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Yorodumi- PDB-6psd: Complex of CRACR2a with a Dynein Light Intermediate Chain Peptide -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6psd | ||||||
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Title | Complex of CRACR2a with a Dynein Light Intermediate Chain Peptide | ||||||
Components |
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Keywords | MOTOR PROTEIN / Effector | ||||||
Function / homology | Function and homology information response to histamine / store-operated calcium entry / activation of store-operated calcium channel activity / early endosome to recycling endosome transport / T-helper 1 cell differentiation / positive regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint / neutrophil degranulation / Weibel-Palade body / dynein heavy chain binding / regulation of vesicle-mediated transport ...response to histamine / store-operated calcium entry / activation of store-operated calcium channel activity / early endosome to recycling endosome transport / T-helper 1 cell differentiation / positive regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint / neutrophil degranulation / Weibel-Palade body / dynein heavy chain binding / regulation of vesicle-mediated transport / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / positive regulation of calcium ion transport / cytoplasmic dynein complex / microtubule organizing center / endosomal transport / microtubule-based movement / ficolin-1-rich granule membrane / immunological synapse / Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal / COPI-mediated anterograde transport / Mitotic Prometaphase / EML4 and NUDC in mitotic spindle formation / Resolution of Sister Chromatid Cohesion / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / MHC class II antigen presentation / secretory granule membrane / trans-Golgi network membrane / RHO GTPases Activate Formins / positive regulation of JNK cascade / HCMV Early Events / kinetochore / spindle pole / microtubule cytoskeleton organization / Aggrephagy / specific granule lumen / recycling endosome membrane / Separation of Sister Chromatids / GDP binding / endocytic vesicle membrane / protein-macromolecule adaptor activity / adaptive immune response / vesicle / microtubule / molecular adaptor activity / cytoskeleton / cell division / Golgi membrane / GTPase activity / centrosome / calcium ion binding / Neutrophil degranulation / GTP binding / RNA binding / extracellular region / ATP binding / membrane / plasma membrane / cytoplasm / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Homo sapiens (human) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SAD / Resolution: 2.66 Å | ||||||
Authors | Dominguez, R. / Lee, I.G. | ||||||
Funding support | United States, 1items
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Citation | Journal: Nat Commun / Year: 2020 Title: A tunable LIC1-adaptor interaction modulates dynein activity in a cargo-specific manner. Authors: Lee, I.G. / Cason, S.E. / Alqassim, S.S. / Holzbaur, E.L.F. / Dominguez, R. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6psd.cif.gz | 296.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6psd.ent.gz | 241.8 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6psd.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 6psd_validation.pdf.gz | 880.5 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 6psd_full_validation.pdf.gz | 891.4 KB | Display | |
Data in XML | 6psd_validation.xml.gz | 26.3 KB | Display | |
Data in CIF | 6psd_validation.cif.gz | 37.5 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ps/6psd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ps/6psd | HTTPS FTP |
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-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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