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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5uhs | ||||||
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タイトル | Structure of a SemiSWEET D57A mutant | ||||||
![]() | Sugar transporter SemiSWEET | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / membrane / transporter / SemiSWEET | ||||||
機能・相同性 | ![]() glucose transmembrane transporter activity / glucose transmembrane transport / protein homodimerization activity / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Fastman, N.M. / Feng, L. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Mechanism of Substrate Translocation in an Alternating Access Transporter. 著者: Latorraca, N.R. / Fastman, N.M. / Venkatakrishnan, A.J. / Frommer, W.B. / Dror, R.O. / Feng, L. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 46.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 31.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 894.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 886.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10680.742 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: Patoc 1 / ATCC 23582 / Paris / 遺伝子: LEPBI_I1613 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 糖 | ChemComp-BGC / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | 溶媒含有率: 34.26 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 脂質キュービック相法 詳細: 11.7 MAG 50 mM tris pH 8 100 mM LiSO4 35% PEG 400 40 mM glucose |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年11月19日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.03327 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.8→50 Å / Num. obs: 4006 / % possible obs: 96.92 % / 冗長度: 9.3 % / Net I/σ(I): 13.73 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 4qnc 解像度: 2.8→29 Å / SU ML: 0.29 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 30.11
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å | ||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→29 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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