[日本語] English
万見
- PDB-6axl: Crystal structure of Fab317 complex -

+
データを開く


IDまたはキーワード:

読み込み中...

-
基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6axl
タイトルCrystal structure of Fab317 complex
要素
  • Fab317 heavy chain
  • Fab317 light chains
  • Peptide ACE-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-NH2
キーワードIMMUNE SYSTEM / Fab fragment
機能・相同性
機能・相同性情報


entry into host cell by a symbiont-containing vacuole / side of membrane / cell surface / plasma membrane / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
: / Plasmodium circumsporozoite protein / Thrombospondin type 1 domain / Thrombospondin type-1 (TSP1) repeat superfamily / Thrombospondin type-1 (TSP1) repeat profile. / Thrombospondin type 1 repeats / Thrombospondin type-1 (TSP1) repeat / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Circumsporozoite protein
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
Plasmodium falciparum (マラリア病原虫)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.4 Å
データ登録者Oyen, D. / Wilson, I.A.
引用ジャーナル: Proc Natl Acad Sci U S A / 年: 2017
タイトル: Structural basis for antibody recognition of the NANP repeats in circumsporozoite protein.
著者: David Oyen / Jonathan L Torres / Ulrike Wille-Reece / Christian F Ockenhouse / Daniel Emerling / Jacob Glanville / Wayne Volkmuth / Yevel Flores-Garcia / Fidel Zavala / Andrew B Ward / C ...著者: David Oyen / Jonathan L Torres / Ulrike Wille-Reece / Christian F Ockenhouse / Daniel Emerling / Jacob Glanville / Wayne Volkmuth / Yevel Flores-Garcia / Fidel Zavala / Andrew B Ward / C Richter King / Ian A Wilson /
要旨: Acquired resistance against antimalarial drugs has further increased the need for an effective malaria vaccine. The current leading candidate, RTS,S, is a recombinant circumsporozoite protein (CSP)- ...Acquired resistance against antimalarial drugs has further increased the need for an effective malaria vaccine. The current leading candidate, RTS,S, is a recombinant circumsporozoite protein (CSP)-based vaccine against that contains 19 NANP repeats followed by a thrombospondin repeat domain. Although RTS,S has undergone extensive clinical testing and has progressed through phase III clinical trials, continued efforts are underway to enhance its efficacy and duration of protection. Here, we determined that two monoclonal antibodies (mAbs 311 and 317), isolated from a recent controlled human malaria infection trial exploring a delayed fractional dose, inhibit parasite development in vivo by at least 97%. Crystal structures of antibody fragments (Fabs) 311 and 317 with an (NPNA) peptide illustrate their different binding modes. Notwithstanding, one and three of the three NPNA repeats adopt similar well-defined type I β-turns with Fab311 and Fab317, respectively. Furthermore, to explore antibody binding in the context of CSP, we used negative-stain electron microscopy on a recombinant shortened CSP (rsCSP) construct saturated with Fabs. Both complexes display a compact rsCSP with multiple Fabs bound, with the rsCSP-Fab311 complex forming a highly organized helical structure. Together, these structural insights may aid in the design of a next-generation malaria vaccine.
履歴
登録2017年9月7日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02017年11月22日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12017年12月6日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_PubMed
改定 1.22017年12月13日Group: Database references / カテゴリ: citation
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last
改定 1.32024年4月3日Group: Data collection / Database references / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
C: Fab317 light chains
D: Fab317 heavy chain
B: Fab317 light chains
A: Fab317 heavy chain
G: Peptide ACE-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-NH2
I: Peptide ACE-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-NH2


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)97,1426
ポリマ－97,1426
非ポリマー00
水8,737485
1
B: Fab317 light chains
A: Fab317 heavy chain
G: Peptide ACE-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-NH2


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)48,5713
ポリマ－48,5713
非ポリマー00
水543
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area3910 Å2
ΔGint-25 kcal/mol
Surface area20380 Å2
手法PISA
2
C: Fab317 light chains
D: Fab317 heavy chain
I: Peptide ACE-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-NH2


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)48,5713
ポリマ－48,5713
非ポリマー00
水543
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area4070 Å2
ΔGint-24 kcal/mol
Surface area20560 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)82.663, 65.342, 99.043
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 106.40, 90.00
Int Tables number4
Space group name H-MP1211

-
要素

#1: 抗体 Fab317 light chains


分子量: 23408.986 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#2: 抗体 Fab317 heavy chain


分子量: 23930.729 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#3: タンパク質・ペプチド Peptide ACE-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-ASN-PRO-ASN-ALA-NH2


分子量: 1231.255 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成
由来: (合成) Plasmodium falciparum (マラリア病原虫)
参照: UniProt: P02893*PLUS
#4: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 485 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.64 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.37 %
結晶化温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法
詳細: 0.1M Sodium Citrate pH4.0 1M Lithium Chloride 20% PEG6000

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SSRL / ビームライン: BL12-2 / 波長: 0.97946 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年4月7日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.97946 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.4→40.93 Å / Num. obs: 38939 / % possible obs: 97.8 % / 冗長度: 6.1 % / CC1/2: 0.92 / Rpim(I) all: 0.079 / Net I/σ(I): 11.2
反射 シェル解像度: 2.4→2.44 Å / CC1/2: 0.732 / Rpim(I) all: 0.43

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX(1.12_2829: ???)精密化
HKL-2000データ削減
SCALEPACKデータスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: homology model

解像度: 2.4→40.93 Å / SU ML: 0.25 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 22.87
Rfactor反射数%反射
Rfree0.217 1883 4.84 %
Rwork0.175 --
obs0.178 38916 97.5 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.4→40.93 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数6703 0 0 485 7188
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0026871
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.5919359
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d19.1674089
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.0451044
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0031210
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
2.4006-2.46550.27891330.24332719X-RAY DIFFRACTION94
2.4655-2.5380.30381400.23652877X-RAY DIFFRACTION99
2.538-2.61990.30731420.22422853X-RAY DIFFRACTION98
2.6199-2.71360.27221270.21372868X-RAY DIFFRACTION98
2.7136-2.82220.23651350.20682771X-RAY DIFFRACTION95
2.8222-2.95060.24281380.20152840X-RAY DIFFRACTION98
2.9506-3.10610.23891580.19762859X-RAY DIFFRACTION98
3.1061-3.30060.22631450.18022863X-RAY DIFFRACTION98
3.3006-3.55530.22041540.16372860X-RAY DIFFRACTION98
3.5553-3.91290.22191520.15942817X-RAY DIFFRACTION97
3.9129-4.47850.18321520.13022870X-RAY DIFFRACTION99
4.4785-5.64010.15621680.13172853X-RAY DIFFRACTION97
5.6401-40.93450.19721390.18462983X-RAY DIFFRACTION98
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
17.7084-2.75221.11993.92540.84525.0201-0.2895-0.96040.16620.57950.3307-0.0392-0.147-0.2368-0.01070.2838-0.01790.00630.2935-0.02210.2408-17.087826.9275-30.1719
24.4314-1.359-0.03293.3432-0.56772.2625-0.10850.08780.29880.17860.00940.07560.0011-0.07870.14350.2080.0020.01390.1799-0.01090.2622-13.098221.9875-39.2128
34.9537-2.3975-0.31053.316-0.72931.44670.1868-0.01390.2996-0.0472-0.0752-0.111-0.27730.0122-0.0590.2149-0.01-0.00720.1876-0.02680.1926-13.457722.7945-36.0096
40.4204-0.2941-1.3590.25891.06084.493-0.4598-0.38770.04320.26120.30760.1028-0.463-0.09380.08310.350.12980.11650.335-0.01640.5004-34.022429.6997-27.4416
54.22760.75320.38597.0311-2.60944.9253-0.1734-0.15050.15091.05060.25441.48530.2461-0.7525-0.13710.3654-0.07260.11270.4307-0.21140.5219-48.82988.6724-12.2692
61.01610.5265-0.32943.7566-1.83433.12710.2197-0.15350.19740.2141-0.19810.03650.0543-0.29150.05560.2982-0.02380.02660.4154-0.01180.3936-38.709217.9964-12.0448
72.43031.9904-1.36465.1626-1.96453.44510.3061-0.35710.2290.4122-0.43160.4209-0.0344-0.0716-0.00750.2025-0.03040.06510.4276-0.11340.3661-43.184718.2432-12.0371
82.95741.3376-2.24521.5685-0.96448.1083-0.42220.1239-0.2826-0.26460.0283-0.16260.6835-0.18140.37790.1823-0.00080.02220.1456-0.00570.2906-17.4665-1.9915-41.0073
93.1872-0.694-1.00433.9336-0.83544.0764-0.032-0.05910.04720.03950.0979-0.1217-0.02750.1852-0.07150.0872-0.00370.00320.1428-0.00980.1684-8.98011.3391-35.6138
103.5221-0.4978-1.7013.5909-1.48164.5064-0.201-0.3321-0.10310.4002-0.0014-0.08710.13320.30440.25430.1850.0061-0.00550.18690.01120.2738-14.8717-3.9133-30.8559
114.06151.9386-1.7761.2366-0.73711.3296-0.004-0.02550.0307-0.00180.04010.01570.0474-0.00710.01520.20810.04520.02110.18770.00640.1941-19.0394.3932-35.6658
123.4583-0.33780.7147.9642-2.07994.1408-0.2621-0.16040.36050.62430.4090.6756-0.4579-0.4197-0.07590.29020.06450.00030.3892-0.03170.3667-48.13658.8958-19.5332
133.1376-0.34210.17325.0558-0.66823.3254-0.0427-0.00060.4299-0.213-0.10160.0556-0.1917-0.41640.13580.22830.005-0.02030.29140.03090.2595-42.93319.0631-25.5458
147.2356-4.774-2.04813.51061.25584.5622-0.1106-0.32440.1924-0.28150.2650.4881-0.2261-0.1859-0.24160.2302-0.0008-0.0740.3444-0.00750.4989-51.15853.5606-27.2241
152.0576-1.75910.5217.4627-2.77664.2527-0.19190.1563-0.204-0.52720.29710.08590.4828-0.2606-0.0230.3302-0.18670.04270.3422-0.06650.3449-0.795110.7626-79.1194
162.7146-0.25191.0552.1851-1.10592.842-0.10820.1603-0.1948-0.24640.20140.15630.151-0.1809-0.09490.2231-0.08980.02040.2617-0.02810.2495-1.525412.7009-69.9838
170.33420.5407-1.37840.7881-2.13915.75150.24020.2084-0.01320.23410.05850.0713-0.3478-0.1605-0.26190.3325-0.06320.06380.39810.00280.27730.149821.7662-92.3147
187.4470.31781.43682.87721.17445.0182-0.05630.11350.9155-0.3592-0.0429-0.2-0.47620.65910.03460.348-0.07060.01910.29140.05620.323927.09432.0381-100.0026
192.8041-0.8629-2.24040.34670.76642.0438-0.05610.1386-0.42340.0312-0.1438-0.15670.2677-0.06890.23970.3589-0.0166-0.03250.17970.04660.330616.060522.1713-98.2913
207.4078-0.047-1.47731.2189-0.01112.75950.15030.2376-0.1739-0.0645-0.15170.01830.07050.1019-0.00250.3207-0.0226-0.02540.1043-0.00430.228720.169623.0797-100.8761
213.11270.878-1.2241.2816-0.13692.7020.315-0.24770.5473-0.1887-0.0785-0.099-0.27680.0187-0.24610.2793-0.05560.01080.177-0.04630.30221.720924.7352-62.6046
226.01390.2567-4.50313.00160.4453.42750.5899-0.30930.71050.5069-0.10940.1531-0.48330.1855-0.38310.3487-0.05060.03280.2761-0.01620.284212.510723.4852-52.8382
235.31811.61770.90355.7309-3.14945.22580.02610.54610.455-0.32880.2885-0.07270.4850.5453-0.18560.1585-0.0421-0.0050.2069-0.01720.277114.099616.5306-67.2612
245.2292-0.6177-2.32731.6898-1.13854.5498-0.2009-0.1821-0.50050.1281-0.0877-0.33890.4120.17580.19180.1547-0.01740.01880.14040.01540.284717.206912.7007-54.5257
255.501-0.5319-1.55961.8123-0.45952.9208-0.25750.3579-0.79140.4034-0.1640.16030.638-0.06910.47250.1969-0.08260.03420.2048-0.03320.335823.694917.3816-61.5564
261.41820.927-0.97691.5959-1.03531.6144-0.15790.130.02630.05610.037-0.0524-0.1291-0.04190.02950.2039-0.0466-0.02750.2181-0.00560.270314.666621.2775-65.3003
273.7258-1.0733-1.69653.55460.15840.8770.08670.6291-0.0429-0.5255-0.0472-0.1938-0.18940.0840.00140.4184-0.1069-0.0310.28510.0650.303921.874936.9443-100.7904
282.4272-0.94221.72961.6309-2.46424.9992-0.1274-0.00440.098-0.0033-0.1268-0.2471-0.1223-0.11660.21280.2888-0.042-0.00880.15770.00710.301121.381935.5496-87.3851
295.3036-1.02832.22934.6823-1.17744.56130.1367-0.00030.1881-0.066-0.14240.2479-0.0282-0.19220.02770.2265-0.0280.00340.1963-0.00690.226417.887732.7989-90.5282
302.7668-0.24210.91053.6469-1.10434.49-0.31430.14440.35690.00560.14710.0365-0.78880.18010.13680.4475-0.0805-0.10720.16720.0090.393823.172842.9499-90.138
313.434-3.47311.4834.4103-2.97893.1281-0.37410.07720.3838-0.20170.2771-0.755-0.2125-0.23850.02640.276-0.04990.01740.3456-0.03120.2653-1.822918.2548-46.5816
324.26395.1599-1.10426.2803-1.12482.00790.2225-0.0378-0.76890.5583-0.3673-0.9675-0.25360.3466-0.01710.30570.0295-0.0480.21750.02490.31541.85289.0067-42.6691
336.4385-0.53345.23345.3916-3.62686.15580.0888-0.93860.05530.8786-0.06470.9423-0.6698-0.2027-0.34020.32750.04380.02750.30520.04930.3442-4.49129.0492-55.5918
343.83324.37613.3345.31044.16823.3292-0.03570.1907-0.74690.7622-0.449-0.41890.58750.46060.24430.2689-0.0890.03480.30240.07370.36134.9866.5145-51.1769
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1CHAIN 'C' AND (RESID 1 THROUGH 18 )
2X-RAY DIFFRACTION2CHAIN 'C' AND (RESID 19 THROUGH 61 )
3X-RAY DIFFRACTION3CHAIN 'C' AND (RESID 62 THROUGH 102 )
4X-RAY DIFFRACTION4CHAIN 'C' AND (RESID 103 THROUGH 113 )
5X-RAY DIFFRACTION5CHAIN 'C' AND (RESID 114 THROUGH 128 )
6X-RAY DIFFRACTION6CHAIN 'C' AND (RESID 129 THROUGH 163 )
7X-RAY DIFFRACTION7CHAIN 'C' AND (RESID 164 THROUGH 213 )
8X-RAY DIFFRACTION8CHAIN 'D' AND (RESID 1 THROUGH 33 )
9X-RAY DIFFRACTION9CHAIN 'D' AND (RESID 34 THROUGH 75 )
10X-RAY DIFFRACTION10CHAIN 'D' AND (RESID 76 THROUGH 87 )
11X-RAY DIFFRACTION11CHAIN 'D' AND (RESID 88 THROUGH 119 )
12X-RAY DIFFRACTION12CHAIN 'D' AND (RESID 120 THROUGH 145 )
13X-RAY DIFFRACTION13CHAIN 'D' AND (RESID 146 THROUGH 188 )
14X-RAY DIFFRACTION14CHAIN 'D' AND (RESID 189 THROUGH 213 )
15X-RAY DIFFRACTION15CHAIN 'B' AND (RESID 1 THROUGH 18 )
16X-RAY DIFFRACTION16CHAIN 'B' AND (RESID 19 THROUGH 102 )
17X-RAY DIFFRACTION17CHAIN 'B' AND (RESID 103 THROUGH 113 )
18X-RAY DIFFRACTION18CHAIN 'B' AND (RESID 114 THROUGH 128 )
19X-RAY DIFFRACTION19CHAIN 'B' AND (RESID 129 THROUGH 150 )
20X-RAY DIFFRACTION20CHAIN 'B' AND (RESID 151 THROUGH 213 )
21X-RAY DIFFRACTION21CHAIN 'A' AND (RESID 1 THROUGH 17 )
22X-RAY DIFFRACTION22CHAIN 'A' AND (RESID 18 THROUGH 33 )
23X-RAY DIFFRACTION23CHAIN 'A' AND (RESID 34 THROUGH 45 )
24X-RAY DIFFRACTION24CHAIN 'A' AND (RESID 46 THROUGH 75 )
25X-RAY DIFFRACTION25CHAIN 'A' AND (RESID 76 THROUGH 87 )
26X-RAY DIFFRACTION26CHAIN 'A' AND (RESID 88 THROUGH 119 )
27X-RAY DIFFRACTION27CHAIN 'A' AND (RESID 120 THROUGH 134 )
28X-RAY DIFFRACTION28CHAIN 'A' AND (RESID 135 THROUGH 157 )
29X-RAY DIFFRACTION29CHAIN 'A' AND (RESID 158 THROUGH 188 )
30X-RAY DIFFRACTION30CHAIN 'A' AND (RESID 189 THROUGH 214 )
31X-RAY DIFFRACTION31CHAIN 'G' AND (RESID 2 THROUGH 6 )
32X-RAY DIFFRACTION32CHAIN 'G' AND (RESID 7 THROUGH 14 )
33X-RAY DIFFRACTION33CHAIN 'I' AND (RESID 2 THROUGH 6 )
34X-RAY DIFFRACTION34CHAIN 'I' AND (RESID 7 THROUGH 14 )

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る