Mixed labeled fibrils (samples 3, 4, 9 and 10) for determining intermolecular packing were prepared using a urea-based solubilization protocol to ensure complete mixing.
Mixedlabeledfibrils
pH8Trisbuffer
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
0.4g/L
IVL
[U-13C; U-15N]
1
0.4g/L
mixedsample
[U-13C]
2
試料状態
イオン強度: 100 mM / Label: 1 / pH: 8 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker Bruker / 製造業者: Bruker / モデル: Bruker / 磁場強度: 800 MHz
-
解析
NMR software
名称
開発者
分類
CYANA
Guntert, MumenthalerandWuthrich
structurecalculation
TopSpin
BrukerBiospin
chemicalshiftassignment
X-PLOR NIH
Schwieters, Kuszewski, TjandraandClore
精密化
TALOS
Cornilescu, DelaglioandBax
データ解析
精密化
手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 2
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20