[English] 日本語
Yorodumi- PDB-5y9n: Crystal structure of Pyrococcus furiosus PbaA (monoclinic form), ... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5y9n | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Crystal structure of Pyrococcus furiosus PbaA (monoclinic form), an archaeal homolog of proteasome-assembly chaperone | |||||||||||||||
Components | PbaA | |||||||||||||||
Keywords | CHAPERONE / PROTEASOME / PROTEASOME ACTIVATOR / PROTEASOME ASSEMBLY CHAPERONE | |||||||||||||||
Function / homology | Conserved hypothetical protein CHP00061 / PAC-like subunit / Proteasome assembly chaperone 2 / Proteasome assembly chaperone 2 superfamily / PAC2 family / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta / Proteasome assembly chaperone family protein Function and homology information | |||||||||||||||
Biological species | Pyrococcus furiosus (archaea) | |||||||||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.55 Å | |||||||||||||||
Authors | Yagi-Utsumi, M. / Sikdar, A. / Kozai, T. / Inoue, R. / Sugiyama, M. / Uchihashi, T. / Satoh, T. / Kato, K. | |||||||||||||||
Funding support | Japan, 4items
| |||||||||||||||
Citation | Journal: Protein Eng. Des. Sel. / Year: 2018 Title: Conversion of functionally undefined homopentameric protein PbaA into a proteasome activator by mutational modification of its C-terminal segment conformation Authors: Yagi-Utsumi, M. / Sikdar, A. / Kozai, T. / Inoue, R. / Sugiyama, M. / Uchihashi, T. / Yagi, H. / Satoh, T. / Kato, K. | |||||||||||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5y9n.cif.gz | 462.6 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb5y9n.ent.gz | 381 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5y9n.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 5y9n_validation.pdf.gz | 508.8 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 5y9n_full_validation.pdf.gz | 535.6 KB | Display | |
Data in XML | 5y9n_validation.xml.gz | 78.4 KB | Display | |
Data in CIF | 5y9n_validation.cif.gz | 103.8 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y9/5y9n ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y9/5y9n | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 3wz2S S: Starting model for refinement |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
|