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Yorodumi- PDB-6fp6: Complex of human Cu,Zn SOD1 with the human copper chaperone for S... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6fp6 | ||||||||||||||||||
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Title | Complex of human Cu,Zn SOD1 with the human copper chaperone for SOD1 in a compact conformation | ||||||||||||||||||
Components |
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Keywords | METAL BINDING PROTEIN / heterodimer / copper-chaperone / hSOD1 / protein maturation | ||||||||||||||||||
Function / homology | Function and homology information protein maturation by copper ion transfer / superoxide dismutase copper chaperone activity / action potential initiation / neurofilament cytoskeleton organization / positive regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway / protein phosphatase 2B binding / regulation of organ growth / relaxation of vascular associated smooth muscle / response to superoxide / retrograde axonal transport ...protein maturation by copper ion transfer / superoxide dismutase copper chaperone activity / action potential initiation / neurofilament cytoskeleton organization / positive regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway / protein phosphatase 2B binding / regulation of organ growth / relaxation of vascular associated smooth muscle / response to superoxide / retrograde axonal transport / anterograde axonal transport / peripheral nervous system myelin maintenance / regulation of protein kinase activity / regulation of T cell differentiation in thymus / retina homeostasis / superoxide anion generation / negative regulation of cholesterol biosynthetic process / auditory receptor cell stereocilium organization / hydrogen peroxide biosynthetic process / myeloid cell homeostasis / positive regulation of catalytic activity / muscle cell cellular homeostasis / regulation of GTPase activity / heart contraction / superoxide metabolic process / superoxide dismutase / negative regulation of reproductive process / Detoxification of Reactive Oxygen Species / negative regulation of developmental process / transmission of nerve impulse / superoxide dismutase activity / : / neuronal action potential / protein-disulfide reductase activity / regulation of multicellular organism growth / response to axon injury / ectopic germ cell programmed cell death / positive regulation of superoxide anion generation / ovarian follicle development / positive regulation of phagocytosis / axon cytoplasm / glutathione metabolic process / embryo implantation / dendrite cytoplasm / Gene and protein expression by JAK-STAT signaling after Interleukin-12 stimulation / removal of superoxide radicals / reactive oxygen species metabolic process / thymus development / regulation of mitochondrial membrane potential / positive regulation of cytokine production / placenta development / locomotory behavior / determination of adult lifespan / sensory perception of sound / regulation of blood pressure / negative regulation of inflammatory response / response to hydrogen peroxide / mitochondrial intermembrane space / small GTPase binding / Platelet degranulation / peroxisome / protein-folding chaperone binding / gene expression / cellular response to oxidative stress / response to heat / cytoplasmic vesicle / spermatogenesis / response to ethanol / intracellular iron ion homeostasis / negative regulation of neuron apoptotic process / positive regulation of MAPK cascade / mitochondrial matrix / cadherin binding / response to xenobiotic stimulus / positive regulation of apoptotic process / copper ion binding / neuronal cell body / apoptotic process / protein-containing complex / mitochondrion / extracellular space / zinc ion binding / extracellular exosome / extracellular region / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus / cytoplasm / cytosol Similarity search - Function | ||||||||||||||||||
Biological species | Homo sapiens (human) | ||||||||||||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3 Å | ||||||||||||||||||
Authors | Sala, F.A. / Wright, G.S.A. / Antonyuk, S.V. / Garratt, R.C. / Hasnain, S.S. | ||||||||||||||||||
Funding support | United Kingdom, Brazil, 5items
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Citation | Journal: Plos Biol. / Year: 2019 Title: Molecular recognition and maturation of SOD1 by its evolutionarily destabilised cognate chaperone hCCS. Authors: Sala, F.A. / Wright, G.S.A. / Antonyuk, S.V. / Garratt, R.C. / Hasnain, S.S. | ||||||||||||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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PDB format | pdb6fp6.ent.gz | 1.3 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6fp6.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
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Summary document | 6fp6_validation.pdf.gz | 597.3 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 6fp6_full_validation.pdf.gz | 611.4 KB | Display | |
Data in XML | 6fp6_validation.xml.gz | 139.4 KB | Display | |
Data in CIF | 6fp6_validation.cif.gz | 190.9 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fp/6fp6 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/fp/6fp6 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 6fn8C 6foiC 6folSC 6fonC 2rsqS S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Deposited unit |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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