PDB-5unc: The crystal structure of PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE from S...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5unc

タイトル

The crystal structure of PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE from Streptomyces platensis subsp. rosaceus

要素

PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE

キーワード

ISOMERASE / PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE / Structural Genomics / PSI-Biology / Midwest Center for Structural Genomics / MCSG / Enzyme Discovery for Natural Product Biosynthesis / NatPro

機能・相同性

機能・相同性情報

catalytic activity
類似検索 - 分子機能

生物種

Streptomyces platensis (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 1.71 Å

データ登録者

Tan, K. / Hatzos-Skintges, C. / Endres, M. / Phillips Jr., G.N. / Joachimiak, A. / Midwest Center for Structural Genomics (MCSG) / Enzyme Discovery for Natural Product Biosynthesis (NatPro)

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: The crystal structure of PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE from Streptomyces platensis subsp. rosaceus
著者: Tan, K. / Hatzos-Skintges, C. / Endres, M. / Phillips Jr., G.N. / Joachimiak, A.

履歴

登録	2017年1月30日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2017年2月22日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年9月20日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.2	2020年1月1日	Group: Author supporting evidence / Data collection / カテゴリ: chem_comp / pdbx_audit_support Item: _chem_comp.type / _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2020年7月29日	Group: Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.4	2024年10月23日	Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5unc.cif.gz	467.6 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5unc.ent.gz	385.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5unc.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/un/5unc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/un/5unc	HTTPS FTP

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関連構造データ

類似構造データ	2dua-1 2hrw-1 2hjp-1 1pym-1 3gfz-d 3p4x-d 1mum-1 1m1b-1 1gv0-1 1cet-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: MCSG-APC109900

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#50 - 2004年2月解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes) 類似性 (2) #228 - 2018年12月酵素の指向性進化 (Directed Evolution of Enzymes) 類似性 (1)

登録構造単位

A: PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE

B: PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE

C: PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE

D: PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE

ヘテロ分子

146 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	89.326, 122.036, 136.681
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質

PHOSPHOENOLPYRUVATE PHOSPHOMUTASE

分子量: 36129.551 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Streptomyces platensis (バクテリア)
プラスミド: pMCSG68 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)magic / 参照: UniProt: A0A0A0V023

#2: 化合物

ChemComp-TLA / L(+)-TARTARIC ACID / L-酒石酸

分子量: 150.087 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₆O₆

#3: 糖

ChemComp-XYS / alpha-D-xylopyranose / alpha-D-xylose / D-xylose / xylose / XYLOPYRANOSE / α-D-キシロピラノ-ス

タイプ: D-saccharide, alpha linking / 分子量: 150.130 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₅H₁₀O₅

#4: 化合物

ChemComp-FMT / FORMIC ACID / ギ酸

分子量: 46.025 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: CH₂O₂

#5: 水

ChemComp-HOH / water

分子量: 18.015 Da / 分子数: 1177 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

Has protein modification

Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.6 Å³/Da / 溶媒含有率: 52.71 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: 0.2 M Ammonium Tartrate Dibasic, 20% (w/v) PEG 3350

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 0.97926 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2014年10月16日 / 詳細: Mirror
放射	モノクロメーター: Si 111 crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97926 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.71→35 Å / Num. obs: 161349 / % possible obs: 99.9 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 7.3 % / B_iso Wilson estimate: 11.74 Å² / R_merge(I) obs: 0.092 / R_pim(I) all: 0.026 / Χ²: 0.903 / Net I/σ(I): 29.1
反射シェル	解像度: 1.71→1.73 Å / 冗長度: 7.2 % / R_merge(I) obs: 0.761 / Mean I/σ(I) obs: 2.66 / Num. unique obs: 8027 / CC_1/2: 0.842 / R_pim(I) all: 0.304 / Χ²: 0.818 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.11.1_2575: ???)	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング
HKL-3000		位相決定

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散 / 解像度: 1.71→32.55 Å / SU ML: 0.15 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 17.37

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1773	7888	4.92 %	random
R_work	0.1552	-	-	-
obs	0.1563	160459	98.9 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.71→32.55 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8577	0	96	1177	9850

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.01	8987
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.054	12238
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.054	5344
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.068	1400
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	1629

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.7067-1.7261	0.2256	237	0.2138	4086	X-RAY DIFFRACTION	81
1.7261-1.7464	0.2392	241	0.2098	5003	X-RAY DIFFRACTION	98
1.7464-1.7677	0.2351	240	0.2023	5029	X-RAY DIFFRACTION	99
1.7677-1.79	0.2345	279	0.2062	5043	X-RAY DIFFRACTION	99
1.79-1.8136	0.2431	249	0.2082	5087	X-RAY DIFFRACTION	99
1.8136-1.8384	0.2486	248	0.1967	5058	X-RAY DIFFRACTION	99
1.8384-1.8647	0.2161	248	0.1833	5094	X-RAY DIFFRACTION	99
1.8647-1.8925	0.2091	278	0.1848	5063	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8925-1.9221	0.2234	299	0.1767	5037	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9221-1.9536	0.1991	273	0.1704	5091	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9536-1.9873	0.2047	285	0.1617	5058	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9873-2.0234	0.183	260	0.1611	5043	X-RAY DIFFRACTION	99
2.0234-2.0623	0.1799	245	0.1579	5138	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0623-2.1044	0.1795	248	0.1564	5110	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1044-2.1502	0.1926	258	0.1546	5116	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1502-2.2002	0.1807	258	0.151	5077	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2002-2.2552	0.189	266	0.1451	5118	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2552-2.3161	0.1782	266	0.1491	5094	X-RAY DIFFRACTION	99
2.3161-2.3843	0.1704	261	0.1448	5101	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3843-2.4612	0.1785	267	0.1503	5129	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4612-2.5491	0.1829	251	0.1501	5168	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5491-2.6512	0.1758	253	0.1537	5139	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6512-2.7718	0.1833	280	0.1525	5131	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7718-2.9178	0.1813	279	0.1585	5127	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9178-3.1005	0.1757	262	0.1559	5176	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1005-3.3396	0.1616	274	0.1529	5190	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3396-3.6753	0.1509	281	0.1422	5169	X-RAY DIFFRACTION	100
3.6753-4.2062	0.1463	271	0.1296	5232	X-RAY DIFFRACTION	100
4.2062-5.2956	0.1333	267	0.1286	5280	X-RAY DIFFRACTION	100
5.2956-32.5573	0.165	264	0.1571	5384	X-RAY DIFFRACTION	98

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.8256	0.1237	-0.0865	0.5133	0.275	1.5275	-0.1211	-0.1491	0.0745	0.3409	0.0928	0.0988	-0.1987	-0.235	-0.0134	0.3035	0.0932	-0.0072	0.1817	-0.0134	0.1139	52.1354	4.6808	148.2435
2	1.1748	-0.7353	0.835	3.0837	-2.0785	2.2186	-0.1117	-0.0123	0.0323	0.1534	0.0367	0.1225	-0.2057	-0.1948	0.0729	0.2573	0.12	0.0366	0.2261	-0.0272	0.1375	42.8615	9.3243	140.6114
3	2.7641	1.8542	-1.4857	4.232	0.384	2.4944	0.0425	-0.1507	0.2712	0.3471	0.0791	-0.0608	-0.5874	0.0079	-0.1369	0.3997	0.1307	-0.0535	0.231	-0.0381	0.1555	48.5338	17.2015	143.8852
4	1.2114	-1.1614	-0.1317	1.1558	-0.0638	0.8745	-0.1396	-0.1615	0.3463	0.1426	0.0193	0.0003	-0.3345	-0.0985	0.0184	0.4823	0.2133	-0.0025	0.3228	-0.0713	0.2261	41.3902	22.7105	143.6018
5	3.8976	2.6015	-0.4582	4.0594	0.4009	1.0586	-0.1816	-0.2138	0.2078	0.0114	0.0538	0.1126	-0.2766	-0.1731	0.1388	0.4695	0.1853	-0.0019	0.2937	-0.0448	0.1794	42.0507	16.6459	149.7518
6	0.2015	0.0485	0.0834	0.1369	0.0444	0.038	-0.0139	-0.1672	0.1766	0.1566	-0.0233	0.043	-0.1652	-0.1247	-0.0281	0.6602	0.2685	0.0074	0.3667	-0.1887	0.212	43.0769	22.5112	158.1423
7	0.0667	0.1555	0.2176	0.3767	0.4609	0.9061	0.0849	-0.2667	0.152	0.2113	-0.1019	0.0829	-0.051	-0.0757	-0.0068	0.5667	0.1826	-0.0388	0.3515	-0.1099	0.1467	53.0361	13.9848	161.9051
8	0.6596	-0.0213	-0.5183	0.148	0.1093	0.4693	-0.0899	-0.2282	0.0855	0.1942	-0.0119	-0.1901	-0.1987	0.0753	0.0119	0.2772	-0.0059	-0.1403	0.179	0.001	0.18	74.0127	-2.4024	150.0932
9	7.0689	5.3095	4.7556	7.6944	5.8969	8.2696	0.2009	-0.247	-0.4229	0.4226	0.0806	-0.2675	0.4341	0.0922	-0.2753	0.1983	0.0188	-0.0403	0.2033	0.0757	0.1838	56.0918	-24.6239	142.0562
10	1.0472	0.0665	0.1049	0.439	0.2402	0.7224	-0.0991	0.1027	0.2341	0.0202	-0.0428	-0.2883	-0.2871	0.231	0.0647	0.1921	-0.0684	-0.0959	0.1561	0.0739	0.2529	78.6937	2.5955	133.0613
11	1.0916	-0.0016	0.0364	0.6865	0.1386	0.8972	-0.0576	0.0771	0.0255	0.0399	-0.0614	-0.0592	-0.1417	0.0387	0.128	0.0923	-0.0041	-0.0444	0.112	0.0223	0.1101	66.9584	-7.6775	130.05
12	0.6056	-0.0272	-0.3316	1.1535	-0.8435	4.0735	0.0081	0.1324	-0.0636	-0.1313	-0.0307	-0.0059	0.224	0.0109	0.0262	0.0427	0.0147	-0.0192	0.1481	0.01	0.1262	71.1908	-21.2215	125.1224
13	1.5459	0.2531	-0.1665	3.685	-1.7354	2.8435	0.018	0.1709	0.0243	-0.0919	0.0053	0.0423	-0.0392	0.1378	-0.014	0.0295	-0.0107	-0.0224	0.145	0.0214	0.0964	76.4743	-14.0433	126.3079
14	0.8554	0.1868	0.2209	0.2646	0.0315	0.6382	-0.0227	0.1248	0.0142	0.0432	-0.0778	-0.25	-0.0269	0.3302	0.0265	0.0835	0.0059	-0.0377	0.205	0.0618	0.191	84.8148	-15.6482	133.3953
15	1.8502	-1.062	-2.4331	1.0499	1.7365	3.4603	-0.1207	-0.391	0.047	0.3556	0.1388	-0.0486	-0.1471	0.0676	0.0005	0.3885	0.0674	-0.1068	0.2219	-0.0157	0.1302	65.5747	-0.146	156.7114
16	1.2483	0.5458	-2.0295	0.5418	-1.0212	4.4017	-0.0566	-0.3365	0.1231	0.2843	-0.0312	-0.0341	-0.1333	0.37	0.061	0.4927	0.0665	-0.198	0.2314	-0.0674	0.2398	66.8089	14.011	153.8237
17	2.8446	-0.6464	1.608	3.3691	-0.2694	3.4566	-0.0225	-0.1567	0.1062	-0.0179	0.0477	-0.1482	-0.1113	0.1017	-0.0324	0.5387	-0.0725	-0.1955	0.2156	-0.0164	0.2719	63.5753	27.1316	134.1014
18	2.2049	1.6883	-0.8423	3.3583	-1.1088	1.2563	0.0092	0.0693	0.0001	-0.0877	-0.0404	-0.2111	-0.001	0.1214	0.0276	0.0793	0.0236	-0.0152	0.0704	0.0057	0.0901	54.8498	10.1079	105.8548
19	0.7363	0.3618	-0.5488	0.8822	-0.286	1.5918	0.004	-0.1076	0.0445	0.1602	-0.0012	0.0023	-0.1587	0.0492	-0.0046	0.1247	0.0306	-0.0274	0.0877	-0.0036	0.1162	47.8175	8.9166	118.8967
20	1.1694	-0.1751	-0.3597	1.9152	1.1674	2.4093	-0.0448	-0.1573	0.0793	0.319	-0.0265	-0.1742	-0.123	0.0587	0.057	0.205	0.0064	-0.0776	0.0862	0.0117	0.1503	56.6573	16.0967	122.3556
21	5.7758	-1.1993	-1.0466	1.8437	-0.8337	2.1641	0.131	0.0512	0.0889	0.1771	-0.0629	0.2427	-0.3584	-0.3051	-0.0639	0.2177	0.0309	-0.0468	0.1095	-0.006	0.1514	47.5016	20.3897	120.8718
22	1.0482	0.9969	1.3992	2.7044	1.016	2.2263	-0.0866	-0.4425	0.352	0.2642	-0.0536	0.1241	-0.2607	-0.2563	0.1399	0.3082	0.0214	-0.0701	0.1406	0.0021	0.1481	51.0372	28.566	123.2718
23	4.7338	-1.0678	-0.8581	2.7164	0.4333	1.6989	-0.1906	-0.2438	-0.0094	0.2629	0.1191	-0.0434	-0.1579	0.0561	0.0669	0.1839	0.0047	-0.0582	0.0697	0.0099	0.1017	52.8271	24.8706	115.68
24	0.5345	0.3128	-0.0758	1.7829	-0.1244	0.7117	-0.0407	-0.0139	0.1097	0.0844	-0.0001	0.0677	-0.2112	-0.0637	0.0412	0.1641	0.0269	-0.047	0.0789	0.0173	0.1235	46.5609	27.3384	106.9243
25	2.1729	2.8855	-0.5969	4.0267	-0.5946	0.3669	-0.1155	0.1322	0.1445	-0.2725	0.1748	0.5114	-0.0545	-0.2315	-0.0511	0.0947	0.0224	-0.0373	0.1274	0.0184	0.1991	30.5656	-2.4009	110.3428
26	6.3532	3.5299	-0.4803	2.9212	-0.2725	0.6246	-0.0819	0.3283	0.0166	-0.2383	0.1051	0.1745	0.0637	-0.0921	-0.0323	0.1101	-0.0006	-0.0331	0.0947	0.0009	0.0984	40.2878	-12.0363	105.1806
27	8.4037	-4.9305	4.7848	7.4018	-3.0937	9.1048	0.1313	0.4136	-0.1982	-0.4472	-0.0151	-0.0931	0.3594	0.1806	-0.1069	0.1604	0.02	0.005	0.2515	-0.0635	0.1207	63.1414	-17.4657	110.3773
28	1.2469	0.4548	-0.0025	1.0853	-0.5998	1.5605	-0.0007	-0.1499	-0.0172	0.1569	0.0307	0.3451	-0.0732	-0.2812	-0.007	0.0758	0.0307	0.0366	0.1466	-0.0003	0.1968	30.4684	-10.4034	125.131
29	1.8502	0.2821	-0.3375	1.0063	-0.2909	1.5526	-0.0252	-0.1409	-0.0249	0.0483	-0.0097	0.0625	-0.0457	0.0364	0.0319	0.0544	0.0173	-0.0028	0.0631	-0.0005	0.0736	45.0074	-8.4432	122.119
30	4.6209	-2.4949	0.6619	3.1873	-0.5136	2.0481	0.0054	-0.0694	0.0856	0.1552	-0.0381	-0.0947	-0.0724	0.0112	0.0331	0.0578	-0.0202	0.0098	0.0607	0.0113	0.0892	46.1968	-14.6941	132.2674
31	2.4641	0.8388	-1.6123	2.0391	2.1362	5.7464	-0.0263	0.2623	-0.1693	-0.1851	-0.0201	-0.1381	-0.0988	-0.0209	0.0454	0.068	-0.0084	0.0128	0.0778	0.027	0.1079	47.7731	-19.57	123.3382
32	1.3032	-0.4507	1.522	2.4231	-0.4323	2.0648	0.0363	0.17	-0.0622	-0.1581	0.0188	-0.195	0.0829	0.4094	-0.0615	0.0682	-0.0206	0.018	0.1342	0.0152	0.1409	49.7109	-27.6522	127.5471
33	2.4864	-1.2255	-2.2668	2.9356	2.2399	5.7483	0.0702	-0.2091	0.0802	0.0301	0.1087	0.0109	-0.0688	-0.0021	-0.1867	0.0243	-0.018	0.0018	0.0928	0.0263	0.1117	41.5889	-24.1579	127.2332
34	0.6545	0.076	0.0492	0.8655	-0.7687	1.3935	0.0202	-0.0328	-0.0746	-0.0871	0.0341	0.1612	0.15	-0.1334	-0.0485	0.0676	-0.024	-0.0006	0.0774	0.0049	0.1192	35.2308	-27.8579	118.8926
35	0.6937	1.741	-1.71	4.41	-4.3313	4.2531	-0.1082	0.1514	-0.007	-0.4904	0.2341	0.2683	0.2061	-0.2226	-0.132	0.1287	0.0047	-0.0364	0.0962	-0.0026	0.126	41.0551	0.7934	102.6147
36	1.9575	0.766	-2.1465	1.9662	-2.7843	5.9415	-0.0707	0.1506	0.1064	-0.0647	0.2315	0.3742	-0.0712	-0.5886	-0.1652	0.1267	0.0335	-0.0391	0.1182	0.0117	0.1986	32.7476	10.8125	109.1843
37	4.4454	0.1058	-0.2394	8.6322	5.4838	3.6127	-0.1187	-0.1769	0.3987	0.0907	-0.1994	0.7304	-0.3903	-0.5968	0.3164	0.2973	0.1906	0.0234	0.3827	-0.008	0.3064	30.5193	17.8433	131.7657

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 19 through 90 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 91 through 118 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 119 through 137 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 138 through 160 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 161 through 180 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 181 through 226 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 227 through 251 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 252 through 292 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 293 through 307 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 19 through 51 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 52 through 137 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 138 through 160 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 161 through 180 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 181 through 251 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 252 through 271 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 272 through 292 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 293 through 305 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 19 through 51 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 52 through 90 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 91 through 118 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 119 through 137 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 138 through 160 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 161 through 180 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 181 through 251 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 252 through 271 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resid 272 through 292 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'C' and (resid 293 through 306 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 19 through 51 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 52 through 90 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 91 through 118 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 119 through 137 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 138 through 160 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 161 through 180 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 181 through 251 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'D' and (resid 252 through 271 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'D' and (resid 272 through 292 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'D' and (resid 293 through 305 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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