登録情報 | データベース: PDB / ID: 6bgc |
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タイトル | The crystal structure of the W145A variant of TpMglB-2 (Tp0684) with bound glucose |
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要素 | Glucose/galactose-binding lipoprotein |
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キーワード | SUGAR BINDING PROTEIN / glucose / syphilis |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
MglB-2, periplasmic binding protein domain / Periplasmic binding protein domain / : / Periplasmic binding protein / Periplasmic binding protein domain / Response regulator / Periplasmic binding protein-like I / Prokaryotic membrane lipoprotein lipid attachment site profile. / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 beta-D-glucopyranose / Glucose/galactose-binding lipoprotein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Treponema pallidum (梅毒トレポネーマ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.082 Å |
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データ登録者 | Brautigam, C.A. / Norgard, M.V. / Deka, R.K. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | AI056305 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2018 タイトル: Crystal structures of MglB-2 (TP0684), a topologically variant d-glucose-binding protein from Treponema pallidum, reveal a ligand-induced conformational change. 著者: Brautigam, C.A. / Deka, R.K. / Liu, W.Z. / Norgard, M.V. |
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履歴 | 登録 | 2017年10月27日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2018年1月31日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年2月14日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.2 | 2018年4月4日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.title |
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改定 1.3 | 2019年8月21日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / Item: _citation.title |
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改定 1.4 | 2019年12月11日 | Group: Author supporting evidence / Data collection / カテゴリ: chem_comp / pdbx_audit_support Item: _chem_comp.type / _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 2.0 | 2020年7月29日 | Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id ..._atom_site.auth_atom_id / _atom_site.label_atom_id / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation |
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改定 2.1 | 2023年10月4日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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