+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5yhi | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of YiiM from Escherichia coli | ||||||
Components | Protein YiiM | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / enzyme / MOSC | ||||||
Function / homology | Function and homology information toxin catabolic process / oxidoreductase activity, acting on other nitrogenous compounds as donors / molybdenum ion binding / response to toxic substance / pyridoxal phosphate binding / protein homodimerization activity / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Escherichia coli (E. coli) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.85 Å | ||||||
Authors | Namgung, B. / Kim, J.H. / Song, W.S. / Yoon, S.I. | ||||||
Citation | Journal: Sci Rep / Year: 2018 Title: Crystal structure of the hydroxylaminopurine resistance protein, YiiM, and its putative molybdenum cofactor-binding catalytic site. Authors: Namgung, B. / Kim, J.H. / Song, W.S. / Yoon, S.I. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5yhi.cif.gz | 174.3 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb5yhi.ent.gz | 138.7 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5yhi.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 5yhi_validation.pdf.gz | 1008.4 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 5yhi_full_validation.pdf.gz | 1010.1 KB | Display | |
Data in XML | 5yhi_validation.xml.gz | 15.4 KB | Display | |
Data in CIF | 5yhi_validation.cif.gz | 20.2 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yh/5yhi ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yh/5yhi | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 5yhhC 1o65S C: citing same article (ref.) S: Starting model for refinement |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
|