950.24480.03110.0271-0.1583-0.058-0.1041-0.23060.14120.1710.0196-0.02340.17090.0040.1542-28.197320.3411-30.8124
180.55210.5980.02362.3586-1.39362.4828-0.00740.073-0.0331-0.17870.0520.00980.2226-0.0794-0.05090.19470.0239-0.00020.1302-0.01190.1372-30.70536.7263-30.692
195.64753.6248-0.40114.04892.16243.8743-0.2697-0.1882-0.00420.106-0.1018-0.0156-0.0068-0.17850.29870.24280.007-0.04870.18240.020.1762-28.7511-3.6617-19.3963
200.45580.46060.15351.9139-1.21841.5426-0.08580.07910.0545-0.14850.1343-0.02430.094-0.0981-0.05720.2026-0.0038-0.00780.1636-0.02620.1389-28.563611.1609-33.13
213.5579-2.48723.5783.16840.1048.45840.4152-0.0725-0.5264-0.426-0.511.44320.502-0.48110.12630.1909-0.0255-0.05860.1593-0.0350.3145-42.57944.6632-24.344
220.1761-0.0267-0.06250.52440.60630.4903-0.0041-0.03340.07380.01010.01080.038-0.0196-0.0255-0.0040.17580.0183-0.00290.15770.01080.1471-26.167213.1955-22.1481
236.6639-3.10652.84952.0028-1.45952.190.16460.38010.1053-0.2352-0.2324-0.13860.16710.21880.04420.1665-0.0012-0.00460.15280.02190.1634-15.134131.5458-24.8805
241.92180.03381.74870.7463-0.97485.3136-0.05220.03790.21820.0177-0.0325-0.0305-0.18910.26660.08590.2091-0.0150.01250.1197-0.02540.1851-13.111138.0597-13.3054
250.9193-0.0947-0.92770.731-1.17156.09810.0831-0.01520.1477-0.07530.0984-0.0717-0.07720.185-0.00530.2476-0.0352-0.00710.1838-0.0160.2017-11.01443.2205-14.7273
269.1165.53756.62663.44453.85225.12960.3235-0.42940.41850.6160.05440.11690.1298-0.2687-0.25130.22-0.00360.05680.1611-0.06320.2492-14.705835.99191.2502
270.68270.33990.72260.6620.14322.2368-0.0550.0840.10330.0135-0.04880.0111-0.09730.15290.1270.2205-0.01080.02010.14650.02360.1885-14.763938.7225-18.741
284.63083.8946-2.61964.0663-1.07623.08530.0195-0.09370.06180.50020.3311-0.3193-0.66510.2723-0.35840.2065-0.0197-0.01330.2087-0.01360.1973-0.767635.3912-8.4129
292.89741.13211.57050.44150.90641.40940.0855-0.1204-0.0562-0.1001-0.0521-0.03830.0327-0.0767-0.00140.1609-0.00680.01040.15310.01320.1467-19.362126.8865-17.4067
301.4-0.10950.30540.0082-0.01560.50760.1509-0.05930.0421-0.0405-0.06480.00180.08680.0474-0.0720.1887-0.02730.00460.1541-0.00010.1563-14.814630.4129-10.3756
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 1 through 34 )A1 - 34
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 35 through 42 )A35 - 42
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 43 through 47 )A43 - 47
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 48 through 68 )A48 - 68
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 69 through 74 )A69 - 74
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 75 through 95 )A75 - 95
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'A' and (resid 96 through 114 )A96 - 114
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resid 1 through 12 )B1 - 12
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resid 13 through 25 )B13 - 25
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 26 through 34 )B26 - 34
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resid 35 through 47 )B35 - 47
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'B' and (resid 48 through 56 )B48 - 56
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'B' and (resid 57 through 69 )B57 - 69
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'B' and (resid 70 through 74 )B70 - 74
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'B' and (resid 75 through 95 )B75 - 95
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'B' and (resid 96 through 114 )B96 - 114
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'C' and (resid 1 through 12 )C1 - 12
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'C' and (resid 13 through 42 )C13 - 42
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'C' and (resid 43 through 47 )C43 - 47
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'C' and (resid 48 through 68 )C48 - 68
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'C' and (resid 69 through 74 )C69 - 74
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'C' and (resid 75 through 114 )C75 - 114
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'D' and (resid 1 through 12 )D1 - 12
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'D' and (resid 13 through 34 )D13 - 34
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'D' and (resid 35 through 42 )D35 - 42
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'D' and (resid 43 through 47 )D43 - 47
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'D' and (resid 48 through 68 )D48 - 68
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'D' and (resid 69 through 74 )D69 - 74
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'D' and (resid 75 through 95 )D75 - 95
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'D' and (resid 96 through 114 )D96 - 114

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る