PDB-6bnj: Human hypoxanthine guanine phosphoribosyltransferase in complex w...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6bnj

タイトル

Human hypoxanthine guanine phosphoribosyltransferase in complex with [3R,4R]-4-guanin-9-yl-3-((R)-2-hydroxy-2-phosphonoethyl)oxy-1-N-(phosphonopropionyl)pyrrolidine

要素

Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase

キーワード

TRANSFERASE/INHIBITOR / enzyme / inhibitor / nucleoside phosphonate / purine salvage / malaria / phosphoribosyltransferase / TRANSFERASE / TRANSFERASE-INHIBITOR complex

機能・相同性

機能・相同性情報

Defective HPRT1 disrupts guanine and hypoxanthine salvage / positive regulation of dopamine metabolic process / GMP catabolic process / adenine metabolic process / cerebral cortex neuron differentiation / hypoxanthine salvage / hypoxanthine phosphoribosyltransferase / guanine phosphoribosyltransferase activity / guanine salvage / hypoxanthine metabolic process ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.909 Å

データ登録者

Keough, D.T. / Rejman, D. / Guddat, L.W.

資金援助

オーストラリア, 1件

引用

ジャーナル: ACS Chem. Biol. / 年: 2018
タイトル: Design of Plasmodium vivax Hypoxanthine-Guanine Phosphoribosyltransferase Inhibitors as Potential Antimalarial Therapeutics.
著者: Keough, D.T. / Rejman, D. / Pohl, R. / Zbornikova, E. / Hockova, D. / Croll, T. / Edstein, M.D. / Birrell, G.W. / Chavchich, M. / Naesens, L.M.J. / Pierens, G.K. / Brereton, I.M. / Guddat, L.W.

履歴

登録	2017年11月16日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2017年12月6日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年12月13日	Group: Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.title
改定 1.2	2018年1月31日	Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.year
改定 1.3	2024年3月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _chem_comp.name / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.name / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6bnj.cif.gz	361 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6bnj.ent.gz	297.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6bnj.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	6bnj_validation.pdf.gz	1.7 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6bnj_full_validation.pdf.gz	1.7 MB	表示
XML形式データ	6bnj_validation.xml.gz	40.1 KB	表示
CIF形式データ	6bnj_validation.cif.gz	56.1 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bn/6bnj ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bn/6bnj	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5hiaC 6bo7C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4rao-d 4ijq-d 4rab-d 5w8v-d 5brn-d 5bsk-d 5hia-d 4rad-2 4rac-d 4rad-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#151 - 2012年7月ヒポキサンチン-グアニンホスホリボシル基転移酵素 (Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase) 類似性 (8)

登録構造単位

A: Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase

B: Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase

C: Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase

D: Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase

ヘテロ分子

100 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration, All crystal forms of this enzyme are a tetramer

単位格子

Length a, b, c (Å)	69.620, 93.942, 130.020
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase / HGPRTase 分子量: 24548.281 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: HPRT1, HPRT / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) 参照: UniProt: P00492, hypoxanthine phosphoribosyltransferase
#2: 化合物	ChemComp-WPG / (3-{(3R,4R)-3-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-4-[(2R)-2-hydroxy-2-phosphonoethoxy]pyrrolidin-1-yl}-3-oxopropy l)phosphonic acid / [3R,4R]-4-guanin-9-yl-3-((R)-2-hydroxy-2-phosphonoethyl)oxy-1-N-(phosphonopropionyl)pyrrolidine 分子量: 496.306 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₄H₂₂N₆O₁₀P₂
#3: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 536 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.31 Å³/Da / 溶媒含有率: 46.71 %
結晶化	温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 0.3 M sodium acetate, 17.5% PEG 3350 and, for 5, 0.2 M sodium acetate, 20% PEG 3350.

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Australian Synchrotron / ビームライン: MX1 / 波長: 0.9 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 210r / 検出器: CCD / 日付: 2015年5月5日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.909→42.4 Å / Num. obs: 69600 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 7.12 % / Net I/σ(I): 15.7
反射シェル	解像度: 1.909→1.95 Å / 冗長度: 6.2 % / R_merge(I) obs: 0.182 / Num. unique obs: 4279 / R_pim(I) all: 0.08 / % possible all: 96.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
XDS		データ削減
Aimless		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.909→42.4 Å / SU ML: 0.19 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 20.43 / 立体化学のターゲット値: MLHL

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2083	2000	3 %
R_work	0.1759	-	-
obs	0.1769	66772	99.81 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.909→42.4 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6477	0	136	536	7149

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.015	7077
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.533	9673
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	16.641	2846
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.072	1084
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	1229

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.9094-1.9571	0.292	138	0.26	4478	X-RAY DIFFRACTION	98
1.9571-2.01	0.2523	142	0.2065	4579	X-RAY DIFFRACTION	100
2.01-2.0692	0.2468	139	0.2008	4545	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0692-2.1359	0.2356	143	0.1897	4603	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1359-2.2123	0.2049	142	0.1815	4596	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2123-2.3009	0.2499	141	0.1937	4577	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3009-2.4056	0.214	142	0.1824	4599	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4056-2.5324	0.2299	142	0.1802	4596	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5324-2.691	0.2169	144	0.1818	4649	X-RAY DIFFRACTION	100
2.691-2.8987	0.1957	142	0.184	4613	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8987-3.1904	0.194	144	0.1748	4640	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1904-3.6518	0.1872	144	0.1622	4691	X-RAY DIFFRACTION	100
3.6518-4.6	0.1725	146	0.1443	4701	X-RAY DIFFRACTION	100
4.6-42.4106	0.1962	151	0.1597	4905	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.0342	0.3495	-1.0165	0.8813	-1.0522	1.3818	0.0059	-0.4254	0.0731	0.0896	-0.0963	0.3763	-0.1075	-0.4024	0.0471	0.1354	0.0388	0.0322	0.32	-0.0162	0.1647	-39.4718	-15.7642	40.8873
2	0.8869	-0.1742	0.2738	1.7518	-0.8205	2.767	-0.0496	-0.0581	0.0977	0.1855	0.0051	0.2196	-0.3226	0.038	0.033	0.1572	0.0508	0.006	0.1699	-0.0374	0.1209	-29.4841	-1.7909	36.6925
3	0.8966	-0.3236	-0.0205	1.1862	0.0116	1.8109	-0.063	-0.0321	-0.1218	-0.0276	0.0026	0.0318	0.1338	-0.221	0.0478	0.0889	-0.0392	0.0175	0.1097	-0.0266	0.1429	-29.6081	-27.0414	26.8268
4	3.1408	-2.426	1.3717	2.7269	-1.592	2.1328	0.0885	0.1547	-0.0393	-0.1356	-0.1805	-0.0797	-0.0438	0.1348	0.0621	0.1078	-0.0175	0.0199	0.1297	-0.0283	0.136	-23.6416	-24.094	25.7969
5	3.4697	-0.0715	1.4231	0.2481	0.6637	2.5511	0.0699	-0.5151	-0.2618	-0.0305	0.058	-0.0032	0.3921	-0.5311	-0.153	0.1959	-0.0865	0.0207	0.2071	-0.0165	0.2129	-25.1148	-30.1955	19.9462
6	2.1804	-0.5455	-0.1274	2.6941	0.443	1.6389	0.1117	0.6079	0.2771	-0.5211	-0.0528	-0.1876	-0.0769	-0.2505	0.0037	0.1535	-0.0423	0.0169	0.3112	-0.0369	0.1581	-36.5716	-24.2315	16.7505
7	0.8408	0.5209	-0.7431	6.4404	1.3393	3.8779	0.0086	0.1432	0.1239	0.3659	0.0203	0.3794	0.0942	-0.4539	0.1672	0.1425	-0.1	-0.0328	0.4102	-0.0557	0.1397	-43.61	-25.4042	14.0169
8	1.3454	-0.359	0.2729	3.8851	2.1668	4.0015	-0.1481	0.1469	-0.211	-0.0469	0.0725	0.3097	0.3399	-0.1015	0.1139	0.1582	-0.0504	0.0049	0.2134	-0.0619	0.169	-38.2979	-27.1996	22.4118
9	1.8912	0.0187	0.2415	0.2135	0.5376	1.4563	-0.0633	0.1949	-0.118	-0.0466	-0.0029	0.3214	-0.1314	-0.4178	0.0566	0.1335	0.0004	0.0107	0.3253	-0.0563	0.2756	-45.8026	-21.7221	28.5534
10	1.2911	0.2645	0.1074	2.6821	-1.7976	2.1884	-0.0821	0.1357	0.1076	0.0249	0.1194	0.1603	-0.1718	-0.5329	-0.0607	0.1356	0.0559	-0.011	0.1752	-0.0267	0.14	-37.3369	-8.7363	28.6737
11	0.7862	0.3778	-0.5656	3.2195	0.0622	2.5458	-0.0094	0.1058	0.0176	0.0551	-0.0417	0.2418	-0.3302	-0.1814	0.0363	0.1214	0.0477	-0.008	0.1253	-0.0108	0.1292	-33.8408	-1.1165	29.2083
12	1.8747	-1.1082	0.3343	2.0279	0.6298	1.6924	0.0089	-0.2777	-0.2455	0.2891	-0.1123	0.3325	0.1407	-0.3466	0.1187	0.1484	-0.0207	0.0545	0.2818	0.0131	0.1777	-30.2838	-22.8983	48.6414
13	2.4553	0.2055	-0.0246	0.7688	-0.1193	1.9919	-0.0099	-0.0998	0.0514	0.0294	0.031	-0.0746	-0.0963	0.0826	-0.0086	0.1229	0.0057	0.0008	0.1037	-0.0303	0.1093	-11.8936	-9.2977	45.7637
14	2.8021	-0.0113	0.7149	2.1602	1.5547	3.0391	-0.0728	-0.4904	0.0462	0.3814	0.1333	-0.18	0.0109	-0.0135	-0.0477	0.1677	0.0089	-0.0211	0.2424	-0.0798	0.247	-2.2792	-9.9704	53.0367
15	1.3435	0.1512	0.7602	1.5312	0.9024	1.1971	-0.1095	-0.2676	-0.0806	0.192	0.118	0.0088	0.062	-0.1571	-0.0003	0.1627	0.0285	0.0187	0.2157	-0.0011	0.1089	-17.5332	-15.7477	58.293
16	3.2719	0.5776	-1.0805	1.1585	0.9347	2.6265	-0.1009	-0.0863	-0.2748	-0.3932	-0.1321	-0.2536	0.0679	0.5868	0.262	0.1501	0.0491	0.0411	0.3325	0.0271	0.1741	1.7266	-21.7586	15.1725
17	1.3969	-0.6938	0.3934	2.3377	-1.0047	1.5679	0.0586	0.1037	-0.1467	-0.2083	-0.0121	-0.1267	0.1543	0.095	-0.049	0.0992	0.0037	0.0096	0.141	-0.0307	0.1213	-9.175	-21.259	21.1648
18	2.0219	-0.1858	0.578	1.1467	0.1409	2.77	0.0342	-0.0054	-0.0605	-0.0445	-0.0568	-0.0569	-0.0123	-0.1074	0.0334	0.0935	0.0043	0.024	0.0975	-0.0057	0.1018	-19.9063	-8.9069	19.8784
19	1.9891	-0.6145	-0.0617	2.4228	-1.9723	1.7784	-0.0034	0.2532	-0.0287	-0.2628	-0.0243	0.0572	0.0968	-0.2278	0.0139	0.1444	0.0205	0.0405	0.1597	0.0073	0.1512	-24.8738	-4.1338	14.8938
20	1.5913	-0.8782	0.498	1.3481	-0.2664	1.087	0.0335	0.1525	0.017	-0.0511	0.0093	-0.1264	0.0164	0.0815	-0.0581	0.1191	0.0055	0.0331	0.1148	0.015	0.0806	-13.4087	-7.2378	6.5541
21	2.9222	1.1778	0.3086	2.5778	0.3703	2.0446	0.026	0.471	-0.3222	-0.137	0.0049	-0.0787	0.2179	0.0961	-0.0342	0.1524	0.0262	-0.0014	0.1521	-0.0488	0.1381	-11.5293	-24.3062	10.4888
22	1.6787	-0.346	0.0861	2.1854	0.2404	0.0345	0.3285	0.629	-0.6696	-0.2666	0.0139	-0.0312	0.4421	0.1047	-0.2123	0.3173	0.0468	-0.0636	0.2524	-0.1062	0.3022	-13.5187	-32.1946	12.1203
23	3.0774	-0.8742	-0.0148	1.3835	0.3028	2.7332	0.0763	-0.0361	-0.3603	0.0491	-0.1745	0.0072	0.1945	0.1079	0.0951	0.0818	-0.0096	0.0267	0.2075	-0.0299	0.1809	3.9348	-24.3803	26.2521
24	1.3783	-0.2585	0.0808	2.194	-0.0392	2.1502	-0.0137	0.0147	-0.009	-0.1377	0.0551	-0.1081	-0.0346	0.1532	-0.0363	0.0501	0.0105	-0.0036	0.1276	-0.0302	0.1088	-2.0383	-20.7542	32.7412
25	2.4549	-0.3293	0.4634	1.3138	0.5004	2.5283	-0.0471	-0.1506	-0.1615	0.222	0.0417	-0.024	0.0649	-0.066	0.0286	0.13	0.0106	0.0008	0.132	0.0163	0.1333	-8.2372	-28.7746	44.4028
26	1.9143	-1.3073	-0.002	2.1805	-1.0856	2.3811	0.175	-0.1024	-0.6361	-0.0142	0.0881	0.0465	0.5454	-0.1411	-0.2405	0.2363	0.0101	0.0097	0.2154	0.0244	0.2702	-13.6011	-33.4269	45.9165
27	3.5193	1.0014	0.0144	2.4211	0.391	1.538	0.2651	-1.3292	0.0998	0.8621	-0.2352	-0.0494	-0.0614	0.453	0.0028	0.3665	0.0423	-0.0181	0.4955	0.0371	0.2716	1.5656	-31.4151	52.1534
28	2.2077	0.3716	0.1137	2.48	-0.4073	2.0482	0.0972	-0.5711	-0.4109	0.4729	-0.1919	-0.3272	0.3202	0.4298	0.0954	0.2955	0.0524	-0.0208	0.3404	0.0937	0.275	5.9728	-35.6322	44.8112
29	1.5607	-0.3087	-0.0905	1.4246	-0.4203	1.401	-0.0097	-0.1811	0.1338	0.1035	0.095	-0.2397	-0.1509	0.5522	-0.0457	0.0988	-0.0427	-0.015	0.2485	-0.0471	0.1924	7.896	-14.0254	37.9244

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 3 through 17 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 18 through 37 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 38 through 70 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 71 through 86 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 87 through 100 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 101 through 139 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 140 through 152 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 153 through 165 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 166 through 179 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resid 180 through 197 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'A' and (resid 198 through 217 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 3 through 37 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 38 through 85 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 86 through 127 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 128 through 217 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 4 through 17 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 18 through 56 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 57 through 85 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 86 through 127 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 128 through 179 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 180 through 197 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 198 through 217 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 0 through 20 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 21 through 56 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 57 through 85 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 86 through 100 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 101 through 139 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 140 through 179 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 180 through 217 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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