登録情報 | データベース: PDB / ID: 5uql |
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タイトル | Clostridium difficile toxin A (TcdA) glucosyltransferase domain in complex with U2F |
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要素 | Toxin A |
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キーワード | TRANSFERASE / glucosyltransferase / toxin |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
host cell cytosol / 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 六炭糖残基を移すもの / glycosyltransferase activity / cysteine-type peptidase activity / host cell endosome membrane / toxin activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ / lipid binding / host cell plasma membrane / proteolysis ...host cell cytosol / 転移酵素; グリコシル基を移すもの; 六炭糖残基を移すもの / glycosyltransferase activity / cysteine-type peptidase activity / host cell endosome membrane / toxin activity / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; システインプロテアーゼ / lipid binding / host cell plasma membrane / proteolysis / extracellular region / membrane / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 - #1190 / TcdA/TcdB toxin, N-terminal helical domain / TcdB toxin N-terminal helical domain / TcdA/TcdB toxin, catalytic glycosyltransferase domain / TcdA/TcdB catalytic glycosyltransferase domain / TcdA/TcdB toxin, pore forming domain / TcdA/TcdB pore forming domain / CGT/MARTX, cysteine protease (CPD) domain / CGT/MARTX, cysteine protease (CPD) domain superfamily / Peptidase C80 family ...Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 - #1190 / TcdA/TcdB toxin, N-terminal helical domain / TcdB toxin N-terminal helical domain / TcdA/TcdB toxin, catalytic glycosyltransferase domain / TcdA/TcdB catalytic glycosyltransferase domain / TcdA/TcdB toxin, pore forming domain / TcdA/TcdB pore forming domain / CGT/MARTX, cysteine protease (CPD) domain / CGT/MARTX, cysteine protease (CPD) domain superfamily / Peptidase C80 family / CGT/MARTX cysteine protease (CPD) domain profile. / Choline-binding repeat / Putative cell wall binding repeat / Cell wall/choline-binding repeat / Cell wall-binding repeat profile. / Nucleotide-diphospho-sugar transferases / Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 / Up-down Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Clostridioides difficile (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.97 Å |
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データ登録者 | Alvin, J.W. / Lacy, D.B. |
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資金援助 | 米国, 3件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Department of Veterans Affairs | BX002943 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID) | AI095755 | 米国 | National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | T32 GM008320 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: J. Struct. Biol. / 年: 2017 タイトル: Clostridium difficile toxin glucosyltransferase domains in complex with a non-hydrolyzable UDP-glucose analogue. 著者: Alvin, J.W. / Lacy, D.B. |
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履歴 | 登録 | 2017年2月8日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2017年5月10日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年6月14日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.country / _citation.journal_id_ASTM ..._citation.country / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.2 | 2017年9月20日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.3 | 2019年12月11日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 1.4 | 2023年10月4日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / diffrn_radiation_wavelength / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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