分子量: 11220.585 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 28-126 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ELAVL1, HUR / プラスミド: RP1B 詳細 (発現宿主): Recombinant protein expressed in fusion with a Thio6His6 expression/purification tag, followed by a TEV protease cleavage site 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: Q15717
-
実験情報
-
実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
Sample state
Spectrometer-ID
タイプ
1
1
1
isotropic
2
2D 1H-15N HSQC
1
2
2
isotropic
1
2D 1H-13C HSQC aliphatic
1
3
2
isotropic
1
2D 1H-13C HSQC aromatic
1
4
2
isotropic
1
3D HN(CA)CB
1
5
2
isotropic
1
3DCBCA(CO)NH
1
9
2
isotropic
1
3D HNCO
1
8
2
isotropic
1
3DHN(CA)CO
1
7
2
isotropic
1
3DHBHA(CO)NH
1
6
2
isotropic
2
3D (H)CC(CO)NH
1
10
2
isotropic
1
3D (H)CCH-TOCSY
1
11
2
isotropic
2
3D 1H-13C NOESY aromatic
-
試料調製
詳細
タイプ
Solution-ID
内容
詳細
Label
溶媒系
solution
1
1.5 mM [U-15N] HuR_RRM1, 30 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, 90% H2O/10% D2O
U-100% 15N; 1.5mM
RRM1_N15
90% H2O/10% D2O
solution
2
1.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] HuR_RRM1, 30 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, 90% H2O/10% D2O
U-100% 13C; U-100% 15N; 1.5mM
RRM1_N15_C13
90% H2O/10% D2O
試料
濃度 (mg/ml)
構成要素
Isotopic labeling
Solution-ID
1.5mM
HuR_RRM1
[U-15N]
1
30mM
sodiumphosphate
naturalabundance
1
100mM
sodiumchloride
naturalabundance
1
10mM
DTT
naturalabundance
1
1.5mM
HuR_RRM1
[U-100% 13C; U-100% 15N]
2
30mM
sodiumphosphate
naturalabundance
2
100mM
sodiumchloride
naturalabundance
2
10mM
DTT
naturalabundance
2
試料状態
イオン強度: 100 mM / Label: Conditions_RRM1 / pH: 6.0 Not defined / 圧: 1 atm / 温度: 298 K
-
NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker DRX
Bruker
DRX
600
1
Bruker AVANCE III
Bruker
AVANCEIII
800
2
-
解析
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
TopSpin
3.1
BrukerBiospin
解析
CARA
KellerandWuthrich
chemicalshiftassignment
CcpNMR
CCPN
データ解析
CNS
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
精密化
CNS
Brunger, Adams, Clore, Gros, NilgesandRead
structurecalculation
精密化
手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 4
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 400 / 登録したコンフォーマーの数: 20