登録情報 | データベース: PDB / ID: 6bt1 |
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タイトル | Structure of the human Nocturnin catalytic domain |
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要素 | Nocturnin |
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キーワード | RNA BINDING PROTEIN / Hydrolase / EEP Superfamily |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
nocturnin / NADP phosphatase activity / NADPH phosphatase activity / poly(A)-specific ribonuclease activity / deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA / NADP metabolic process / : / P-body assembly / mRNA stabilization / regulation of embryonic development ...nocturnin / NADP phosphatase activity / NADPH phosphatase activity / poly(A)-specific ribonuclease activity / deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA / NADP metabolic process / : / P-body assembly / mRNA stabilization / regulation of embryonic development / positive regulation of fat cell differentiation / negative regulation of osteoblast differentiation / BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression / P-body / circadian regulation of gene expression / regulation of circadian rhythm / 3'-5'-RNA exonuclease activity / transcription by RNA polymerase II / response to lipopolysaccharide / negative regulation of gene expression / mRNA binding / perinuclear region of cytoplasm / mitochondrion / nucleoplasm / nucleus / metal ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Nocturnin, deadenylase domain / : / Endonuclease/exonuclease/phosphatase / Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family / Endonuclease/exonuclease/phosphatase superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.48 Å |
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データ登録者 | Abshire, E.T. / Chasseur, J. / Del Rizzo, P. / Trievel, R. |
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資金援助 | 米国, 4件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Edward Mallinckrodt Jr. Foundation | | 米国 | Michigan Nutrition and Obesity Research Center | | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | 5T32GM008597 | 米国 | American Heart Association | 16PRE26700002 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2018 タイトル: The structure of human Nocturnin reveals a conserved ribonuclease domain that represses target transcript translation and abundance in cells. 著者: T Abshire, E. / Chasseur, J. / Bohn, J.A. / Del Rizzo, P.A. / Freddolino, P.L. / Goldstrohm, A.C. / Trievel, R.C. |
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履歴 | 登録 | 2017年12月4日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2018年5月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年5月23日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.pdbx_database_id_DOI |
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改定 1.2 | 2018年6月20日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.name |
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改定 1.3 | 2018年7月18日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.4 | 2019年2月20日 | Group: Author supporting evidence / Data collection / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.5 | 2020年1月1日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.6 | 2024年3月13日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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