PDB-6p02: Crystal structure of Mtb aspartate decarboxylase, 6-Chlorine pyra...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB / ID: 6p02
• タイトル: Crystal structure of Mtb aspartate decarboxylase, 6-Chlorine pyrazinoic acid complex

要素

• Aspartate 1-decarboxylase alpha chain
• Aspartate 1-decarboxylase beta chain

• キーワード: LYASE / active / 6-Cl-POA / complex / Structural Genomics / TB Structural Genomics Consortium / TBSGC

機能・相同性

分子機能:

alanine biosynthetic process / aspartate 1-decarboxylase / aspartate 1-decarboxylase activity / pantothenate biosynthetic process / peptidoglycan-based cell wall / cytosol

ドメイン・相同性:

Aspartate decarboxylase / Aspartate decarboxylase / Barwin-like endoglucanases - #20 / Barwin-like endoglucanases / Aspartate decarboxylase-like domain superfamily / Beta Barrel / Mainly Beta

構成要素:

6-chloropyrazine-2-carboxylic acid / Aspartate 1-decarboxylase

• 生物種: Mycobacterium tuberculosis (結核菌)
• 手法: X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.25 Å
• データ登録者: Sun, Q. / Li, X. / Sacchettini, J.C. / TB Structural Genomics Consortium (TBSGC)

資金援助

米国, 2件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	P01AI095208	米国
Welch Foundation	A-0015	米国

• 引用: ジャーナル: Nat Commun / 年: 2020; タイトル: The molecular basis of pyrazinamide activity on Mycobacterium tuberculosis PanD.; 著者: Sun, Q. / Li, X. / Perez, L.M. / Shi, W. / Zhang, Y. / Sacchettini, J.C.

履歴

登録	2019年5月16日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2020年2月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年10月11日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
改定 2.0	2023年11月15日	Group: Atomic model / Data collection / Derived calculations カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_validate_main_chain_plane / pdbx_validate_rmsd_angle / struct_conn Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id

集合体

登録構造単位

A: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

B: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

C: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

D: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

E: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

F: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

G: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

H: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

I: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

J: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

K: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

L: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

M: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

N: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

O: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

P: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

Q: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

R: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

S: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

T: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

U: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

V: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

W: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

X: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

ヘテロ分子

概要:

• 194 kDa, 24 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	193,580	36
ポリマ－	191,677	24
非ポリマー	1,903	12
水	126	7

1

A: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

B: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

C: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

D: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

E: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

F: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

G: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

H: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 根拠: gel filtration
• 64.5 kDa, 8 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	64,527	12
ポリマ－	63,892	8
非ポリマー	634	4
水	36	2

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	23570 Å2
ΔGint	-114 kcal/mol
Surface area	16020 Å2
手法	PISA

2

I: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

J: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

K: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

L: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

M: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

N: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

O: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

P: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 根拠: gel filtration
• 64.5 kDa, 8 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	64,527	12
ポリマ－	63,892	8
非ポリマー	634	4
水	36	2

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	23390 Å2
ΔGint	-116 kcal/mol
Surface area	16130 Å2
手法	PISA

3

Q: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

R: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

S: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

T: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

U: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

V: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

W: Aspartate 1-decarboxylase beta chain

X: Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

ヘテロ分子

概要:

• 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
• 根拠: gel filtration
• 64.5 kDa, 8 ポリマー

構成要素の詳細:

	分子量 (理論値)	分子数
合計 (水以外)	64,527	12
ポリマ－	63,892	8
非ポリマー	634	4
水	18	1

対称操作:

タイプ	名称	対称操作	数
identity operation	1_555	x,y,z	1

計算値:

Buried area	23460 Å2
ΔGint	-118 kcal/mol
Surface area	16130 Å2
手法	PISA

単位格子

Length a, b, c (Å)	143.679, 143.679, 59.838
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	144
Space group name H-M	P31

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	C
1	2	A
2	2	E
1	3	A
2	3	G
1	4	A
2	4	I
1	5	A
2	5	K
1	6	A
2	6	M
1	7	A
2	7	O
1	8	A
2	8	Q
1	9	A
2	9	S
1	10	A
2	10	U
1	11	A
2	11	W
1	12	B
2	12	D
1	13	B
2	13	F
1	14	B
2	14	H
1	15	B
2	15	J
1	16	B
2	16	L
1	17	B
2	17	N
1	18	B
2	18	P
1	19	B
2	19	R
1	20	B
2	20	T
1	21	B
2	21	V
1	22	B
2	22	X
1	23	C
2	23	E
1	24	C
2	24	G
1	25	C
2	25	I
1	26	C
2	26	K
1	27	C
2	27	M
1	28	C
2	28	O
1	29	C
2	29	Q
1	30	C
2	30	S
1	31	C
2	31	U
1	32	C
2	32	W
1	33	D
2	33	F
1	34	D
2	34	H
1	35	D
2	35	J
1	36	D
2	36	L
1	37	D
2	37	N
1	38	D
2	38	P
1	39	D
2	39	R
1	40	D
2	40	T
1	41	D
2	41	V
1	42	D
2	42	X
1	43	E
2	43	G
1	44	E
2	44	I
1	45	E
2	45	K
1	46	E
2	46	M
1	47	E
2	47	O
1	48	E
2	48	Q
1	49	E
2	49	S
1	50	E
2	50	U
1	51	E
2	51	W
1	52	F
2	52	H
1	53	F
2	53	J
1	54	F
2	54	L
1	55	F
2	55	N
1	56	F
2	56	P
1	57	F
2	57	R
1	58	F
2	58	T
1	59	F
2	59	V
1	60	F
2	60	X
1	61	G
2	61	I
1	62	G
2	62	K
1	63	G
2	63	M
1	64	G
2	64	O
1	65	G
2	65	Q
1	66	G
2	66	S
1	67	G
2	67	U
1	68	G
2	68	W
1	69	H
2	69	J
1	70	H
2	70	L
1	71	H
2	71	N
1	72	H
2	72	P
1	73	H
2	73	R
1	74	H
2	74	T
1	75	H
2	75	V
1	76	H
2	76	X
1	77	I
2	77	K
1	78	I
2	78	M
1	79	I
2	79	O
1	80	I
2	80	Q
1	81	I
2	81	S
1	82	I
2	82	U
1	83	I
2	83	W
1	84	J
2	84	L
1	85	J
2	85	N
1	86	J
2	86	P
1	87	J
2	87	R
1	88	J
2	88	T
1	89	J
2	89	V
1	90	J
2	90	X
1	91	K
2	91	M
1	92	K
2	92	O
1	93	K
2	93	Q
1	94	K
2	94	S
1	95	K
2	95	U
1	96	K
2	96	W
1	97	L
2	97	N
1	98	L
2	98	P
1	99	L
2	99	R
1	100	L
2	100	T
1	101	L
2	101	V
1	102	L
2	102	X
1	103	M
2	103	O
1	104	M
2	104	Q
1	105	M
2	105	S
1	106	M
2	106	U
1	107	M
2	107	W
1	108	N
2	108	P
1	109	N
2	109	R
1	110	N
2	110	T
1	111	N
2	111	V
1	112	N
2	112	X
1	113	O
2	113	Q
1	114	O
2	114	S
1	115	O
2	115	U
1	116	O
2	116	W
1	117	P
2	117	R
1	118	P
2	118	T
1	119	P
2	119	V
1	120	P
2	120	X
1	121	Q
2	121	S
1	122	Q
2	122	U
1	123	Q
2	123	W
1	124	R
2	124	T
1	125	R
2	125	V
1	126	R
2	126	X
1	127	S
2	127	U
1	128	S
2	128	W
1	129	T
2	129	V
1	130	T
2	130	X
1	131	U
2	131	W
1	132	V
2	132	X

NCSドメイン領域:

Component-ID: _ / Refine code: _

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	1	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
1	2	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	2	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
1	3	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	3	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
1	4	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	4	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
1	5	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	5	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
1	6	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	6	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
1	7	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	7	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
1	8	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	8	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
1	9	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	9	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	10	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	10	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	11	MET	MET	GLY	GLY	A	A	1 - 24	1 - 24
2	11	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	12	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	12	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
1	13	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	13	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
1	14	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	14	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
1	15	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	15	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
1	16	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	16	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
1	17	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	17	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
1	18	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	18	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
1	19	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	19	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
1	20	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	20	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	21	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	21	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	22	VAL	VAL	ILE	ILE	B	B	26 - 115	2 - 91
2	22	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	23	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	23	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
1	24	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	24	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
1	25	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	25	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
1	26	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	26	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
1	27	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	27	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
1	28	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	28	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
1	29	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	29	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
1	30	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	30	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	31	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	31	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	32	MET	MET	GLY	GLY	C	C	1 - 24	1 - 24
2	32	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	33	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	33	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
1	34	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	34	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
1	35	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	35	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
1	36	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	36	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
1	37	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	37	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
1	38	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	38	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
1	39	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	39	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
1	40	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	40	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	41	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	41	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	42	VAL	VAL	ILE	ILE	D	D	26 - 115	2 - 91
2	42	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	43	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	43	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
1	44	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	44	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
1	45	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	45	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
1	46	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	46	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
1	47	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	47	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
1	48	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	48	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
1	49	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	49	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	50	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	50	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	51	MET	MET	GLY	GLY	E	E	1 - 24	1 - 24
2	51	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	52	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	52	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
1	53	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	53	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
1	54	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	54	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
1	55	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	55	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
1	56	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	56	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
1	57	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	57	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
1	58	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	58	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	59	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	59	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	60	VAL	VAL	ILE	ILE	F	F	26 - 115	2 - 91
2	60	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	61	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
2	61	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
1	62	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
2	62	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
1	63	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
2	63	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
1	64	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
2	64	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
1	65	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
2	65	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
1	66	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
2	66	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	67	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
2	67	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	68	MET	MET	GLY	GLY	G	G	1 - 24	1 - 24
2	68	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	69	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
2	69	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
1	70	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
2	70	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
1	71	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
2	71	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
1	72	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
2	72	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
1	73	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
2	73	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
1	74	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
2	74	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	75	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
2	75	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	76	VAL	VAL	ILE	ILE	H	H	26 - 115	2 - 91
2	76	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	77	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
2	77	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
1	78	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
2	78	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
1	79	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
2	79	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
1	80	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
2	80	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
1	81	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
2	81	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	82	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
2	82	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	83	MET	MET	GLY	GLY	I	I	1 - 24	1 - 24
2	83	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	84	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
2	84	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
1	85	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
2	85	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
1	86	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
2	86	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
1	87	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
2	87	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
1	88	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
2	88	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	89	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
2	89	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	90	VAL	VAL	ILE	ILE	J	J	26 - 115	2 - 91
2	90	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	91	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
2	91	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
1	92	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
2	92	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
1	93	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
2	93	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
1	94	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
2	94	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	95	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
2	95	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	96	MET	MET	GLY	GLY	K	K	1 - 24	1 - 24
2	96	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	97	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
2	97	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
1	98	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
2	98	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
1	99	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
2	99	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
1	100	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
2	100	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	101	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
2	101	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	102	VAL	VAL	ILE	ILE	L	L	26 - 115	2 - 91
2	102	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	103	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
2	103	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
1	104	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
2	104	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
1	105	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
2	105	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	106	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
2	106	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	107	MET	MET	GLY	GLY	M	M	1 - 24	1 - 24
2	107	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	108	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
2	108	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
1	109	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
2	109	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
1	110	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
2	110	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	111	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
2	111	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	112	VAL	VAL	ILE	ILE	N	N	26 - 115	2 - 91
2	112	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	113	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
2	113	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
1	114	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
2	114	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	115	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
2	115	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	116	MET	MET	GLY	GLY	O	O	1 - 24	1 - 24
2	116	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	117	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
2	117	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
1	118	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
2	118	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	119	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
2	119	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	120	VAL	VAL	ILE	ILE	P	P	26 - 115	2 - 91
2	120	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	121	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
2	121	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
1	122	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
2	122	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	123	MET	MET	GLY	GLY	Q	Q	1 - 24	1 - 24
2	123	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	124	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
2	124	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
1	125	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
2	125	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	126	VAL	VAL	ILE	ILE	R	R	26 - 115	2 - 91
2	126	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	127	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
2	127	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
1	128	MET	MET	GLY	GLY	S	S	1 - 24	1 - 24
2	128	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	129	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
2	129	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
1	130	VAL	VAL	ILE	ILE	T	T	26 - 115	2 - 91
2	130	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91
1	131	MET	MET	GLY	GLY	U	U	1 - 24	1 - 24
2	131	MET	MET	GLY	GLY	W	W	1 - 24	1 - 24
1	132	VAL	VAL	ILE	ILE	V	V	26 - 115	2 - 91
2	132	VAL	VAL	ILE	ILE	X	X	26 - 115	2 - 91

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132

要素

#1: タンパク質・ペプチド

A C E G I K M O Q S U W
Aspartate 1-decarboxylase beta chain

詳細:

分子量: 2751.341 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (結核菌)
株: ATCC 25618 / H37Rv / 遺伝子: panD, Rv3601c, MTCY07H7B.21 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P9WIL3

#2: タンパク質

B D F H J L N P R T V X
Aspartate 1-decarboxylase alpha chain

詳細:

分子量: 13221.777 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (結核菌)
株: ATCC 25618 / H37Rv / 遺伝子: panD, Rv3601c, MTCY07H7B.21 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P9WIL3, aspartate 1-decarboxylase

#3: 化合物

B-201 D-201 F-201 H-201 J-201 L-201 N-201 P-201 R-201 T-201 V-201 X-201
ChemComp-NMJ / 6-chloropyrazine-2-carboxylic acid / 6-クロロピラジン-2-カルボン酸

詳細:

分子量: 158.543 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₅H₃ClN₂O₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION

#4: 水

ChemComp-HOH / water

詳細:

分子量: 18.015 Da / 分子数: 7 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

実験情報

実験

• 実験: 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

試料調製

• 結晶: マシュー密度: 1.86 ų/Da / 溶媒含有率: 33.88 %
• 結晶化: 温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 / 詳細: MES, HEPES, PEG 3350, Ammonium Chloride / PH範囲: 6.5-7

データ収集

• 回折: 平均測定温度: 130 K / Serial crystal experiment: N
• 放射光源: 由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 23-ID-D / 波長: 1.033 Å
• 検出器: タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年11月15日
• 放射: プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
• 放射波長: 波長: 1.033 Å / 相対比: 1

Reflection twin

Crystal-ID	ID	Operator	Domain-ID	Fraction
1	1	H, K, L	1	0.086
1	1	-h,-k,l	2	0.074
1	1	K, H, -L	3	0.483
1	1	-K, -H, -L	4	0.357

• 反射: 解像度: 2.25→21.89 Å / Num. obs: 65250 / % possible obs: 99.53 % / 冗長度: 5.7 % / CC_1/2: 0.993 / Net I/σ(I): 8.03
• 反射 シェル: 解像度: 2.25→2.33 Å / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / Num. unique obs: 6314 / CC_1/2: 0.625 / % possible all: 96.47

解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0232	精密化
PROTEUM PLUS		データ削減
PROTEUM PLUS		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 2C45

2c45

解像度: 2.25→21.89 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.973 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.962 / SU B: 2.63 / SU ML: 0.071 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.048 / ESU R Free: 0.033 / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	Rfactor	反射数	%反射	Selection details
Rfree	0.16442	3466	5.3 %	RANDOM
Rwork	0.13384	-	-	-
obs	0.13543	61782	99.51 %	-

• 溶媒の処理: イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 51.156 Ų

	Baniso -1	Baniso -2	Baniso -3
1-	6.71 Å2	0 Å2	0 Å2
2-	-	6.71 Å2	0 Å2
3-	-	-	-13.42 Å2

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 2.25→21.89 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	10416	0	120	7	10543

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.013	0.013	10668
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.017	10248
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.606	1.658	14460
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.401	1.592	23484
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.493	5	1344
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	30.615	21.163	516
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.583	15	1728
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	17.045	15	84
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.073	0.2	1500
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.008	0.02	12036
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.003	0.02	2172
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	6.361	5.13	5448
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	6.357	5.13	5447
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	7.908	7.661	6768
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other	7.907	7.662	6769
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	7.249	5.866	5220
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other	7.249	5.866	5221
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other	9.587	8.584	7693
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	10.768		20682
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other	10.768		20683
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	518	0.07
1	2	C	518	0.07
2	1	A	516	0.09
2	2	E	516	0.09
3	1	A	521	0.03
3	2	G	521	0.03
4	1	A	521	0.06
4	2	I	521	0.06
5	1	A	519	0.08
5	2	K	519	0.08
6	1	A	512	0.09
6	2	M	512	0.09
7	1	A	520	0.03
7	2	O	520	0.03
8	1	A	527	0.01
8	2	Q	527	0.01
9	1	A	519	0.07
9	2	S	519	0.07
10	1	A	520	0.07
10	2	U	520	0.07
11	1	A	518	0.05
11	2	W	518	0.05
12	1	B	2460	0.09
12	2	D	2460	0.09
13	1	B	2468	0.1
13	2	F	2468	0.1
14	1	B	2509	0.07
14	2	H	2509	0.07
15	1	B	2544	0.05
15	2	J	2544	0.05
16	1	B	2478	0.08
16	2	L	2478	0.08
17	1	B	2475	0.09
17	2	N	2475	0.09
18	1	B	2502	0.08
18	2	P	2502	0.08
19	1	B	2532	0.05
19	2	R	2532	0.05
20	1	B	2462	0.08
20	2	T	2462	0.08
21	1	B	2481	0.09
21	2	V	2481	0.09
22	1	B	2505	0.07
22	2	X	2505	0.07
23	1	C	514	0.09
23	2	E	514	0.09
24	1	C	521	0.07
24	2	G	521	0.07
25	1	C	514	0.09
25	2	I	514	0.09
26	1	C	529	0.03
26	2	K	529	0.03
27	1	C	507	0.1
27	2	M	507	0.1
28	1	C	519	0.08
28	2	O	519	0.08
29	1	C	518	0.07
29	2	Q	518	0.07
30	1	C	522	0.02
30	2	S	522	0.02
31	1	C	522	0.08
31	2	U	522	0.08
32	1	C	518	0.07
32	2	W	518	0.07
33	1	D	2472	0.1
33	2	F	2472	0.1
34	1	D	2508	0.06
34	2	H	2508	0.06
35	1	D	2463	0.09
35	2	J	2463	0.09
36	1	D	2537	0.05
36	2	L	2537	0.05
37	1	D	2464	0.09
37	2	N	2464	0.09
38	1	D	2514	0.07
38	2	P	2514	0.07
39	1	D	2488	0.08
39	2	R	2488	0.08
40	1	D	2537	0.04
40	2	T	2537	0.04
41	1	D	2487	0.08
41	2	V	2487	0.08
42	1	D	2515	0.06
42	2	X	2515	0.06
43	1	E	515	0.08
43	2	G	515	0.08
44	1	E	509	0.11
44	2	I	509	0.11
45	1	E	516	0.09
45	2	K	516	0.09
46	1	E	516	0.05
46	2	M	516	0.05
47	1	E	514	0.09
47	2	O	514	0.09
48	1	E	515	0.09
48	2	Q	515	0.09
49	1	E	509	0.09
49	2	S	509	0.09
50	1	E	521	0.04
50	2	U	521	0.04
51	1	E	514	0.1
51	2	W	514	0.1
52	1	F	2488	0.09
52	2	H	2488	0.09
53	1	F	2477	0.1
53	2	J	2477	0.1
54	1	F	2487	0.09
54	2	L	2487	0.09
55	1	F	2549	0.06
55	2	N	2549	0.06
56	1	F	2499	0.09
56	2	P	2499	0.09
57	1	F	2474	0.1
57	2	R	2474	0.1
58	1	F	2484	0.1
58	2	T	2484	0.1
59	1	F	2562	0.06
59	2	V	2562	0.06
60	1	F	2508	0.09
60	2	X	2508	0.09
61	1	G	517	0.07
61	2	I	517	0.07
62	1	G	522	0.08
62	2	K	522	0.08
63	1	G	512	0.09
63	2	M	512	0.09
64	1	G	528	0.04
64	2	O	528	0.04
65	1	G	523	0.02
65	2	Q	523	0.02
66	1	G	516	0.08
66	2	S	516	0.08
67	1	G	525	0.07
67	2	U	525	0.07
68	1	G	522	0.06
68	2	W	522	0.06
69	1	H	2504	0.07
69	2	J	2504	0.07
70	1	H	2523	0.05
70	2	L	2523	0.05
71	1	H	2492	0.09
71	2	N	2492	0.09
72	1	H	2572	0.04
72	2	P	2572	0.04
73	1	H	2529	0.06
73	2	R	2529	0.06
74	1	H	2507	0.06
74	2	T	2507	0.06
75	1	H	2513	0.07
75	2	V	2513	0.07
76	1	H	2570	0.03
76	2	X	2570	0.03
77	1	I	515	0.1
77	2	K	515	0.1
78	1	I	509	0.11
78	2	M	509	0.11
79	1	I	517	0.07
79	2	O	517	0.07
80	1	I	519	0.06
80	2	Q	519	0.06
81	1	I	515	0.09
81	2	S	515	0.09
82	1	I	516	0.1
82	2	U	516	0.1
83	1	I	516	0.08
83	2	W	516	0.08
84	1	J	2483	0.08
84	2	L	2483	0.08
85	1	J	2476	0.09
85	2	N	2476	0.09
86	1	J	2505	0.08
86	2	P	2505	0.08
87	1	J	2542	0.05
87	2	R	2542	0.05
88	1	J	2469	0.08
88	2	T	2469	0.08
89	1	J	2492	0.08
89	2	V	2492	0.08
90	1	J	2511	0.07
90	2	X	2511	0.07
91	1	K	511	0.1
91	2	M	511	0.1
92	1	K	519	0.08
92	2	O	519	0.08
93	1	K	519	0.07
93	2	Q	519	0.07
94	1	K	524	0.03
94	2	S	524	0.03
95	1	K	523	0.08
95	2	U	523	0.08
96	1	K	521	0.08
96	2	W	521	0.08
97	1	L	2483	0.08
97	2	N	2483	0.08
98	1	L	2530	0.05
98	2	P	2530	0.05
99	1	L	2505	0.07
99	2	R	2505	0.07
100	1	L	2526	0.04
100	2	T	2526	0.04
101	1	L	2496	0.07
101	2	V	2496	0.07
102	1	L	2533	0.04
102	2	X	2533	0.04
103	1	M	512	0.1
103	2	O	512	0.1
104	1	M	511	0.09
104	2	Q	511	0.09
105	1	M	509	0.09
105	2	S	509	0.09
106	1	M	516	0.05
106	2	U	516	0.05
107	1	M	509	0.1
107	2	W	509	0.1
108	1	N	2510	0.08
108	2	P	2510	0.08
109	1	N	2473	0.1
109	2	R	2473	0.1
110	1	N	2483	0.09
110	2	T	2483	0.09
111	1	N	2550	0.06
111	2	V	2550	0.06
112	1	N	2499	0.08
112	2	X	2499	0.08
113	1	O	522	0.03
113	2	Q	522	0.03
114	1	O	514	0.08
114	2	S	514	0.08
115	1	O	522	0.08
115	2	U	522	0.08
116	1	O	520	0.04
116	2	W	520	0.04
117	1	P	2529	0.07
117	2	R	2529	0.07
118	1	P	2509	0.06
118	2	T	2509	0.06
119	1	P	2518	0.08
119	2	V	2518	0.08
120	1	P	2576	0.04
120	2	X	2576	0.04
121	1	Q	516	0.07
121	2	S	516	0.07
122	1	Q	522	0.07
122	2	U	522	0.07
123	1	Q	518	0.05
123	2	W	518	0.05
124	1	R	2484	0.08
124	2	T	2484	0.08
125	1	R	2491	0.09
125	2	V	2491	0.09
126	1	R	2532	0.06
126	2	X	2532	0.06
127	1	S	517	0.08
127	2	U	517	0.08
128	1	S	517	0.07
128	2	W	517	0.07
129	1	T	2488	0.08
129	2	V	2488	0.08
130	1	T	2517	0.06
130	2	X	2517	0.06
131	1	U	520	0.09
131	2	W	520	0.09
132	1	V	2520	0.07
132	2	X	2520	0.07

LS精密化 シェル

解像度: 2.25→2.308 Å / Total num. of bins used: 20

	Rfactor	反射数	%反射
Rfree	0.296	208	-
Rwork	0.221	4399	-
obs	-	-	94.91 %