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- PDB-5w6j: Agrobacterium tumefaciens ADP-glucose pyrophosphorylase -

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基本情報

登録情報

データベース: PDB / ID: 5w6j

タイトル

Agrobacterium tumefaciens ADP-glucose pyrophosphorylase

要素

Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

キーワード

TRANSFERASE / Glucose-1-phosphate adenylyltransferase / glycogen biosynthesis / starch biosynthesis / allosterism

機能・相同性

機能・相同性情報

glucose-1-phosphate adenylyltransferase / glucose-1-phosphate adenylyltransferase activity / glycogen biosynthetic process / ATP binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Rhizobium radiobacter (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン / 解像度: 1.78 Å

データ登録者

Mascarenhas, R.N. / Hill, B.L. / Wu, R. / Ballicora, M.A. / Liu, D.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: J. Biol. Chem. / 年: 2019
タイトル: Structural analysis reveals a pyruvate-binding activator site in theAgrobacterium tumefaciensADP-glucose pyrophosphorylase.
著者: Hill, B.L. / Mascarenhas, R. / Patel, H.P. / Asencion Diez, M.D. / Wu, R. / Iglesias, A.A. / Liu, D. / Ballicora, M.A.

履歴

登録	2017年6月16日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2018年11月14日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年11月21日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_DOI ..._citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name
改定 1.2	2019年2月20日	Group: Author supporting evidence / Data collection / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2019年11月27日	Group: Author supporting evidence / Database references / カテゴリ: citation / pdbx_audit_support Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.year / _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2024年3月13日	Group: Advisory / Data collection / Database references カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

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構造の表示

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロードとリンク

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PDBx/mmCIF形式	5w6j.cif.gz	3.3 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5w6j.ent.gz	2.8 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5w6j.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5w6j_validation.pdf.gz	640.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5w6j_full_validation.pdf.gz	853.1 KB	表示
XML形式データ	5w6j_validation.xml.gz	427.2 KB	表示
CIF形式データ	5w6j_validation.cif.gz	629.8 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w6/5w6j ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/w6/5w6j	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5w5rC 5w5tC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6v96-3 6v99-3 6v99-2 6v96-5 6v96-4 6v96-2 5w5t-2 5w5t-3 5w5r-2 5w5r-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#156 - 2012年12月 ABO式血液型糖転移酵素 (ABO Blood Type Glycosyltransferases) 類似性 (1) #254 - 2021年2月セルロース合成酵素 (Cellulose Synthase) 類似性 (1) #165 - 2013年9月人工設計されたタンパク質製の籠 (Designed Protein Cages) 類似性 (1) #39 - 2003年3月 lac転写抑制因子 (lac Repressor) 類似性 (1) #49 - 2004年1月炭酸脱水酵素 (Carbonic Anhydrase) 類似性 (1)

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PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#156 - 2012年12月
ABO式血液型糖転移酵素 (ABO Blood Type Glycosyltransferases)
類似性 (1)
#254 - 2021年2月
セルロース合成酵素 (Cellulose Synthase)
類似性 (1)
#165 - 2013年9月
人工設計されたタンパク質製の籠 (Designed Protein Cages)
類似性 (1)
#39 - 2003年3月
lac転写抑制因子 (lac Repressor)
類似性 (1)
#49 - 2004年1月
炭酸脱水酵素 (Carbonic Anhydrase)
類似性 (1)

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集合体

登録構造単位

A: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

B: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

C: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

D: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

E: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

H: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

I: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

J: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

K: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

L: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

N: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

O: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

P: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

Q: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

R: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

F: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

G: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

M: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

T: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

U: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

946 kDa, 20 ポリマー
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A: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

E: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

P: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

O: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
189 kDa, 4 ポリマー
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B: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

D: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

K: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

M: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
189 kDa, 4 ポリマー
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C: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

H: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

I: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

G: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
189 kDa, 4 ポリマー
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L: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

R: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

J: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

N: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
189 kDa, 4 ポリマー
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Q: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

F: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

T: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

U: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
189 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	93.439, 140.685, 228.490
Angle α, β, γ (deg.)	72.04, 78.19, 89.98
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

-
要素

#1: タンパク質	Glucose-1-phosphate adenylyltransferase / ADP-glucose pyrophosphorylase / ADPGlc PPase / ADP-glucose synthase 分子量: 47101.156 Da / 分子数: 20 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Rhizobium radiobacter (バクテリア) 遺伝子: glgC / 発現宿主: Escherichia coli K-12 (大腸菌) 参照: UniProt: P39669, glucose-1-phosphate adenylyltransferase
#2: 化合物	... ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 42 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 11196 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

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実験情報

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.96 Å³/Da / 溶媒含有率: 58.51 %
結晶化	温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 50mM HEPES pH 7.5, 1.5M Li2SO4

-
データ収集

回折

平均測定温度: 80 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 19-ID / 波長: 0.98 Å

検出器

タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2015年4月15日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.98 Å / 相対比: 1

Reflection twin

Operator: h,-k,h-l / Fraction: 0.45

反射

解像度: 1.78→50 Å / Num. obs: 1003131 / % possible obs: 97.3 % / 冗長度: 2 % / R_merge(I) obs: 0.049 / R_pim(I) all: 0.049 / R_rim(I) all: 0.067 / Χ²: 1.077 / Net I/σ(I): 8.2 / Num. measured all: 1967391

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	CC_1/2	R_pim(I) all	Χ²	% possible all	R_rim(I) all
1.78-1.81	2	0.729	0.561	0.729	1.047	96.1
1.81-1.84	2	0.612	0.628	0.612	1.072	96.2	0.866
1.84-1.88	2	0.495	0.754	0.495	1.072	96.4	0.701
1.88-1.92	2	0.398	0.811	0.398	1.092	96.5	0.562
1.92-1.96	2	0.311	0.876	0.311	1.078	96.6	0.44
1.96-2	2	0.255	0.901	0.255	1.087	96.8	0.361
2-2.05	2	0.205	0.941	0.205	1.116	97	0.29
2.05-2.11	2	0.169	0.956	0.169	1.121	97.1	0.239
2.11-2.17	2	0.14	0.972	0.14	1.159	97.2	0.198
2.17-2.24	2	0.115	0.978	0.115	1.12	97.4	0.162
2.24-2.32	2	0.093	0.988	0.093	1.129	97.6	0.132
2.32-2.42	2	0.082	0.989	0.082	1.134	97.7	0.117
2.42-2.53	2	0.07	0.991	0.07	1.122	97.9	0.1
2.53-2.66	2	0.062	0.992	0.062	1.063	98.1	0.088
2.66-2.83	2	0.052	0.994	0.052	1.068	98.2	0.074
2.83-3.04	2	0.044	0.995	0.044	1.017	98.3	0.062
3.04-3.35	2	0.038	0.996	0.038	1.055	98.3	0.054
3.35-3.83	1.9	0.034	0.996	0.034	0.978	98.3	0.048
3.83-4.83	1.9	0.027	0.997	0.027	1.045	97.7	0.038
4.83-50	2	0.023	0.998	0.023	0.961	95.8	0.032

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.11.1_2575	精密化
HKL-3000		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.22	データ抽出
HKL-3000		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

解像度: 1.78→36.55 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 69.51 / 位相誤差: 25.69

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.229	2036	0.2 %
R_work	0.2	-	-
obs	0.202	1003101	97 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso mean: 33.58 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.78→36.55 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	64436	0	210	11196	75842

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	66376
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.763	90245
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	3.309	49898
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.051	9832
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	11835

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.7831-1.8277	0.2944	140	0.3498	70155	X-RAY DIFFRACTION	95
1.8277-1.8771	0.3638	136	0.3263	70764	X-RAY DIFFRACTION	96
1.8771-1.9324	0.3684	144	0.2997	70814	X-RAY DIFFRACTION	96
1.9324-1.9947	0.2888	141	0.2789	71028	X-RAY DIFFRACTION	97
1.9947-2.066	0.2296	137	0.2524	71262	X-RAY DIFFRACTION	97
2.066-2.1487	0.2761	145	0.2453	71366	X-RAY DIFFRACTION	97
2.1487-2.2465	0.2592	145	0.2355	71525	X-RAY DIFFRACTION	97
2.2465-2.3649	0.2731	142	0.2258	71589	X-RAY DIFFRACTION	97
2.3649-2.513	0.2575	140	0.2258	72100	X-RAY DIFFRACTION	98
2.513-2.7069	0.2313	150	0.2138	71884	X-RAY DIFFRACTION	98
2.7069-2.9791	0.2091	139	0.1938	72187	X-RAY DIFFRACTION	98
2.9791-3.4096	0.1726	143	0.1688	72262	X-RAY DIFFRACTION	98
3.4096-4.2939	0.1953	144	0.1425	72140	X-RAY DIFFRACTION	98
4.2939-30.4235	0.2288	136	0.1832	70827	X-RAY DIFFRACTION	96

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.2939	-0.3527	-0.4189	2.878	1.0007	2.1472	0.1014	-0.1492	-0.058	0.4945	-0.0817	0.0077	-0.0201	-0.007	-0.038	0.4059	-0.0833	-0.0299	0.1216	0.0064	0.2311	-3.0458	8.8927	-28.4671
2	0.9092	0.6613	0.7659	1.8742	0.8455	1.2444	0.2123	-0.1617	-0.2222	0.5045	-0.0422	-0.4663	0.1228	0.0803	-0.1396	0.455	-0.0545	-0.1095	0.1934	0.0076	0.3328	10.2796	7.1073	-25.6081
3	1.6523	-0.23	0.0327	0.372	-1.2025	4.0558	0.1741	-0.6008	-0.259	0.7031	-0.1054	-0.1582	0.334	0.0925	-0.2208	0.7121	-0.1169	-0.2311	0.3629	0.0489	0.4492	11.3151	-1.8477	-16.6747
4	3.2953	-0.5566	0.3237	1.607	0.5339	2.6864	0.2389	-0.041	0.046	0.295	-0.0967	-0.3502	0.0999	0.1456	-0.1524	0.4361	-0.0772	-0.0864	0.1491	-0.0519	0.3408	13.3642	14.4935	-29.1308
5	1.1076	-0.1894	0.4431	1.1508	0.1601	0.6016	0.0359	-0.1484	0.2122	0.2672	0.0074	0.0544	-0.2736	-0.1495	-0.021	0.514	0.0129	0.128	0.1656	-0.009	0.2711	-13.4642	31.0319	-30.7002
6	0.9523	-0.312	-0.4081	1.9319	0.3296	1.3251	-0.0331	0.0903	0.0426	-0.4581	0.1282	-0.4372	-0.1293	0.1333	-0.1176	0.3637	-0.0091	0.1003	0.1591	-0.0517	0.3591	-41.13	64.8494	-19.1558
7	1.9865	0.6119	-0.6098	2.1024	0.0873	1.257	-0.0477	0.1136	-0.1323	-0.2167	0.164	-0.6797	0.0342	0.1549	-0.1014	0.3382	0.0222	0.0419	0.166	-0.0815	0.4295	-40.1426	55.0264	-15.7532
8	1.3595	0.3463	-0.3066	1.6315	0.4041	2.7988	-0.1509	0.2407	-0.1139	-0.4109	0.1374	-0.03	0.1719	-0.201	0.0644	0.4021	-0.0503	-0.0761	0.1714	-0.0234	0.2386	-63.5092	37.9665	-16.3572
9	1.7674	0.7796	0.4361	2.7889	0.896	1.3703	0.1243	0.1924	0.1226	-0.3874	-0.0026	0.0036	-0.1339	0.0166	-0.1295	0.381	0.0655	0.0589	0.1191	0.0135	0.2243	-51.5041	62.0842	67.504
10	1.023	-0.6572	-0.6063	1.3655	0.7071	1.2286	0.1955	0.1228	0.18	-0.4383	-0.0712	-0.3045	-0.1908	0.0646	-0.0969	0.4489	0.034	0.1409	0.1685	0.0203	0.3264	-38.3211	64.6383	63.9201
11	1.6095	-0.1565	0.7219	1.3877	-0.6672	2.1124	0.0495	0.3492	0.1593	-0.3893	0.0332	-0.204	-0.1214	0.2159	-0.0772	0.5184	0.0137	0.1865	0.2311	0.0231	0.3993	-34.9203	70.1872	56.9403
12	0.9832	0.1721	-0.3296	1.2255	0.0807	0.7432	0.0743	0.1481	-0.1567	-0.266	-0.0381	0.0646	0.0385	-0.0954	-0.0326	0.3179	0.0348	-0.0748	0.1305	-0.0174	0.2214	-58.5566	41.345	70.8076
13	2.1839	1.4401	-0.3058	4.5553	-1.1161	2.0735	-0.0492	0.1879	-0.0663	-0.3985	0.1675	0.0863	0.0499	0.0074	-0.0743	0.2393	0.0214	-0.0495	0.0915	0.0257	0.2252	-70.0337	79.6225	-16.8405
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精密化 TLSグループ

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7	X-RAY DIFFRACTION	7	CHAIN 'B' AND (RESID 227 THROUGH 305 )
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10	X-RAY DIFFRACTION	10	CHAIN 'C' AND (RESID 82 THROUGH 209 )
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12	X-RAY DIFFRACTION	12	CHAIN 'C' AND (RESID 257 THROUGH 421 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	CHAIN 'D' AND (RESID 7 THROUGH 81 )
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20	X-RAY DIFFRACTION	20	CHAIN 'D' AND (RESID 372 THROUGH 421 )
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22	X-RAY DIFFRACTION	22	CHAIN 'E' AND (RESID 72 THROUGH 256 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	CHAIN 'E' AND (RESID 257 THROUGH 305 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	CHAIN 'E' AND (RESID 306 THROUGH 421 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	CHAIN 'H' AND (RESID 7 THROUGH 221 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	CHAIN 'H' AND (RESID 222 THROUGH 245 )
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29	X-RAY DIFFRACTION	29	CHAIN 'I' AND (RESID 72 THROUGH 171 )
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31	X-RAY DIFFRACTION	31	CHAIN 'I' AND (RESID 257 THROUGH 421 )
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33	X-RAY DIFFRACTION	33	CHAIN 'J' AND (RESID 97 THROUGH 153 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	CHAIN 'J' AND (RESID 154 THROUGH 209 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	CHAIN 'J' AND (RESID 210 THROUGH 255 )
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38	X-RAY DIFFRACTION	38	CHAIN 'J' AND (RESID 372 THROUGH 421 )
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60	X-RAY DIFFRACTION	60	CHAIN 'O' AND (RESID 112 THROUGH 134 )
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62	X-RAY DIFFRACTION	62	CHAIN 'O' AND (RESID 173 THROUGH 201 )
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67	X-RAY DIFFRACTION	67	CHAIN 'O' AND (RESID 372 THROUGH 421 )
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100	X-RAY DIFFRACTION	100	CHAIN 'G' AND (RESID 394 THROUGH 421 )
101	X-RAY DIFFRACTION	101	CHAIN 'M' AND (RESID 6 THROUGH 67 )
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104	X-RAY DIFFRACTION	104	CHAIN 'M' AND (RESID 202 THROUGH 247 )
105	X-RAY DIFFRACTION	105	CHAIN 'M' AND (RESID 248 THROUGH 285 )
106	X-RAY DIFFRACTION	106	CHAIN 'M' AND (RESID 286 THROUGH 340 )
107	X-RAY DIFFRACTION	107	CHAIN 'M' AND (RESID 341 THROUGH 421 )
108	X-RAY DIFFRACTION	108	CHAIN 'T' AND (RESID 7 THROUGH 71 )
109	X-RAY DIFFRACTION	109	CHAIN 'T' AND (RESID 72 THROUGH 112 )
110	X-RAY DIFFRACTION	110	CHAIN 'T' AND (RESID 113 THROUGH 255 )
111	X-RAY DIFFRACTION	111	CHAIN 'T' AND (RESID 256 THROUGH 305 )
112	X-RAY DIFFRACTION	112	CHAIN 'T' AND (RESID 306 THROUGH 393 )
113	X-RAY DIFFRACTION	113	CHAIN 'T' AND (RESID 394 THROUGH 421 )
114	X-RAY DIFFRACTION	114	CHAIN 'U' AND (RESID 7 THROUGH 58 )
115	X-RAY DIFFRACTION	115	CHAIN 'U' AND (RESID 59 THROUGH 165 )
116	X-RAY DIFFRACTION	116	CHAIN 'U' AND (RESID 166 THROUGH 209 )
117	X-RAY DIFFRACTION	117	CHAIN 'U' AND (RESID 210 THROUGH 256 )
118	X-RAY DIFFRACTION	118	CHAIN 'U' AND (RESID 257 THROUGH 305 )
119	X-RAY DIFFRACTION	119	CHAIN 'U' AND (RESID 306 THROUGH 393 )
120	X-RAY DIFFRACTION	120	CHAIN 'U' AND (RESID 394 THROUGH 421 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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