PDB-6c43: 2.9 Angstrom Resolution Crystal Structure of Gamma-Aminobutyralde...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6c43

タイトル

2.9 Angstrom Resolution Crystal Structure of Gamma-Aminobutyraldehyde Dehydrogenase from Salmonella typhimurium.

要素

Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

キーワード

OXIDOREDUCTASE / Structural Genomics / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID / Gamma-Aminobutyraldehyde Dehydrogenase / RIBOSOMAL PROTEIN

機能・相同性

機能・相同性情報

L-lysine catabolic process / putrescine catabolic process / aminobutyraldehyde dehydrogenase / aminobutyraldehyde dehydrogenase (NAD+) activity / 酸化還元酵素; アルデヒドまたはケトンに対し酸化酵素として働く; NAD又はNADPを用いる / NAD binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Salmonella choleraesuis (サルモネラ菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.9 Å

データ登録者

Minasov, G. / Shuvalova, L. / Dubrovska, I. / Winsor, J. / Tekleab, H. / Kwon, K. / Anderson, W.F. / Satchell, K.J.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: 2.9 Angstrom Resolution Crystal Structure of Gamma-Aminobutyraldehyde Dehydrogenase from Salmonella typhimurium.
著者: Minasov, G. / Shuvalova, L. / Dubrovska, I. / Winsor, J. / Tekleab, H. / Kwon, K. / Anderson, W.F. / Satchell, K.J.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

履歴

登録	2018年1月11日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2018年1月24日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年10月4日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6c43.cif.gz	1.4 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6c43.ent.gz	1.2 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6c43.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	6c43_validation.pdf.gz	492.2 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6c43_full_validation.pdf.gz	524.5 KB	表示
XML形式データ	6c43_validation.xml.gz	125.3 KB	表示
CIF形式データ	6c43_validation.cif.gz	170.4 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c4/6c43 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c4/6c43	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1wndS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1wnb-d 1wnd-d 4pxl-1 4dal-4 4ywe-2 5l13-2 3n80-2 4wp7-1 5izd-1 3n83-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: CSGID-IDP00969

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#127 - 2010年7月クリスタリン (Crystallins) 類似性 (5) #89 - 2007年5月アコニターゼと鉄調節タンパク質１ (Aconitase and Iron Regulatory Protein 1) 類似性 (5)

登録構造単位

A: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

B: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

C: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

D: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

E: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

F: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

G: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

H: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

412 kDa, 8 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

B: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

C: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

D: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: homology, 1WND
206 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

E: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

F: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

G: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

H: Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
206 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	81.891, 87.800, 145.070
Angle α, β, γ (deg.)	82.76, 77.91, 72.86
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: GLN / Beg label comp-ID: GLN / End auth comp-ID: HIS / End label comp-ID: HIS / Refine code: _ / Auth seq-ID: 2 - 474 / Label seq-ID: 5 - 477

NCSアンサンブル:

#1: タンパク質	Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase / 1-pyrroline dehydrogenase / 4-aminobutanal dehydrogenase / ABALDH 分子量: 51518.559 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Salmonella choleraesuis (サルモネラ菌) 遺伝子: prr, IN36_12155, IN69_10380, IN77_11880 / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 magic 参照: UniProt: A0A0W3SL32, UniProt: Q8ZPC9*PLUS, aminobutyraldehyde dehydrogenase
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 307 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

#1: タンパク質

Gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase / 1-pyrroline dehydrogenase / 4-aminobutanal dehydrogenase / ABALDH

分子量: 51518.559 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Salmonella choleraesuis (サルモネラ菌)
遺伝子: prr, IN36_12155, IN69_10380, IN77_11880 / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 magic
参照: UniProt: A0A0W3SL32, UniProt: Q8ZPC9*PLUS, aminobutyraldehyde dehydrogenase

#2: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 307 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.36 Å³/Da / 溶媒含有率: 48 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: Protein: 7.4 mg/ml, 0.5M Sodium chloride, 0.01M Tris pH 8.3; Screen: Classics II (D7), 0.1M Bis-Tris (pH=6.5), 25% (w/v) PEG 3350;

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 21-ID-F / 波長: 0.97872 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年11月8日 / 詳細: C(111)
放射	モノクロメーター: Be / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97872 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.9→30 Å / Num. obs: 82131 / % possible obs: 98.7 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 2 % / B_iso Wilson estimate: 62.2 Å² / R_merge(I) obs: 0.066 / R_pim(I) all: 0.066 / R_rim(I) all: 0.094 / R_sym value: 0.066 / Χ²: 1.003 / Net I/σ(I): 11.7
反射シェル	解像度: 2.9→2.95 Å / 冗長度: 2 % / R_merge(I) obs: 0.416 / Mean I/σ(I) obs: 1.9 / Num. unique obs: 4064 / CC_1/2: 0.719 / R_pim(I) all: 0.416 / R_rim(I) all: 0.589 / R_sym value: 0.416 / Χ²: 0.992 / % possible all: 98.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.8.0189	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1WND

1wnd

解像度: 2.9→29.73 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.945 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.929 / SU B: 37.338 / SU ML: 0.313 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R Free: 0.397 / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.21914	4155	5.1 %	RANDOM
R_work	0.18859	-	-	-
obs	0.19016	77939	98.36 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 63.68 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.39 Å²	-2.19 Å²	4.06 Å²
2-	-	-0.03 Å²	-3.1 Å²
3-	-	-	-0.22 Å²

精密化ステップ

サイクル: 1 / 解像度: 2.9→29.73 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	28728	0	0	307	29035

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.007	0.019	29304
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.486	1.957	39816
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	1.564	5	3776
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	23.623	24.076	1256
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	9.621	15	4760
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	15.537	15	184
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.099	0.2	4528
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.021	22264
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	2.077	4.145	15128
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	3.497	6.219	18896
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	2.78	4.38	14176
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined	7.762	57.496	44187
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	30300	0.05
1	2	B	30300	0.05
2	1	A	30316	0.06
2	2	C	30316	0.06
3	1	A	30354	0.06
3	2	D	30354	0.06
4	1	A	30382	0.05
4	2	E	30382	0.05
5	1	A	30342	0.05
5	2	F	30342	0.05
6	1	A	30350	0.05
6	2	G	30350	0.05
7	1	A	30400	0.04
7	2	H	30400	0.04
8	1	B	30208	0.06
8	2	C	30208	0.06
9	1	B	30296	0.06
9	2	D	30296	0.06
10	1	B	30274	0.06
10	2	E	30274	0.06
11	1	B	30156	0.06
11	2	F	30156	0.06
12	1	B	30180	0.05
12	2	G	30180	0.05
13	1	B	30206	0.05
13	2	H	30206	0.05
14	1	C	30256	0.07
14	2	D	30256	0.07
15	1	C	30322	0.06
15	2	E	30322	0.06
16	1	C	30394	0.06
16	2	F	30394	0.06
17	1	C	30206	0.06
17	2	G	30206	0.06
18	1	C	30278	0.06
18	2	H	30278	0.06
19	1	D	30352	0.06
19	2	E	30352	0.06
20	1	D	30274	0.06
20	2	F	30274	0.06
21	1	D	30262	0.06
21	2	G	30262	0.06
22	1	D	30286	0.05
22	2	H	30286	0.05
23	1	E	30340	0.05
23	2	F	30340	0.05
24	1	E	30280	0.05
24	2	G	30280	0.05
25	1	E	30278	0.05
25	2	H	30278	0.05
26	1	F	30330	0.05
26	2	G	30330	0.05
27	1	F	30412	0.05
27	2	H	30412	0.05
28	1	G	30322	0.05
28	2	H	30322	0.05

LS精密化シェル

解像度: 2.9→2.975 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.354	289	-
R_work	0.33	5488	-
obs	-	-	95.02 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.5563	-0.9711	-0.8616	1.079	0.8918	1.2376	0.0695	0.2304	-0.1029	-0.1211	-0.1988	0.1934	-0.1599	-0.3326	0.1292	0.0556	0.0824	0.0081	0.1478	0.024	0.1073	-33.0532	3.2195	-7.5858
2	1.2075	0.0306	-0.7611	0.1651	0.2371	1.342	0.0689	-0.1466	0.0214	0.0379	-0.1216	0.0273	-0.0068	-0.1627	0.0527	0.0721	0.0138	0.0298	0.1454	-0.0135	0.051	-34.3036	2.7218	18.9292
3	0.3232	0.543	0.5239	3.5903	2.1265	1.7087	-0.0604	-0.1574	-0.0343	0.4306	-0.388	1.0386	0.3575	-0.2979	0.4484	0.275	0.0096	0.2765	0.1152	-0.0047	0.623	-28.1255	-31.1593	8.4712
4	0.7009	0.0524	0.1171	0.2943	0.1838	1.2187	-0.0756	0.0526	-0.3448	-0.011	-0.1074	0.223	0.0853	-0.1841	0.183	0.0434	0.013	0.0852	0.0877	-0.0801	0.4712	-25.9783	-30.578	-17.9411
5	1.7266	0.6066	-1.0014	1.195	-0.3365	2.1327	0.0228	-0.0868	-0.0547	-0.1217	0.085	-0.3052	-0.183	0.1517	-0.1078	0.116	0.0453	0.0595	0.0962	-0.0071	0.1818	5.9146	10.6541	-3.311
6	1.1387	-0.2584	-0.6858	0.8636	0.3791	1.4067	0.0405	0.0426	-0.1624	-0.1651	0.0637	-0.1897	-0.0907	0.2057	-0.1042	0.0623	0.009	0.0656	0.08	-0.0367	0.1269	9.7418	-7.4887	-22.2525
7	1.9159	-0.329	0.7554	1.2707	0.1444	2.4132	-0.1627	-0.1654	-0.3447	0.283	0.058	-0.3062	0.4306	0.5911	0.1046	0.2279	0.2201	0.0579	0.2823	0.1816	0.3535	11.478	-24.5902	9.3553
8	1.0736	0.0349	-0.1594	1.1511	0.7974	1.131	-0.046	-0.4715	-0.0624	0.2725	0.1252	-0.1331	0.2181	0.3821	-0.0792	0.1361	0.1339	-0.0133	0.43	0.1134	0.18	6.4382	-6.435	28.0021
9	1.4926	1.2824	-0.1492	3.285	0.3162	0.8396	-0.2517	0.0501	0.0662	-0.1571	0.1599	0.1356	0.1801	-0.2003	0.0918	0.1131	-0.0085	0.013	0.1186	-0.0021	0.0277	-73.4886	-64.8435	85.3097
10	0.7436	0.012	0.0085	0.6889	0.0249	1.0228	-0.1407	0.2321	-0.0796	0.0321	-0.0783	0.1638	0.2843	-0.2473	0.2189	0.1444	-0.0883	0.0975	0.176	-0.0771	0.1035	-70.1163	-75.0694	61.0736
11	2.2122	-1.2576	-0.1571	2.7505	0.6888	0.9649	-0.2394	0.2103	0.1574	-0.3113	0.1698	0.5779	-0.1763	-0.2845	0.0696	0.1736	-0.059	-0.1902	0.2391	0.1787	0.2903	-77.4356	-40.0704	56.7943
12	1.3546	-0.1537	-0.6258	0.1982	0.1252	1.0441	-0.0411	0.0454	0.3751	-0.1129	-0.0114	0.2061	-0.1271	-0.1988	0.0524	0.1303	0.0899	-0.1839	0.1467	-0.0118	0.4809	-79.7733	-29.5246	80.9653
13	2.0523	0.1121	-1.6115	1.1291	0.1535	2.819	-0.0042	0.1354	0.5679	-0.3776	0.1845	-0.2338	-0.2021	0.2684	-0.1803	0.2033	-0.0895	-0.007	0.1268	0.0791	0.3612	-38.7687	-31.1187	58.9165
14	1.2754	-0.3596	-0.4215	0.7062	0.1136	1.1209	-0.0378	0.1999	0.1647	-0.1589	0.0491	-0.2012	-0.1365	0.3039	-0.0113	0.0982	-0.1271	0.0136	0.2688	0.0579	0.0864	-34.0375	-55.4978	49.6906
15	2.0918	0.4882	1.37	0.7699	0.9582	2.4745	-0.0994	0.1311	-0.0455	0.0833	0.1629	-0.2184	0.0696	0.3648	-0.0634	0.09	0.0707	-0.0273	0.0967	-0.019	0.0964	-34.1055	-58.349	85.5055
16	0.6882	0.5437	0.2758	1.3033	0.6687	0.8842	0.0268	-0.026	0.1861	0.0471	0.0935	-0.027	0.0035	0.1332	-0.1203	0.0804	0.0662	-0.0304	0.1015	-0.0542	0.1586	-39.8281	-34.3186	95.2655

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	2 - 248
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	249 - 474
3	X-RAY DIFFRACTION	3	B	2 - 248
4	X-RAY DIFFRACTION	4	B	249 - 474
5	X-RAY DIFFRACTION	5	C	2 - 248
6	X-RAY DIFFRACTION	6	C	249 - 474
7	X-RAY DIFFRACTION	7	D	2 - 248
8	X-RAY DIFFRACTION	8	D	249 - 474
9	X-RAY DIFFRACTION	9	E	2 - 248
10	X-RAY DIFFRACTION	10	E	249 - 474
11	X-RAY DIFFRACTION	11	F	2 - 248
12	X-RAY DIFFRACTION	12	F	249 - 474
13	X-RAY DIFFRACTION	13	G	2 - 248
14	X-RAY DIFFRACTION	14	G	249 - 474
15	X-RAY DIFFRACTION	15	H	2 - 248
16	X-RAY DIFFRACTION	16	H	249 - 474

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)