登録情報 | データベース: PDB / ID: 6p73 |
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タイトル | Cytochrome-C-nitrite reductase |
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要素 | Cytochrome c-552 |
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キーワード | OXIDOREDUCTASE / Nitrite reduction |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) / nitrite reductase (cytochrome, ammonia-forming) activity / anaerobic electron transport chain / nitrate assimilation / outer membrane-bounded periplasmic space / iron ion binding / calcium ion binding / heme binding類似検索 - 分子機能 Formate-dependent cytochrome c nitrite reductase, c552 subunit / Cytochrome c552 / Cytochrome c552 / Flavocytochrome C3; Chain A / Flavocytochrome C3; Chain A, domain 2 / Multiheme cytochrome c family profile. / Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 3 / Multiheme cytochrome superfamily / Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 / Up-down Bundle ...Formate-dependent cytochrome c nitrite reductase, c552 subunit / Cytochrome c552 / Cytochrome c552 / Flavocytochrome C3; Chain A / Flavocytochrome C3; Chain A, domain 2 / Multiheme cytochrome c family profile. / Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A, domain 3 / Multiheme cytochrome superfamily / Butyryl-CoA Dehydrogenase, subunit A; domain 3 / Up-down Bundle / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Shewanella oneidensis (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.65 Å |
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データ登録者 | Schmidt, M. / Pacheco, A. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Science Foundation (NSF, United States) | | 米国 |
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引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2019 タイトル: Trapping of a Putative Intermediate in the CytochromecNitrite Reductase (ccNiR)-Catalyzed Reduction of Nitrite: Implications for the ccNiR Reaction Mechanism. 著者: Ali, M. / Stein, N. / Mao, Y. / Shahid, S. / Schmidt, M. / Bennett, B. / Pacheco, A.A. |
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履歴 | 登録 | 2019年6月4日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2020年4月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年10月11日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn_type.id |
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