登録情報 データベース : PDB / ID : 5t67 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル x-ray structure of the KijD1 C3-methyltransferase from Actinomadura kijaniata in complex with SAH and dTDP-sugar product 要素Sugar 3-C-methyl transferase 詳細 キーワード TRANSFERASE / C3-methyltransferase / antitumor / antibiotic / kijanimicin機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #3100 / Methyltransferase, zinc-binding domain / Methyltransferase putative zinc binding domain / C-methyltransferase / Methyltransferase putative zinc binding domain superfamily / Putative zinc binding domain / C-methyltransferase C-terminal domain / Methyltransferase domain / N-terminal domain of TfIIb / Other non-globular ... Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #3100 / Methyltransferase, zinc-binding domain / Methyltransferase putative zinc binding domain / C-methyltransferase / Methyltransferase putative zinc binding domain superfamily / Putative zinc binding domain / C-methyltransferase C-terminal domain / Methyltransferase domain / N-terminal domain of TfIIb / Other non-globular / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Vaccinia Virus protein VP39 / Helix non-globular / Special / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-JHZ / S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE / Sugar 3-C-methyl transferase 類似検索 - 構成要素生物種 Actinomadura kijaniata (バクテリア)手法 X線回折 / フーリエ合成 / 解像度 : 1.6 Å 詳細データ登録者 Holden, H.M. / Thoden, J.B. / Dow, G.T. 資金援助 米国, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) gm115921 米国
引用ジャーナル : Protein Sci. / 年 : 2016タイトル : Structural studies on KijD1, a sugar C-3'-methyltransferase.著者 : Dow, G.T. / Thoden, J.B. / Holden, H.M. 履歴 登録 2016年9月1日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2016年9月14日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2016年9月21日 Group : Database references改定 1.2 2016年9月28日 Group : Structure summary改定 1.3 2016年12月7日 Group : Database references改定 1.4 2017年9月27日 Group : Author supporting evidence / Database references / カテゴリ : citation / pdbx_audit_supportItem : _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization改定 1.5 2019年12月25日 Group : Author supporting evidence / カテゴリ : pdbx_audit_support / Item : _pdbx_audit_support.funding_organization改定 1.6 2023年10月4日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry
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