登録情報 | データベース: PDB / ID: 5yac |
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タイトル | Crystal structure of WT Trm5b from Pyrococcus abyssi |
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要素 | tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase Trm5b |
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キーワード | RNA BINDING PROTEIN / tRNA Methyltransferase / open conformation / wyosine biosynthesis / tRNA maturation |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
: / tRNA (guanine37-N1)-methyltransferase / tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase activity / tRNA methylation / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Alpha-Beta Plaits - #2580 / tRNA methyltransferase 5, N-terminal / tRNA methyltransferase 5 N-terminal domain / SAM-dependent methyltransferase TRM5/TYW2-type domain profile. / SAM-dependent methyltransferase TRM5/TYW2-type / Met-10+ like-protein / Vaccinia Virus protein VP39 / Alpha-Beta Plaits / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold ...Alpha-Beta Plaits - #2580 / tRNA methyltransferase 5, N-terminal / tRNA methyltransferase 5 N-terminal domain / SAM-dependent methyltransferase TRM5/TYW2-type domain profile. / SAM-dependent methyltransferase TRM5/TYW2-type / Met-10+ like-protein / Vaccinia Virus protein VP39 / Alpha-Beta Plaits / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase Trm5b類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Pyrococcus abyssi (古細菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 3.3 Å |
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データ登録者 | Xie, W. / Wu, J. |
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資金援助 | 中国, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Fundamental Research Funds for the Central Universities | 16lgjc76 | 中国 | Science and Technology Program of Guangzhou | 201504010025 | 中国 | Science and Technology Program of Guangzhou | 201605030012 | 中国 |
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引用 | ジャーナル: Biochem. Biophys. Res. Commun. / 年: 2017 タイトル: The crystal structure of the Pyrococcus abyssi mono-functional methyltransferase PaTrm5b 著者: Wu, J. / Jia, Q. / Wu, S. / Zeng, H. / Sun, Y. / Wang, C. / Ge, R. / Xie, W. |
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履歴 | 登録 | 2017年8月31日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2017年9月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年10月4日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_PubMed |
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改定 1.2 | 2017年10月18日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2018年7月18日 | Group: Data collection / カテゴリ: diffrn_source / Item: _diffrn_source.source |
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改定 1.4 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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