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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6owd | ||||||
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タイトル | Arginine Containing Reengineered Coiled-Coiled Dimer to Examine the Impact of Proximal Cation Identity on Hydrophobically-Driven Assembly | ||||||
![]() | R+7 | ||||||
![]() | DE NOVO PROTEIN / Parallel coiled-coil / Dimer / De novo peptide | ||||||
生物種 | synthetic construct (人工物) | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Biok, N.A. / Bingman, C.A. / Gellman, S.H. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Retention of Coiled-Coil Dimer Formation in the Absence of Ion Pairing at Positions Flanking the Hydrophobic Core. 著者: Biok, N.A. / Passow, A.D. / Wang, C. / Bingman, C.A. / Abbott, N.L. / Gellman, S.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 26.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 4dzmS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3544.177 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物) #2: 化合物 | ChemComp-CL / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.93 Å3/Da / 溶媒含有率: 36.35 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: No salt, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 3.0 M sodium chloride |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS EIGER X 9M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年2月17日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.1272 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.5→36.59 Å / Num. obs: 8381 / % possible obs: 95 % / 冗長度: 6.7 % / Biso Wilson estimate: 32.74 Å2 / CC1/2: 0.997 / Rmerge(I) obs: 0.1088 / Rpim(I) all: 0.04586 / Rrim(I) all: 0.1184 / Net I/σ(I): 12.09 |
反射 シェル | 解像度: 1.5→1.554 Å / 冗長度: 7 % / Rmerge(I) obs: 1.003 / Mean I/σ(I) obs: 1.34 / Num. unique obs: 808 / CC1/2: 0.424 / Rpim(I) all: 0.4111 / Rrim(I) all: 1.086 / % possible all: 93.73 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 4DZM 解像度: 1.5→36.59 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE
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原子変位パラメータ | Biso mean: 36.62 Å2 | ||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.5→36.59 Å
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