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- PDB-6p22: Photorhabdus Virulence Cassette (PVC) PAAR repeat protein Pvc10 i... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6p22
タイトルPhotorhabdus Virulence Cassette (PVC) PAAR repeat protein Pvc10 in complex with a T4 gp5 beta-helix fragment modified to mimic Pvc8, the central spike protein of PVC
要素
  • CHIMERA OF CENTRAL SPIKE PROTEINS GP5 FROM PHAGE T4 AND PVC8 FROM PVC
  • PAAR-REPEAT CENTRAL SPIKE TIP PROTEIN
キーワードVIRAL PROTEIN / PVC / Photorhabdus laumondii / membrane piercing / central spike / cell puncturing device / PAAR-repeat motif / beta helix / T4 gp5 / contractile injection system / Pvc8 / Pvc10 / hydrolase
機能・相同性
機能・相同性情報


symbiont entry into host cell via disruption of host cell wall peptidoglycan / virus tail, baseplate / viral tail assembly / symbiont entry into host / symbiont entry into host cell via disruption of host cell envelope / virus tail / peptidoglycan catabolic process / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity ...symbiont entry into host cell via disruption of host cell wall peptidoglycan / virus tail, baseplate / viral tail assembly / symbiont entry into host / symbiont entry into host cell via disruption of host cell envelope / virus tail / peptidoglycan catabolic process / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / killing of cells of another organism / defense response to bacterium / symbiont entry into host cell / identical protein binding
類似検索 - 分子機能
Contractile injection system spike tip protein / Contractile injection system spike tip protein / Gp5, C-terminal / Gp5 C-terminal repeat (3 copies) / Protein Gp5, N-terminal OB-fold domain / Pre-baseplate central spike protein Gp5 / Gp5 N-terminal OB domain / Phage tail baseplate hub (GPD) / Gp5/Type VI secretion system Vgr protein, OB-fold domain / Type VI secretion system/phage-baseplate injector OB domain ...Contractile injection system spike tip protein / Contractile injection system spike tip protein / Gp5, C-terminal / Gp5 C-terminal repeat (3 copies) / Protein Gp5, N-terminal OB-fold domain / Pre-baseplate central spike protein Gp5 / Gp5 N-terminal OB domain / Phage tail baseplate hub (GPD) / Gp5/Type VI secretion system Vgr protein, OB-fold domain / Type VI secretion system/phage-baseplate injector OB domain / Vgr protein, OB-fold domain superfamily / T4-type lysozyme / : / Glycoside hydrolase, family 24 / Phage lysozyme / Lysozyme domain superfamily / Lysozyme-like domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
9-OCTADECENOIC ACID / PALMITIC ACID / STEARIC ACID / Pre-baseplate central spike protein Gp5 / Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO1 complete genome segment 6/17 / Photorhabdus luminescens subsp. laumondii TTO1 complete genome segment 6/17
類似検索 - 構成要素
生物種Enterobacteria phage T4 (ファージ)
Photorhabdus luminescens subsp. laumondii (バクテリア)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.291 Å
データ登録者Buth, S.A. / Shneider, M.M. / Leiman, P.G.
資金援助 スイス, 1件
組織認可番号国
Swiss National Science Foundation310030_144243 スイス
引用
ジャーナル: To Be Published
タイトル: Photorhabdus Virulence Cassette (PVC) PAAR repeat protein Pvc10 in complex with a T4 gp5 beta-helix fragment modified to mimic Pvc8, the central spike protein of PVC
著者: Buth, S.A. / Shneider, M.M. / Leiman, P.G.
#1: ジャーナル: Nature / 年: 2013
タイトル: PAAR-repeat proteins sharpen and diversify the type VI secretion system spike.
著者: Shneider, M.M. / Buth, S.A. / Ho, B.T. / Basler, M. / Mekalanos, J.J. / Leiman, P.G.
#2: ジャーナル: Viruses / 年: 2015
タイトル: Structure and Biophysical Properties of a Triple-Stranded Beta-Helix Comprising the Central Spike of Bacteriophage T4.
著者: Buth, S.A. / Menin, L. / Shneider, M.M. / Engel, J. / Boudko, S.P. / Leiman, P.G.
履歴
登録2019年5月20日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02020年5月27日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12023年10月11日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn
Item: _citation.country / _database_2.pdbx_DOI ..._citation.country / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id
改定 1.22025年7月23日Group: Derived calculations / Structure summary
カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_entry_details
Item: _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms ..._chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_entry_details.has_protein_modification

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: CHIMERA OF CENTRAL SPIKE PROTEINS GP5 FROM PHAGE T4 AND PVC8 FROM PVC
B: CHIMERA OF CENTRAL SPIKE PROTEINS GP5 FROM PHAGE T4 AND PVC8 FROM PVC
C: CHIMERA OF CENTRAL SPIKE PROTEINS GP5 FROM PHAGE T4 AND PVC8 FROM PVC
D: PAAR-REPEAT CENTRAL SPIKE TIP PROTEIN
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)45,5538
ポリマ－44,7064
非ポリマー8484
水2,540141
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
  • 根拠: gel filtration
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area25840 Å2
ΔGint-77 kcal/mol
Surface area16490 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)34.305, 56.963, 222.994
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number19
Space group name H-MP212121

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要素

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タンパク質 , 2種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質 CHIMERA OF CENTRAL SPIKE PROTEINS GP5 FROM PHAGE T4 AND PVC8 FROM PVC / T4 CELL-PUNCTURING DEVICE PROTEIN GP5 / PVC CENTRAL SPIKE PROTEIN PVC8


分子量: 10011.937 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Enterobacteria phage T4 (ファージ), (組換発現) Photorhabdus luminescens subsp. laumondii (strain DSM 15139 / CIP 105565 / TT01) (バクテリア)
プラスミド: PEEVA2 / 株: DSM 15139 / CIP 105565 / TT01 / 遺伝子: plu1723 / 詳細 (発現宿主): a PET-23A DERIVATIVE / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / Variant (発現宿主): B834 / 参照: UniProt: P16009, UniProt: Q7N647, lysozyme
#2: タンパク質 PAAR-REPEAT CENTRAL SPIKE TIP PROTEIN


分子量: 14669.818 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Photorhabdus luminescens subsp. laumondii (strain DSM 15139 / CIP 105565 / TT01) (バクテリア)
株: DSM 15139 / CIP 105565 / TT01 / 遺伝子: plu1721 / Variant: TT01 / プラスミド: pATE / 詳細 (発現宿主): A PACYCDUET-1 DERIVATIVE / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / Variant (発現宿主): B834 / 参照: UniProt: Q7N648

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非ポリマー , 5種, 145分子

#3: 化合物 ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン


分子量: 24.305 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#4: 化合物 ChemComp-STE / STEARIC ACID / ステアリン酸


分子量: 284.477 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C18H36O2
#5: 化合物 ChemComp-ELA / Elaidic acid / 9-OCTADECENOIC ACID / エライジン酸


分子量: 282.461 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C18H34O2
#6: 化合物 ChemComp-PLM / PALMITIC ACID / パルミチン酸


分子量: 256.424 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C16H32O2
#7: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 141 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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詳細

Has protein modificationN
配列の詳細T4 gp5 beta helix fragment with a modified C-terminus to mimic the PluTT01m_08915 PVC central spike ...T4 gp5 beta helix fragment with a modified C-terminus to mimic the PluTT01m_08915 PVC central spike protein Pvc8. Chimera consists of a T4 gp5 fragment G484-Y565 extended by the D523-Q533 C-terminal fragment of Pvc8 protein.

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.44 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.52 %
結晶化温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 / 詳細: MPD 28-34% PEG 2000 8-18% 100 mM Imidazole pH 8.0 / PH範囲: 8

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データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06SA / 波長: 1 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2013年8月26日 / 詳細: DYNAMICALLY BENDABLE MIRROR
放射モノクロメーター: SI(111) MONOCHROMATOR / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.29→50 Å / Num. obs: 37669 / % possible obs: 99.2 % / 冗長度: 6.2 % / Biso Wilson estimate: 45.19 Å2 / CC1/2: 0.998 / Rrim(I) all: 0.125 / Net I/σ(I): 9.78
反射 シェル解像度: 2.29→2.43 Å / Mean I/σ(I) obs: 2.05 / Num. unique obs: 5838 / CC1/2: 0.95 / Rrim(I) all: 0.702 / % possible all: 96

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解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX(1.14_3260: ???)精密化
XDSMarch 30, 2013データ削減
X-GENMarch 30, 2013データスケーリング
PHASER2.5.2位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 4JJ2

4jj2


解像度: 2.291→45.213 Å / SU ML: 0.27 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.93 / 位相誤差: 25.36
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2224 1891 5.05 %
Rwork0.1819 --
obs0.184 37478 98.88 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
原子変位パラメータBiso mean: 49.2 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.291→45.213 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数3084 0 59 141 3284
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0023186
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.4834311
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d11.1861898
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.051508
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.003559
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
2.2907-2.34790.32861200.28122238X-RAY DIFFRACTION90
2.3479-2.41140.34921360.26452552X-RAY DIFFRACTION99
2.4114-2.48240.25351350.26212607X-RAY DIFFRACTION99
2.4824-2.56250.27461400.24812553X-RAY DIFFRACTION100
2.5625-2.65410.2591360.23032574X-RAY DIFFRACTION100
2.6541-2.76030.32251370.2272517X-RAY DIFFRACTION100
2.7603-2.88590.28371390.21872616X-RAY DIFFRACTION100
2.8859-3.0380.2491360.20342537X-RAY DIFFRACTION100
3.038-3.22830.23961340.18952560X-RAY DIFFRACTION100
3.2283-3.47750.22111420.16282599X-RAY DIFFRACTION100
3.4775-3.82730.20821360.1412556X-RAY DIFFRACTION99
3.8273-4.38070.18391350.14392578X-RAY DIFFRACTION100
4.3807-5.51770.13911340.13542532X-RAY DIFFRACTION99
5.5177-45.22210.22571310.19072568X-RAY DIFFRACTION100
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
11.24960.0374-0.24870.152-0.19040.2670.35370.5836-0.5301-0.4257-0.3088-0.22140.4071-0.2247-0.00750.7132-0.0648-0.04320.67060.09560.43136.213267.958218.6718
20.1361-0.01350.13530.0020.02060.2825-0.14910.69510.2873-0.28010.0427-0.0070.01020.1845-0.00080.4639-0.1102-0.07740.42690.05620.4847-1.050563.520930.1664
30.61660.4451-0.09940.66860.54971.1172-0.19030.2350.0129-0.27640.11330.33060.1371-0.0688-0.00050.297-0.0099-0.03890.29640.03870.40194.282165.968242.5752
40.46660.25690.35790.63810.2950.2951-0.1380.05620.3789-0.21140.17220.3877-0.0544-0.14560.00010.2201-0.01330.02620.2607-0.00710.3335.231268.07355.429
50.2732-0.23580.06950.2923-0.04880.1573-0.1309-0.18660.10530.07360.07990.1490.075-0.060700.3734-0.0199-0.0130.3061-0.02310.365515.574467.904262.5276
60.207-0.17320.19340.141-0.16110.2010.27120.28040.1207-0.671-0.10220.16510.54130.30790.00040.5181-0.0783-0.04110.51710.03870.46637.038762.706672.7665
73.336-0.0197-0.5240.5410.65590.85940.01620.80120.3542-0.29570.12350.0222-0.077-0.23390.1740.5161-0.1869-0.06150.59290.05140.31451.335665.557224.1815
80.16860.0838-0.2790.2664-0.30790.5863-0.40360.3412-0.0543-0.12770.21360.21140.27610.0576-0.02370.4503-0.0799-0.03080.43440.00250.5019-0.53660.540335.6133
90.20320.25140.24540.43110.2110.3444-0.15770.1520.1739-0.11710.09910.1923-0.0833-0.0380.00010.327-0.0184-0.03310.43320.05280.44143.218669.15345.0304
100.4715-0.1888-0.4040.3958-0.18650.697-0.0032-0.16270.02780.0315-0.10840.23110.03870.0081-0.00010.22160.0084-0.02660.2351-0.02110.324811.602367.003553.3428
110.2905-0.3264-0.21420.43540.41950.55650.40280.1691-0.2644-0.0909-0.20460.19730.0305-0.1451-00.32390.0281-0.0480.3560.02930.373110.431960.61464.1728
120.10310.02760.12560.21720.09350.20750.10980.26910.3755-0.0422-0.11360.3965-0.4155-0.06420.00090.46720.0158-0.00280.3107-0.03810.390413.765572.964770.6334
131.1683-0.6476-1.96640.7041.15813.3233-0.22360.2812-0.15990.2672-0.0594-0.17590.5139-0.6557-0.28210.4009-0.198-0.16870.6750.05670.5431-5.052676.254521.8569
140.4217-0.2574-0.20210.427-0.20420.4628-0.1470.19120.1509-0.73430.19710.1636-0.04410.0007-0.01250.5227-0.0608-0.08020.4664-0.01720.38070.445562.163626.9656
150.2274-0.16050.01620.38130.38770.5867-0.18730.4219-0.0282-0.46950.2833-0.24230.2717-0.4360.00020.4527-0.0396-0.0540.50690.04510.5336-3.118269.50637.7142
160.8764-0.40320.25120.49370.28580.5603-0.18520.0643-0.0673-0.21760.20820.34420.0023-0.1515-0.00030.3772-0.0462-0.00630.35880.00310.36168.358466.71444.0538
170.54320.2731-0.1980.41940.28220.5982-0.278-0.5079-0.30330.17460.1710.10040.03490.0452-0.00240.30780.01820.00620.312-0.02110.42438.337561.413554.9301
180.2983-0.0986-0.1970.1454-0.18250.64980.06770.11980.25280.40270.0459-0.1322-0.0771-0.0282-0.00060.36030.0065-0.00130.3901-0.0170.371311.621866.019766.7684
190.0062-0.03930.00880.2272-0.01310.0505-0.26170.15670.4422-0.15580.14950.663-0.3948-0.4890.00040.50640.0402-0.02730.4997-0.02430.324512.851867.323187.0178
200.9725-0.02480.57790.76550.79851.190.0399-0.186-0.01970.21510.02120.0527-0.2623-0.5138-0.00010.5344-0.0179-0.01670.4219-0.03480.349619.192268.911792.212
210.0784-0.02760.0690.0293-0.02580.0605-0.0974-0.5008-0.0239-0.26870.3391-0.8250.30290.3369-0.00040.5787-0.03690.0140.5258-0.01330.443626.353366.441789.8684
220.5864-0.17060.61690.0468-0.17620.64110.0981-0.32150.10340.306-0.00650.12460.2886-0.25320.00010.6237-0.0501-0.05580.4550.01610.294622.739664.057999.3978
230.34910.0065-0.05930.08670.22780.59270.0243-0.24310.03050.0282-0.1751-0.07310.130.1845-0.00010.4336-0.031-0.06750.49950.02650.330421.876662.353691.791
240.00150.03010.10660.09950.29211.06580.1608-0.4629-0.13680.21140.13840.07580.2057-0.62780.01670.6082-0.0015-0.02260.5288-0.04450.331220.461263.9841101.3959
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 483 through 491 )
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 492 through 511 )
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 512 through 536 )
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 537 through 553 )
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 554 through 567 )
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 568 through 576 )
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resid 484 through 503 )
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resid 504 through 518 )
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resid 519 through 536 )
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 537 through 553 )
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resid 554 through 567 )
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'B' and (resid 568 through 576 )
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'C' and (resid 483 through 488 )
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'C' and (resid 489 through 506 )
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'C' and (resid 507 through 519 )
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'C' and (resid 520 through 537 )
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'C' and (resid 538 through 553 )
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'C' and (resid 554 through 576 )
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'D' and (resid 2 through 13 )
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'D' and (resid 14 through 49 )
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'D' and (resid 50 through 53 )
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'D' and (resid 54 through 86 )
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'D' and (resid 87 through 107 )
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'D' and (resid 108 through 138 )

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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