登録情報 | データベース: PDB / ID: 6b14 |
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タイトル | Crystal structure of Spinach RNA aptamer in complex with Fab BL3-6S97N |
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要素 | - Heavy chain of Fab BL3-6S97N
- Light chain of Fab BL3-6S97N
- RNA (86-MER)
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キーワード | immune system/rna / Spinach RNA aptamer / Antibody engineering / Chaperone-assisted RNA crystallography / immune system-rna complex |
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機能・相同性 | Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / RNA / RNA (> 10) 機能・相同性情報 |
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生物種 | ![](img/tx_mammal.gif) Mus musculus (ハツカネズミ) synthetic construct (人工物) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.64 Å |
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データ登録者 | DasGupta, S. / Shelke, S.A. / Piccirilli, J.A. |
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資金援助 | 米国, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | R01GM102489 | 米国 | Defense Threat Reduction Agency (DTRA) | HDTRA1-13-1-0004 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2018 タイトル: Affinity maturation of a portable Fab-RNA module for chaperone-assisted RNA crystallography. 著者: Koirala, D. / Shelke, S.A. / Dupont, M. / Ruiz, S. / DasGupta, S. / Bailey, L.J. / Benner, S.A. / Piccirilli, J.A. |
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履歴 | 登録 | 2017年9月16日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2017年12月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年1月10日 | Group: Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / Item: _entity_src_gen.pdbx_src_id |
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改定 1.2 | 2018年1月17日 | Group: Author supporting evidence / Database references / Structure summary カテゴリ: citation / entity ...citation / entity / pdbx_audit_support / struct / struct_keywords Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation.year / _entity.pdbx_description / _pdbx_audit_support.funding_organization / _struct.title / _struct_keywords.pdbx_keywords / _struct_keywords.text |
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改定 1.3 | 2018年1月24日 | Group: Database references / Source and taxonomy カテゴリ: citation / citation_author / pdbx_entity_src_syn Item: _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed ..._citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.name / _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id |
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改定 1.4 | 2018年4月4日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.5 | 2018年4月11日 | Group: Data collection / Source and taxonomy / カテゴリ: entity_src_gen / Item: _entity_src_gen.pdbx_src_id |
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改定 1.6 | 2020年1月1日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.7 | 2023年10月4日 | Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / refine_hist / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _refine_hist.d_res_low / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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