登録情報 | データベース: PDB / ID: 5wt6 |
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タイトル | Cysteine persulfide intermediate of NifS from Helicobacter pylori |
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要素 | Cysteine desulfurase IscS |
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キーワード | TRANSFERASE / Iron-sulfur cluster biogenesis / cysteine desulfurase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
cysteine desulfurase / cysteine desulfurase activity / cysteine metabolic process / [2Fe-2S] cluster assembly / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / pyridoxal phosphate binding / metal ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Cysteine desulfurase NifS, proteobacteria / Cysteine desulfurase IscS / Cysteine desulfurase / Aminotransferase class V domain / Aminotransferase class-V / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase ...Cysteine desulfurase NifS, proteobacteria / Cysteine desulfurase IscS / Cysteine desulfurase / Aminotransferase class V domain / Aminotransferase class-V / Aspartate Aminotransferase; domain 2 / Type I PLP-dependent aspartate aminotransferase-like (Major domain) / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain / Pyridoxal phosphate-dependent transferase / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ISOPROPYL ALCOHOL / Chem-PDA / Cysteine desulfurase IscS類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Helicobacter pylori (ピロリ菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.3 Å |
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データ登録者 | Fujishiro, T. / Nakamura, R. / Takahashi, Y. |
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資金援助 | 日本, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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JSPS | 15H04472 | 日本 | JSPS | 15H06085 | 日本 | the Sumitomo Foundation | 163037 | 日本 |
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引用 | ジャーナル: To be published タイトル: Structural snapshot of cysteine desulfurase NifS with L-cysteine in initiation of catalysis 著者: Fujishiro, T. / Nakamura, R. / Takahashi, Y. |
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履歴 | 登録 | 2016年12月9日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2017年12月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag |
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改定 1.2 | 2023年11月15日 | Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item: _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2 |
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