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- PDB-6b9m: Crystal structure of UHRF1 TTD domain in complex with the polybas... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6b9m
タイトルCrystal structure of UHRF1 TTD domain in complex with the polybasic region
要素(E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1) x 2
キーワードTRANSFERASE / complex
機能・相同性
機能・相同性情報


: / : / : / histone H3 ubiquitin ligase activity / H3K9me3 modified histone binding / positive regulation of DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity / intestinal epithelial structure maintenance / DNA damage sensor activity / hemi-methylated DNA-binding / homologous recombination ...: / : / : / histone H3 ubiquitin ligase activity / H3K9me3 modified histone binding / positive regulation of DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) activity / intestinal epithelial structure maintenance / DNA damage sensor activity / hemi-methylated DNA-binding / homologous recombination / regulation of epithelial cell proliferation / methyl-CpG binding / lens development in camera-type eye / negative regulation of gene expression via chromosomal CpG island methylation / mitotic spindle assembly / protein autoubiquitination / animal organ regeneration / cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / heterochromatin / heterochromatin formation / epigenetic regulation of gene expression / methylated histone binding / positive regulation of protein metabolic process / DNA methylation / Chromatin modifications during the maternal to zygotic transition (MZT) / liver development / replication fork / double-strand break repair via homologous recombination / euchromatin / RING-type E3 ubiquitin transferase / nuclear matrix / spindle / ubiquitin-protein transferase activity / ubiquitin protein ligase activity / histone binding / ubiquitin-dependent protein catabolic process / nucleic acid binding / protein ubiquitination / inflammatory response / cell cycle / DNA damage response / chromatin / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / zinc ion binding / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
: / UHRF1, tandem tudor domain / UHRF1/2-like / Tandem tudor domain within UHRF1 / SRA-YDG / SRA-YDG superfamily / SAD/SRA domain / YDG domain profile. / SET and RING finger associated domain. Domain of unknown function in SET domain containing proteins and in Deinococcus radiodurans DRA1533. / SH3 type barrels. - #30 ...: / UHRF1, tandem tudor domain / UHRF1/2-like / Tandem tudor domain within UHRF1 / SRA-YDG / SRA-YDG superfamily / SAD/SRA domain / YDG domain profile. / SET and RING finger associated domain. Domain of unknown function in SET domain containing proteins and in Deinococcus radiodurans DRA1533. / SH3 type barrels. - #30 / Zinc finger, C3HC4 RING-type / Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) / PUA-like superfamily / Zinc finger, RING-type, conserved site / Zinc finger RING-type signature. / Zinc finger, PHD-type, conserved site / PHD-finger / Ring finger / Zinc finger PHD-type signature. / Zinc finger PHD-type profile. / Zinc finger, PHD-finger / Zinc finger, PHD-type / PHD zinc finger / Zinc finger RING-type profile. / Zinc finger, RING-type / Zinc finger, FYVE/PHD-type / SH3 type barrels. / Ubiquitin family / Ubiquitin homologues / Ubiquitin domain profile. / Ubiquitin-like domain / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type / Ubiquitin-like domain superfamily / Roll / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 / E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
類似検索 - 構成要素
生物種Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
Homo sapiens (ヒト)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.68 Å
データ登録者Song, J. / Tan, X.
引用ジャーナル: Structure / 年: 2018
タイトル: An Intramolecular Interaction of UHRF1 Reveals Dual Control for Its Histone Association.
著者: Gao, L. / Tan, X.F. / Zhang, S. / Wu, T. / Zhang, Z.M. / Ai, H.W. / Song, J.
履歴
登録2017年10月10日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02018年2月14日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12018年2月21日Group: Database references / カテゴリ: citation
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last
改定 1.22024年3月13日Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
B: E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
C: E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
D: E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)57,6784
ポリマ－57,6784
非ポリマー00
水9,638535
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者・ソフトウェアが定義した集合体
  • 根拠: gel filtration
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area3570 Å2
ΔGint-2 kcal/mol
Surface area25220 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)81.219, 66.142, 120.576
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 104.92, 90.00
Int Tables number5
Space group name H-MC121

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要素

#1: タンパク質 E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 / RING-type E3 ubiquitin transferase UHRF1 / Ubiquitin-like PHD and RING finger domain-containing ...RING-type E3 ubiquitin transferase UHRF1 / Ubiquitin-like PHD and RING finger domain-containing protein 1 / Ubiquitin-like-containing PHD and RING finger domains protein 1


分子量: 17778.994 Da / 分子数: 3 / 断片: unp residues 129-280 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
遺伝子: uhrf1 / 発現宿主: Escherichia coli K-12 (大腸菌) / 参照: UniProt: E7EZF3, RING-type E3 ubiquitin transferase
#2: タンパク質・ペプチド E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 / Inverted CCAAT box-binding protein of 90 kDa / Nuclear protein 95 / Nuclear zinc finger protein ...Inverted CCAAT box-binding protein of 90 kDa / Nuclear protein 95 / Nuclear zinc finger protein Np95 / hNp95 / RING finger protein 106 / RING-type E3 ubiquitin transferase UHRF1 / Transcription factor ICBP90 / Ubiquitin-like PHD and RING finger domain-containing protein 1 / hUHRF1 / Ubiquitin-like-containing PHD and RING finger domains protein 1


分子量: 4340.991 Da / 分子数: 1 / 断片: unp residues 638-678 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: UHRF1, ICBP90, NP95, RNF106 / 発現宿主: Escherichia coli K-12 (大腸菌) / 参照: UniProt: Q96T88, RING-type E3 ubiquitin transferase
#3: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 535 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O
配列の詳細The sample sequence of the proteinused is different from sequence (E7EZF3). The accession of the ...The sample sequence of the proteinused is different from sequence (E7EZF3). The accession of the sequence of our sample in NCBI is NP_998242 which is also from Danio rerio (zebrafish)

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.71 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.66 %
結晶化温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法
詳細: 0.1M Succinic acid pH7.0, 15% (v/v) Polyethylene glycol 3350

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データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 5.0.3 / 波長: 0.97741 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2016年7月2日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.97741 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.68→50 Å / Num. obs: 69241 / % possible obs: 98.4 % / 冗長度: 3 % / Net I/σ(I): 27.1

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解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX1.9_1692精密化
HKL-2000データ削減
HKL-2000データスケーリング
MOLREP位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.68→28.76 Å / SU ML: 0.19 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 22.82
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2066 3416 4.93 %
Rwork0.1821 --
obs0.1834 69239 98.33 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 1.68→28.76 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数3769 0 0 535 4304
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0093868
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d1.1275228
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d12.0041478
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.05531
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.006693
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
1.6801-1.70410.25251200.27852663X-RAY DIFFRACTION95
1.7041-1.72950.31251590.26752639X-RAY DIFFRACTION96
1.7295-1.75660.29521550.25092687X-RAY DIFFRACTION97
1.7566-1.78540.26261170.24092708X-RAY DIFFRACTION97
1.7854-1.81610.27081360.2312678X-RAY DIFFRACTION97
1.8161-1.84920.26551590.22162690X-RAY DIFFRACTION97
1.8492-1.88470.25581360.22352755X-RAY DIFFRACTION98
1.8847-1.92320.24131480.21522679X-RAY DIFFRACTION98
1.9232-1.9650.2281410.2172753X-RAY DIFFRACTION99
1.965-2.01070.24671590.20382759X-RAY DIFFRACTION98
2.0107-2.0610.24981310.20852720X-RAY DIFFRACTION99
2.061-2.11670.25191180.20692762X-RAY DIFFRACTION99
2.1167-2.17890.23951360.20072779X-RAY DIFFRACTION99
2.1789-2.24920.21971540.20562722X-RAY DIFFRACTION99
2.2492-2.32960.22461540.1992748X-RAY DIFFRACTION99
2.3296-2.42280.23291350.19942765X-RAY DIFFRACTION99
2.4228-2.5330.22211180.20132810X-RAY DIFFRACTION99
2.533-2.66650.2521490.20672751X-RAY DIFFRACTION100
2.6665-2.83340.23171830.2022744X-RAY DIFFRACTION100
2.8334-3.05190.22941290.19512828X-RAY DIFFRACTION100
3.0519-3.35860.2011390.18542792X-RAY DIFFRACTION100
3.3586-3.84370.19061460.1642796X-RAY DIFFRACTION100
3.8437-4.83890.15491320.1292843X-RAY DIFFRACTION100
4.8389-28.76410.15761620.15622752X-RAY DIFFRACTION96
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
17.9782-4.5579-4.61926.06534.09717.9502-0.4561-0.5379-0.22830.81850.4085-0.10840.46850.07480.07770.3690.1464-0.0040.27170.01680.192154.649-23.8323141.0326
28.5733-7.30674.72957.7177-6.52946.93660.04840.40810.29160.0231-0.1887-0.04090.28820.50260.08910.28050.0371-0.04830.2686-0.0410.207846.1608-7.999140.7463
35.3344-1.0988-2.95445.60713.76948.1636-0.29690.2896-0.29130.2725-0.11550.39420.68320.08260.41390.23380.075-0.03660.20980.00450.146847.8455-17.4615139.3732
43.8703-0.0372-2.14744.5195-3.68415.03670.24781.7290.976-1.69230.86050.80890.9762-2.3201-0.74830.60580.0324-0.01430.75140.2110.315757.3059-17.1425122.1433
53.1779-5.3515-2.59188.88923.70764.7181-0.1596-0.1743-0.15910.32180.01910.17810.2730.2740.12620.22340.0458-0.00010.19390.00230.150642.9344-16.3272140.2333
63.22332.48452.41983.88454.21265.8302-0.1298-0.1136-0.09210.25190.1603-0.49160.12540.2508-0.16680.30690.1119-0.05230.2055-0.00170.272753.0605-9.8182144.2301
71.39962.31990.93164.09450.58238.7016-0.10780.2578-0.13630.27370.2193-0.5262-0.11480.9736-0.0430.22730.0679-0.0880.2754-0.05320.261857.70113.7538150.7252
85.8861-0.352-1.78752.06830.60142.31860.31980.6570.8898-0.2271-0.66010.8004-0.0624-0.83760.2930.33760.1047-0.04970.3816-0.08650.450940.22686.216150.1584
97.48435.88212.6037.75122.80642.5996-0.1460.39660.0653-0.20180.16360.0085-0.39730.13970.140.27560.0524-0.03130.23620.02230.194653.01776.272147.9167
105.29262.53411.33738.81447.49248.26160.0426-0.0420.1871-0.19220.33260.0025-0.97080.2318-0.15840.32080.0375-0.04520.16510.02680.231353.426112.5949154.7534
115.21140.22471.36748.06863.27732.1395-0.41640.97710.5056-1.2936-0.27350.2616-0.0419-0.65460.630.574-0.0636-0.12130.4870.03040.326248.45316.8967140.9556
124.54910.879-0.66083.42655.3359.1663-0.06860.0687-0.27010.46470.2338-0.65640.41690.4235-0.12210.27730.0501-0.05420.2097-0.01710.255954.4583-2.461151.4417
136.0412-1.8157-2.45695.42922.51058.71060.11350.1531-0.4896-0.028-0.23570.8865-0.4219-0.3781-0.02640.19710.02930.02520.1675-0.06170.397423.5197-9.9678136.6744
143.1891-2.0338-1.51154.66560.33024.3205-0.00120.2472-0.31160.055-0.16680.9915-0.1282-0.60220.08820.17090.03440.01480.2348-0.0730.390121.3271-5.5808135.0705
156.48764.91594.0382.04437.02894.9899-0.10370.3969-0.52180.73810.04930.04251.11470.17240.10510.4770.05170.10280.2691-0.01540.372431.2156-22.631125.8276
164.3984-1.042-1.76367.96823.70788.963-0.11980.2522-0.1626-0.6476-0.19730.3147-0.4223-0.33420.33070.32740.0243-0.02550.3604-0.11930.220729.462-16.7162114.4197
174.5171-1.0412-1.75441.16862.14755.7727-0.01360.5798-0.4176-0.6722-0.89430.6207-0.8564-1.31790.74880.40860.0811-0.07340.4599-0.2170.35526.8308-17.7292112.5036
184.2463-5.4714-5.90666.94995.83988.6093-0.0910.285-0.0857-0.4984-0.52860.7395-1.1828-1.28940.46390.51810.2065-0.13390.6386-0.26840.4725.9249-14.9809110.1751
193.43760.2383-1.47167.19751.0016.69570.08170.0722-0.41780.0461-0.29280.52730.1534-0.13670.25270.2499-0.01750.03040.2673-0.15810.398229.5909-19.5111121.5848
208.5988-0.18070.34472.9551-0.94873.31190.1326-0.6266-0.01720.481-0.0819-0.5642-0.16010.1956-0.05750.3502-0.0153-0.11920.27930.01970.244970.2964-0.2227188.1223
218.0826-2.54764.5965.3503-0.98227.969-0.0674-0.6792-0.2560.29190.109-0.4097-0.0414-0.06310.07970.3316-0.0355-0.04120.25860.07010.245569.6233-2.7895189.5537
226.2845-0.5258-2.50974.9164.69465.0912-0.3113-0.7031-1.9164-1.26780.5943-0.6603-0.22440.40160.1750.79990.04630.0680.8643-0.11130.869681.93-13.0396180.1351
232.84340.97211.20719.6195-3.94825.12270.0448-0.443-0.67580.5640.24450.18150.1184-0.4142-0.14410.2962-0.0237-0.07050.34030.08010.354166.5551-4.7496188.4899
243.6555-4.67083.6575.882-4.64793.5924-0.8332-0.55250.4871.50540.6109-0.4577-0.5313-0.0660.4310.55030.0706-0.14420.366-0.01840.263960.274613.74182.875
255.2294-2.00830.24948.82191.96766.4327-0.2067-0.04280.2706-0.57670.14670.2757-0.325-0.119-0.10330.2041-0.0449-0.1050.24940.02810.2255.835811.8562173.4619
264.31013.94644.07145.83371.20936.6454-0.4387-0.0637-0.5875-0.06180.91641.0067-0.0824-0.0302-0.40260.2407-0.1155-0.0520.54710.17710.50245.1018-0.8844179.5536
278.8223-1.98731.41326.4726-2.38812.31910.2033-0.0102-0.0636-0.57910.24560.66930.213-0.3929-0.47090.3051-0.0368-0.10760.27290.02520.222752.72776.6738172.6381
288.3004-5.06340.12189.0472-1.97963.6607-0.05860.3446-0.4881-0.28990.1721.01420.4406-0.4146-0.06730.3797-0.0621-0.1240.35920.03820.400550.20574.3934170.3031
297.5228-3.73596.65166.8892-1.33688.5939-0.1172-0.2053-0.19430.41690.25110.135-0.1593-0.2992-0.16420.2151-0.0189-0.01290.1840.03590.181557.450510.0784179.7795
302.69164.6163.41067.62585.67864.17770.2126-0.90430.29220.7749-0.3580.10070.331-0.82890.1620.30670.0290.08150.3835-0.04850.279541.2171-6.1021149.7697
318.8948-2.18810.21377.26465.11643.95020.15250.5494-0.111-0.36240.0171-0.3830.14390.3093-0.1370.25760.0470.02560.2472-0.01150.261437.2704-13.1852132.413
326.16747.3676.8379.55527.07069.20290.29730.4042-0.9714-0.26830.0556-0.8568-0.24380.6205-0.23770.29820.04660.05140.2848-0.04620.380735.987-12.9794127.1412
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 129 through 141 )
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 142 through 152 )
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 153 through 164 )
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 165 through 172 )
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 173 through 188 )
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 189 through 205 )
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'A' and (resid 206 through 219 )
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'A' and (resid 220 through 228 )
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'A' and (resid 229 through 240 )
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'A' and (resid 241 through 251 )
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'A' and (resid 252 through 265 )
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'A' and (resid 266 through 277 )
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'B' and (resid 129 through 152 )
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'B' and (resid 153 through 198 )
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'B' and (resid 199 through 205 )
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'B' and (resid 206 through 228 )
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'B' and (resid 229 through 241 )
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'B' and (resid 242 through 265 )
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'B' and (resid 266 through 277 )
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'C' and (resid 130 through 152 )
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'C' and (resid 153 through 163 )
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'C' and (resid 164 through 173 )
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'C' and (resid 174 through 198 )
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'C' and (resid 199 through 205 )
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'C' and (resid 206 through 219 )
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'C' and (resid 220 through 228 )
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'C' and (resid 229 through 240 )
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'C' and (resid 241 through 265 )
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'C' and (resid 266 through 277 )
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'D' and (resid 648 through 657 )
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'D' and (resid 658 through 662 )
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'D' and (resid 663 through 664 )

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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