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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6aiq | ||||||
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タイトル | High resolution structure of recombinant high-potential iron-sulfur protein | ||||||
![]() | High-potential iron-sulfur protein | ||||||
![]() | METAL BINDING PROTEIN / IRON-SULFUR PROTEIN / METAL-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() aerobic electron transport chain / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / electron transfer activity / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Hanazono, Y. / Takeda, K. / Miki, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Characterization of perdeuterated high-potential iron-sulfur protein with high-resolution X-ray crystallography. 著者: Hanazono, Y. / Takeda, K. / Miki, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 72.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 52.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8793.851 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: hip / 発現宿主: ![]() ![]() | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-SF4 / | ||||
#3: 化合物 | ChemComp-SO4 / #4: 化合物 | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.75 Å3/Da / 溶媒含有率: 29.65 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 4.5 / 詳細: 1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M Na citrate pH 4.5 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2015年6月13日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.7 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 0.85→50 Å / Num. obs: 56295 / % possible obs: 98.3 % / 冗長度: 6.2 % / Rsym value: 0.082 / Net I/σ(I): 17.2 |
反射 シェル | 解像度: 0.85→0.86 Å / 冗長度: 4.1 % / Mean I/σ(I) obs: 5 / Rsym value: 0.188 / % possible all: 82.6 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 3A39 解像度: 0.85→36.32 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 0.85→36.32 Å
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