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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6h7v | ||||||
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タイトル | Crystal structure of BauA, the Ferric preacinetobactin receptor from Acinetobacter baumannii | ||||||
![]() | Ligand-gated channel protein | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / BauA / outer-membrane transporter | ||||||
機能・相同性 | ![]() : / siderophore uptake transmembrane transporter activity / cell outer membrane / signaling receptor activity / membrane => GO:0016020 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Moynie, L. / Naismith, J.H. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Preacinetobactin not acinetobactin is essential for iron uptake by the BauA transporter of the pathogenAcinetobacter baumannii. 著者: Moynie, L. / Serra, I. / Scorciapino, M.A. / Oueis, E. / Page, M.G. / Ceccarelli, M. / Naismith, J.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 770.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 663.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 2.3 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 2.3 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 68.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 95.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域:
NCSアンサンブル:
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 76892.383 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: ATCC 19606 / DSM 30007 / CIP 70.34 / JCM 6841 / NBRC 109757 / NCIMB 12457 / NCTC 12156 / 81 遺伝子: BIT33_06105, HMPREF0010_02301 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-EDO / #3: 化合物 | ChemComp-C8E / ( #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.59 Å3/Da / 溶媒含有率: 73.22 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: PEG 8000, Hepes, KCl, ethylene glycol |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年11月29日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.97957 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.54→139.53 Å / Num. obs: 130065 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 15.2 % / Rmerge(I) obs: 0.12 / Net I/σ(I): 19.3 |
反射 シェル | 解像度: 2.54→2.61 Å / 冗長度: 14.1 % / Rmerge(I) obs: 0.789 / Mean I/σ(I) obs: 3.8 / Num. unique obs: 9607 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 43.41 Å2
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精密化ステップ | サイクル: 1 / 解像度: 2.54→139.53 Å
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拘束条件 |
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