登録情報 | データベース: PDB / ID: 5zyv |
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タイトル | Crystal structure of human MGME1 with single strand DNA2 and Ca2+ |
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要素 | - DNA (5'-D(P*CP*AP*AP*CP*AP*AP*T)-3')
- Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1
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キーワード | DNA BINDING PROTEIN/DNA / humanMGME1 / DNA complex / DNA nuclease / DNA BINDING PROTEIN / DNA BINDING PROTEIN-DNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
single-stranded DNA exodeoxyribonuclease activity / single-stranded DNA 5'-3' DNA exonuclease activity / mitochondrial DNA replication / mitochondrial genome maintenance / mitochondrial DNA repair / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / mitochondrion類似検索 - 分子機能 PD-(D/E)XK endonuclease-like domain, AddAB-type / PD-(D/E)XK nuclease superfamily / PD-(D/E)XK endonuclease-like domain superfamily / Restriction endonuclease type II-like類似検索 - ドメイン・相同性 ACETATE ION / DNA / DNA (> 10) / Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) unidentified (未定義) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.72 Å |
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データ登録者 | Yang, C. / Gan, J. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2018 タイトル: Structural insights into DNA degradation by human mitochondrial nuclease MGME1 著者: Yang, C. / Wu, R. / Liu, H. / Chen, Y. / Gao, Y. / Chen, X. / Li, Y. / Ma, J. / Li, J. / Gan, J. |
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履歴 | 登録 | 2018年5月28日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2018年9月19日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年10月31日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2018年11月28日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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