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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6fs4 | ||||||
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タイトル | NMR structure of Casocidin-II antimicrobial peptide in 60% TFE | ||||||
![]() | Alpha-S2-casein | ||||||
![]() | ANTIMICROBIAL PROTEIN / Antimicrobial peptide / TFE | ||||||
機能・相同性 | ![]() response to dehydroepiandrosterone / response to 11-deoxycorticosterone / zymogen binding / response to growth hormone / response to progesterone / Golgi lumen / response to estradiol / defense response to bacterium / Golgi apparatus / protein homodimerization activity / extracellular space 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Mercurio, F.A. / Leone, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The antimicrobial peptides casocidins I and II: Solution structural studies in water and different membrane-mimetic environments. 著者: Mercurio, F.A. / Scaloni, A. / Caira, S. / Leone, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 257.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 219.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 423.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 537.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 20 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 6fs5C C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3864.535 Da / 分子数: 1 / 断片: Residues 166-196 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 | タイプ: solution / 内容: 1.2 mM Casocidin II, trifluoroethanol/water / Label: TFE60 / 溶媒系: trifluoroethanol/water |
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試料 | 濃度: 1.2 mM / 構成要素: Casocidin II / Isotopic labeling: natural abundance |
試料状態 | イオン強度: null Not defined / Label: condition_1 / pH: 2.8 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITY / 製造業者: Varian / モデル: UNITY / 磁場強度: 600 MHz / 詳細: Cold probe |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 2 | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: target function | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |