ソフトウェア 名称 バージョン 分類 BUSTER2.11.7精密化 MOSFLMデータ削減 SCALAデータスケーリング MOLREP位相決定
精密化 解像度 : 1.92→21.49 Å / Cor.coef. Fo :Fc : 0.954 / Cor.coef. Fo :Fc free : 0.944 / Rfactor Rfree error : 0 / SU R Cruickshank DPI : 0.14 / 交差検証法 : THROUGHOUT / σ(F) : 0 / SU R Blow DPI : 0.156 / SU Rfree Blow DPI : 0.136 / SU Rfree Cruickshank DPI : 0.13 Rfactor 反射数 %反射 Selection details Rfree 0.21 1881 5.01 % RANDOM Rwork 0.174 - - - obs 0.175 37548 99.4 % -
原子変位パラメータ Biso mean : 38.09 Å2 Baniso -1 Baniso -2 Baniso -3 1- -0.0732 Å2 0 Å2 0 Å2 2- - -0.0732 Å2 0 Å2 3- - - 0.1465 Å2
Refine analyze Luzzati coordinate error obs : 0.23 Å精密化ステップ サイクル : 1 / 解像度 : 1.92→21.49 Åタンパク質 核酸 リガンド 溶媒 全体 原子数 3281 0 17 550 3848
拘束条件 大きな表を表示 (6 x 18) 大きな表を隠す Refine-ID タイプ Dev ideal 数 Restraint function Weight X-RAY DIFFRACTION t_bond_d0.01 3408 HARMONIC2 X-RAY DIFFRACTION t_angle_deg1.09 4655 HARMONIC2 X-RAY DIFFRACTION t_dihedral_angle_d1123 SINUSOIDAL2 X-RAY DIFFRACTION t_incorr_chiral_ctX-RAY DIFFRACTION t_pseud_angleX-RAY DIFFRACTION t_trig_c_planes73 HARMONIC2 X-RAY DIFFRACTION t_gen_planes491 HARMONIC5 X-RAY DIFFRACTION t_it3408 HARMONIC20 X-RAY DIFFRACTION t_nbdX-RAY DIFFRACTION t_omega_torsion3.68 X-RAY DIFFRACTION t_other_torsion15.34 X-RAY DIFFRACTION t_improper_torsionX-RAY DIFFRACTION t_chiral_improper_torsion465 SEMIHARMONIC5 X-RAY DIFFRACTION t_sum_occupanciesX-RAY DIFFRACTION t_utility_distanceX-RAY DIFFRACTION t_utility_angleX-RAY DIFFRACTION t_utility_torsionX-RAY DIFFRACTION t_ideal_dist_contact4240 SEMIHARMONIC4
LS精密化 シェル 解像度 : 1.92→1.97 Å / Rfactor Rfree error : 0 / Total num. of bins used : 19 Rfactor 反射数 %反射 Rfree 0.253 133 5.01 % Rwork 0.205 2522 - all 0.207 2655 - obs - - 92.31 %
精密化 TLS 手法 : refined / Refine-ID : X-RAY DIFFRACTION
大きな表を表示 (25 x 2) 大きな表を隠す ID L11 (°2 )L12 (°2 )L13 (°2 )L22 (°2 )L23 (°2 )L33 (°2 )S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2 )T12 (Å2 )T13 (Å2 )T22 (Å2 )T23 (Å2 )T33 (Å2 )Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)1 3.203 -0.3962 0.3273 1.3844 -0.748 0.9128 -0.0147 -0.0625 -0.2633 -0.0895 -0.1191 -0.0921 0.0732 0.0699 0.1338 -0.1525 0.0223 0.0519 -0.1074 0.0074 -0.0859 0.08 26.1556 1.6351 2 2.432 -0.1335 0.4504 0.4898 -0.0722 0.257 -0.0126 0.0608 0.3639 0.056 0.0556 0.0779 -0.0744 -0.1173 -0.043 -0.0902 0.0253 0.0418 -0.0359 0.0406 -0.0364 9.7602 39.5173 -5.8435
精密化 TLSグループ ID Refine-ID Refine TLS-ID Selection details 1 X-RAY DIFFRACTION 1 { H|* }2 X-RAY DIFFRACTION 2 { L|* }