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- PDB-5yi7: Crystal structure of drosophila Numb PTB domain and Pon peptide c... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 5yi7
タイトルCrystal structure of drosophila Numb PTB domain and Pon peptide complex
要素
  • Pon peptide from Partner of numb
  • Protein numb
キーワードCELL CYCLE / Numb PTB domain and Pon complex
機能・相同性
機能・相同性情報


pericardial nephrocyte differentiation / Malpighian tubule tip cell differentiation / enteroendocrine cell differentiation / regulation of nervous system development / sensory organ precursor cell fate determination / sensory organ precursor cell division / neuroblast development / muscle cell fate specification / regulation of asymmetric cell division / regulation of neuroblast proliferation ...pericardial nephrocyte differentiation / Malpighian tubule tip cell differentiation / enteroendocrine cell differentiation / regulation of nervous system development / sensory organ precursor cell fate determination / sensory organ precursor cell division / neuroblast development / muscle cell fate specification / regulation of asymmetric cell division / regulation of neuroblast proliferation / glial cell migration / asymmetric neuroblast division / negative regulation of receptor recycling / basal part of cell / embryonic heart tube development / Notch binding / centrosome localization / negative regulation of neuroblast proliferation / positive regulation of endocytosis / regulation of neurogenesis / neuroblast proliferation / negative regulation of Notch signaling pathway / intracellular protein localization / cell cortex / negative regulation of gene expression / ATP binding / nucleus / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
NUMB domain / Numb/numb-like / NUMB domain / Phosphotyrosine interaction domain (PTB/PID) / Phosphotyrosine interaction domain (PID) profile. / Phosphotyrosine-binding domain, phosphotyrosine-interaction (PI) domain / PTB/PI domain / Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB) / PH-domain like / PH-like domain superfamily ...NUMB domain / Numb/numb-like / NUMB domain / Phosphotyrosine interaction domain (PTB/PID) / Phosphotyrosine interaction domain (PID) profile. / Phosphotyrosine-binding domain, phosphotyrosine-interaction (PI) domain / PTB/PI domain / Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB) / PH-domain like / PH-like domain superfamily / Roll / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Protein numb / Partner of numb
類似検索 - 構成要素
生物種Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.7 Å
Model detailsDrosophila Numb PTB recognizes repeating motifs in the N terminus of Pon
データ登録者Shan, Z. / Wen, W.
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2018
タイトル: Basal condensation of Numb and Pon complex via phase transition during Drosophila neuroblast asymmetric division.
著者: Shan, Z. / Tu, Y. / Yang, Y. / Liu, Z. / Zeng, M. / Xu, H. / Long, J. / Zhang, M. / Cai, Y. / Wen, W.
履歴
登録2017年10月3日登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.02018年4月18日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12023年11月22日Group: Data collection / Database references / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: Protein numb
B: Pon peptide from Partner of numb
C: Protein numb
D: Pon peptide from Partner of numb
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)40,0426
ポリマ－39,8584
非ポリマー1842
水2,792155
1
A: Protein numb
B: Pon peptide from Partner of numb
ヘテロ分子

A: Protein numb
B: Pon peptide from Partner of numb
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)40,0426
ポリマ－39,8584
非ポリマー1842
水724
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
crystal symmetry operation5_655-x+y+1,y,-z+1/31
Buried area4170 Å2
ΔGint-33 kcal/mol
Surface area14270 Å2
手法PISA
2
C: Protein numb
D: Pon peptide from Partner of numb
ヘテロ分子

C: Protein numb
D: Pon peptide from Partner of numb
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)40,0426
ポリマ－39,8584
非ポリマー1842
水724
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
crystal symmetry operation4_775-y+2,-x+2,-z+2/31
Buried area4130 Å2
ΔGint-35 kcal/mol
Surface area14450 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)65.593, 65.593, 143.879
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number151
Space group name H-MP3112
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID詳細
11(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...
21(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...
12(chain A and (resid 72 or (resid 73 and (name...
22(chain C and (resid 72 through 103 or (resid 104...

NCSドメイン領域:
Dom-IDComponent-IDEns-IDBeg auth comp-IDBeg label comp-IDEnd auth comp-IDEnd label comp-IDSelection detailsAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
111ASNASNLEULEU(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1237 - 12
121ARGARGARGARG(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB12413
131ASNASNASNASN(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1437 - 32
141ASNASNASNASN(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1437 - 32
151ASNASNASNASN(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1437 - 32
161ASNASNASNASN(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1437 - 32
171ASNASNASNASN(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1437 - 32
181ASNASNASNASN(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1437 - 32
191ASNASNASNASN(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1437 - 32
1101ASNASNASNASN(chain B and (resid 118 through 123 or (resid 124...BB118 - 1437 - 32
211ASNASNALAALA(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD118 - 1357 - 24
221PHEPHEPHEPHE(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD13726
231GLUGLUGLUGLU(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD13827
241ASNASNASNASN(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD118 - 1437 - 32
251ASNASNASNASN(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD118 - 1437 - 32
261ASNASNASNASN(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD118 - 1437 - 32
271ASNASNASNASN(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD118 - 1437 - 32
281ASNASNASNASN(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD118 - 1437 - 32
291ASNASNASNASN(chain D and (resid 118 through 135 or resid 137...DD118 - 1437 - 32
112ASPASPASPASP(chain A and (resid 72 or (resid 73 and (name...AA7210
122GLUGLUGLUGLU(chain A and (resid 72 or (resid 73 and (name...AA7311
132ASPASPARGARG(chain A and (resid 72 or (resid 73 and (name...AA72 - 20110 - 139
142ASPASPARGARG(chain A and (resid 72 or (resid 73 and (name...AA72 - 20110 - 139
152ASPASPARGARG(chain A and (resid 72 or (resid 73 and (name...AA72 - 20110 - 139
162ASPASPARGARG(chain A and (resid 72 or (resid 73 and (name...AA72 - 20110 - 139
172ASPASPARGARG(chain A and (resid 72 or (resid 73 and (name...AA72 - 20110 - 139
212ASPASPGLUGLU(chain C and (resid 72 through 103 or (resid 104...CC72 - 10310 - 41
222GLUGLUALAALA(chain C and (resid 72 through 103 or (resid 104...CC104 - 10542 - 43
232TRPTRPARGARG(chain C and (resid 72 through 103 or (resid 104...CC69 - 2017 - 139
242TRPTRPARGARG(chain C and (resid 72 through 103 or (resid 104...CC69 - 2017 - 139
252TRPTRPARGARG(chain C and (resid 72 through 103 or (resid 104...CC69 - 2017 - 139
262TRPTRPARGARG(chain C and (resid 72 through 103 or (resid 104...CC69 - 2017 - 139

NCSアンサンブル:
ID
1
2

-
要素

#1: タンパク質 Protein numb


分子量: 15905.161 Da / 分子数: 2 / 断片: PTB domain / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ)
遺伝子: numb, CG3779 / プラスミド: pETM3C / 発現宿主: Escherichia coli BL21 (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: P16554
#2: タンパク質・ペプチド Pon peptide from Partner of numb / RE65495p


分子量: 4023.658 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成
由来: (合成) Drosophila melanogaster (キイロショウジョウバエ)
参照: UniProt: Q9W4I7
#3: 化合物 ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル


分子量: 92.094 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C3H8O3 / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#4: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 155 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.46 Å3/Da / 溶媒含有率: 45.13 % / Mosaicity: 0.396 °
結晶化温度: 289 K / 手法: 蒸発脱水法 / pH: 4.3 / 詳細: 0,2M MgCl2.6H2O,25% PEG 3350,0.1M Bis-Tris

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SSRF / ビームライン: BL17U1 / 波長: 0.9792 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2015年7月3日
放射モノクロメーター: double crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.9792 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.7→50 Å / Num. obs: 39132 / % possible obs: 99.3 % / 冗長度: 9.8 % / Biso Wilson estimate: 24.29 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.056 / Rpim(I) all: 0.018 / Rrim(I) all: 0.059 / Χ2: 1.736 / Net I/σ(I): 12.7 / Num. measured all: 384771
反射 シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)冗長度 (%)Rmerge(I) obsNum. unique obsCC1/2Rpim(I) allRrim(I) allΧ2% possible all
1.7-1.739.40.79519160.8750.260.8381.36197.7
1.73-1.769.70.69418880.870.2240.731.24497.5
1.76-1.799.60.52818980.9190.1710.5561.2797.9
1.79-1.839.40.45319500.9230.1490.4781.28298.5
1.83-1.879.60.41319300.9570.1350.4351.31398.6
1.87-1.919.40.38719140.9630.1290.4091.72299.2
1.91-1.969.40.28519460.9670.0960.3021.68499.5
1.96-2.029.60.19319360.9890.0640.2031.37599.8
2.02-2.079.40.19519550.9850.0660.2061.8399.6
2.07-2.149.70.13419520.9940.0440.1411.542100
2.14-2.229.90.11219690.9950.0370.1181.494100
2.22-2.319.70.10119550.9980.0340.1071.88199.9
2.31-2.4110.10.08719820.9970.0280.0911.72799.9
2.41-2.5410.20.08619770.9970.0280.0912.064100
2.54-2.7100.08219430.9970.0270.0872.53999.9
2.7-2.91100.06819850.9980.0230.0722.598100
2.91-3.29.90.0619850.9980.020.0632.952100
3.2-3.6610.40.04420110.9990.0140.0462.278100
3.66-4.6110.70.02919970.9990.0090.031.344100
4.61-5010.60.02620430.9990.0090.0281.197.7

-
位相決定

位相決定手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX(1.11.1_2575: ???)精密化
HKL-2000データ収集
HKL-2000データスケーリング
PHASER位相決定
PDB_EXTRACT3.22データ抽出
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 3F0W

3f0w


解像度: 1.7→27.865 Å / SU ML: 0.17 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 22.21
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2176 1949 4.99 %
Rwork0.1938 --
obs0.1949 39041 99.23 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
原子変位パラメータBiso max: 62.52 Å2 / Biso mean: 29.3111 Å2 / Biso min: 16.17 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 1.7→27.865 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数2155 0 12 155 2322
Biso mean--38.18 32.91 -
残基数----293
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0112210
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d1.1382979
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.075342
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.008381
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d3.1091737
Refine LS restraints NCS
Ens-IDDom-IDAuth asym-ID数Refine-IDRmsタイプ
11B130X-RAY DIFFRACTION0.844TORSIONAL
12D130X-RAY DIFFRACTION0.844TORSIONAL
21A1092X-RAY DIFFRACTION0.844TORSIONAL
22C1092X-RAY DIFFRACTION0.844TORSIONAL
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 14

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkNum. reflection all% reflection obs (%)
1.7001-1.74260.30341340.24612566270097
1.7426-1.78970.27271300.21552596272698
1.7897-1.84240.27321470.21342588273598
1.8424-1.90180.23431360.21652609274599
1.9018-1.96980.23591260.20322658278499
1.9698-2.04860.22261320.192226782810100
2.0486-2.14180.23631460.185426062752100
2.1418-2.25470.23021510.188326642815100
2.2547-2.39590.21721330.183226552788100
2.3959-2.58080.24341480.20126542802100
2.5808-2.84030.19961620.209626572819100
2.8403-3.25070.19961490.196826822831100
3.2507-4.09350.21091370.181827192856100
4.0935-27.86860.20071180.18842760287898
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
14.94965.0719-4.81036.4768-3.29156.7281-0.49520.07530.01650.21850.38060.17740.2436-1.0462-0.6510.27080.1369-0.13790.50430.12530.26271.990164.022437.8649
22.99044.90931.52718.96770.36397.62980.06940.3728-0.7124-0.6441-0.0822-1.00781.02030.58180.02310.38870.12180.01150.31770.02780.352421.761178.235731.6673
32.4349-1.44730.37844.50851.44934.36360.05640.1712-0.1167-0.2775-0.09170.10110.16450.05610.06550.0701-0.00230.03980.1383-0.01730.144318.750250.973431.1044
45.8222-5.9385.49086.4552-6.03845.7920.17940.56040.29670.0298-0.6249-0.707-0.18150.77640.38730.24970.02740.04680.25310.00410.279524.844851.964926.0979
54.2323-0.8809-1.96945.3132-0.85078.0630.05850.15640.22240.1244-0.00450.0531-0.3883-0.1011-0.07850.13620.01680.00570.1642-0.02610.215712.891157.576538.8598
68.1262-4.68230.53872.7232-0.19372.81310.11820.25330.0234-0.1267-0.12660.5938-0.20550.00930.01510.18690.02070.0050.2235-0.02780.22417.862758.05737.1633
74.7744-0.51020.07364.52910.77732.30930.05140.05480.2623-0.0971-0.0194-0.39640.05080.2403-0.02580.18070.04110.03470.1567-0.03390.192324.01149.290935.3788
80.8914-1.0185-1.83945.34920.06754.7799-0.10140.1108-0.2424-0.1915-0.05140.5485-0.0005-0.66580.19120.17420.01940.03220.2319-0.04750.245114.246245.596431.2571
96.77763.30433.67695.19765.75577.52670.0629-0.00320.0797-0.3639-0.0888-0.1487-0.2205-0.19260.05720.15970.02410.01510.1805-0.01050.239419.074253.403633.3663
105.47880.81-0.67685.3717-2.51976.028-0.0964-0.4144-0.09240.44610.3358-0.08290.5010.23-0.17990.25090.08660.00060.1736-0.04350.163320.059946.844246.1943
118.56645.4767-0.99526.7411-4.62998.18730.0025-0.4025-0.50920.6055-0.4643-0.8984-0.8051.15920.27430.3818-0.1221-0.09350.40570.02440.25455.66954.959122.847
123.64410.50780.2480.5328-1.46055.4480.42720.24960.0332-0.3109-0.2774-0.1183-0.79880.6462-1.21440.4455-0.00610.04420.1237-0.19980.288240.733948.749234.037
138.46822.4725-1.92455.9191-0.85937.4721-0.062-0.54280.05010.70770.29970.62220.7920.1792-0.18570.36330.05070.04010.1883-0.00510.273819.466739.322140.4308
141.7064-0.96340.55753.1666-1.40025.84930.0273-0.0181-0.0049-0.04970.05470.21880.3232-0.014-0.07920.21-0.0206-0.04070.15840.01430.266310.283283.55436.5378
151.5672-0.86640.62113.9873-0.92112.3880.0825-0.04080.0464-0.0155-0.07410.08490.00540.0577-0.00750.1470.0127-0.01510.12850.02370.183512.483887.114634.4604
166.9993-3.3728-7.20787.09930.40199.391-0.5650.8112-1.1437-0.45380.050.5090.8759-1.08780.30140.29-0.088-0.00860.5207-0.05110.2755-9.844555.005449.121
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'D' and (resid 123 through 136 )D123 - 136
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'D' and (resid 137 through 143 )D137 - 143
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 82 through 98 )A82 - 98
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 99 through 111 )A99 - 111
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 112 through 132 )A112 - 132
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 133 through 143 )A133 - 143
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'A' and (resid 144 through 158 )A144 - 158
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'A' and (resid 159 through 170 )A159 - 170
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'A' and (resid 171 through 183 )A171 - 183
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'A' and (resid 184 through 201 )A184 - 201
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resid 118 through 122 )B118 - 122
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'B' and (resid 123 through 136 )B123 - 136
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'B' and (resid 137 through 143 )B137 - 143
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'C' and (resid 69 through 111 )C69 - 111
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'C' and (resid 112 through 201 )C112 - 201
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'D' and (resid 118 through 122 )D118 - 122

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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