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- PDB-5mfo: Designed armadillo repeat protein YIIIM3AIII -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 5mfo
タイトルDesigned armadillo repeat protein YIIIM3AIII
要素YIIIM3AIII
キーワードDE NOVO PROTEIN / Designed armadillo repeat protein / peptide binding
機能・相同性Leucine-rich Repeat Variant / Leucine-rich Repeat Variant / Alpha Horseshoe / Mainly Alpha
機能・相同性情報
生物種synthetic construct (人工物)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.3 Å
データ登録者Hansen, S. / Ernst, P. / Reichen, C. / Ewald, C. / Mittl, P. / Plueckthun, A.
引用ジャーナル: J. Struct. Biol. / : 2018
タイトル: Curvature of designed armadillo repeat proteins allows modular peptide binding.
著者: Hansen, S. / Ernst, P. / Konig, S.L.B. / Reichen, C. / Ewald, C. / Nettels, D. / Mittl, P.R.E. / Schuler, B. / Pluckthun, A.
履歴
登録2016年11月18日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02017年9月13日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12018年2月21日Group: Database references / カテゴリ: citation
Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.year
改定 1.22024年5月8日Group: Data collection / Database references / Derived calculations
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr1_symmetry / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: YIIIM3AIII
B: YIIIM3AIII
C: YIIIM3AIII
D: YIIIM3AIII
E: YIIIM3AIII
F: YIIIM3AIII
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)128,13526
ポリマ-127,3116
非ポリマー82420
23,5101305
1
A: YIIIM3AIII
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)21,3394
ポリマ-21,2191
非ポリマー1203
181
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
2
B: YIIIM3AIII
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)21,3795
ポリマ-21,2191
非ポリマー1604
181
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
3
C: YIIIM3AIII
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)21,2993
ポリマ-21,2191
非ポリマー802
181
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
4
D: YIIIM3AIII
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)21,3795
ポリマ-21,2191
非ポリマー1604
181
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
5
E: YIIIM3AIII
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)21,3394
ポリマ-21,2191
非ポリマー1203
181
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
6
F: YIIIM3AIII
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)21,4015
ポリマ-21,2191
非ポリマー1824
181
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
単位格子
Length a, b, c (Å)83.920, 83.920, 166.150
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number78
Space group name H-MP43

-
要素

#1: タンパク質
YIIIM3AIII


分子量: 21218.547 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) synthetic construct (人工物) / 発現宿主: Escherichia coli K-12 (大腸菌)
#2: 化合物
ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン


分子量: 40.078 Da / 分子数: 19 / 由来タイプ: 合成 / : Ca
#3: 化合物 ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル


分子量: 62.068 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / : C2H6O2
#4: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 1305 / 由来タイプ: 天然 / : H2O

-
実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.3 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.47 %
結晶化温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5.5
詳細: 0.2 M Ca-Acetate, 0.1 M Na-Acetate pH 5.5, 25 % PEG 2K MME

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 1 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 2M / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年5月14日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.3→48.287 Å / Num. obs: 278605 / % possible obs: 99.3 % / 冗長度: 11.2 % / CC1/2: 1 / Rmerge(I) obs: 0.056 / Net I/σ(I): 19.48
反射 シェル解像度: 1.3→1.33 Å / 冗長度: 11.1 % / Rmerge(I) obs: 1.695 / Mean I/σ(I) obs: 1.44 / CC1/2: 0.475 / % possible all: 98.1

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX(1.10_2155: ???)精密化
XDSデータ削減
XSCALEデータスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.3→48.287 Å / SU ML: 0.14 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 19.18
Rfactor反射数%反射
Rfree0.1781 13861 4.98 %
Rwork0.1586 --
obs0.1596 278547 99.29 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 1.3→48.287 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数8822 0 23 1305 10150
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.0089893
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d0.89813606
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d21.5043787
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.0631556
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.0061902
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
1.3-1.31480.33175210.30648618X-RAY DIFFRACTION98
1.3148-1.33020.28064570.29348743X-RAY DIFFRACTION98
1.3302-1.34650.30714300.28478715X-RAY DIFFRACTION98
1.3465-1.36350.29694200.28148774X-RAY DIFFRACTION98
1.3635-1.38140.26844310.26418758X-RAY DIFFRACTION98
1.3814-1.40040.27174390.2568836X-RAY DIFFRACTION99
1.4004-1.42040.27964080.25338775X-RAY DIFFRACTION99
1.4204-1.44160.25334590.24258759X-RAY DIFFRACTION99
1.4416-1.46410.23644700.22698740X-RAY DIFFRACTION99
1.4641-1.48810.23144500.20878767X-RAY DIFFRACTION99
1.4881-1.51380.21745120.19498777X-RAY DIFFRACTION99
1.5138-1.54130.21764870.1868761X-RAY DIFFRACTION99
1.5413-1.5710.21854660.17918757X-RAY DIFFRACTION99
1.571-1.6030.19154030.17518903X-RAY DIFFRACTION99
1.603-1.63790.19314460.17198823X-RAY DIFFRACTION99
1.6379-1.6760.2164590.17538880X-RAY DIFFRACTION99
1.676-1.71790.21324660.17398781X-RAY DIFFRACTION100
1.7179-1.76430.19614730.17048827X-RAY DIFFRACTION100
1.7643-1.81630.1885180.15958811X-RAY DIFFRACTION100
1.8163-1.87490.17095050.16068835X-RAY DIFFRACTION100
1.8749-1.94190.1994590.16158873X-RAY DIFFRACTION100
1.9419-2.01970.18014480.15418902X-RAY DIFFRACTION100
2.0197-2.11160.17254990.15058842X-RAY DIFFRACTION100
2.1116-2.22290.17254740.14318854X-RAY DIFFRACTION100
2.2229-2.36220.16645150.13948846X-RAY DIFFRACTION100
2.3622-2.54450.14784750.13558926X-RAY DIFFRACTION100
2.5445-2.80060.16124640.14058889X-RAY DIFFRACTION100
2.8006-3.20580.17624130.15018978X-RAY DIFFRACTION100
3.2058-4.03860.14464200.14328947X-RAY DIFFRACTION100
4.0386-48.32030.16354740.14578989X-RAY DIFFRACTION100
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL112)L122)L132)L222)L232)L332)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T112)T122)T132)T222)T232)T332)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
15.12854.3648-4.25514.174-2.59846.0209-0.2369-0.0167-0.72590.02880.2336-0.46030.80390.20780.04740.41690.0155-0.03940.2281-0.05210.300434.1062-37.776740.7157
23.26514.15834.70787.05714.94157.41490.72250.3571-0.52420.87250.0467-0.75491.16180.6957-0.55220.58710.1479-0.02890.2961-0.09110.287235.2329-41.508433.2553
33.8884-1.313-0.27252.44961.3224.8410.00990.1417-0.02510.22510.1326-0.18190.29530.0538-0.13020.1961-0.0059-0.0160.1238-0.05990.132527.4687-34.865132.3677
43.975-0.39220.68043.27730.76044.20430.03420.18090.1161-0.1508-0.0198-0.1787-0.23610.046-0.00730.1551-0.0130.01130.1083-0.02420.148626.5942-32.302320.8708
52.3023-1.4097-2.14785.53531.32356.43890.06770.14590.2523-0.81090.1492-0.7048-0.61040.2657-0.21180.3259-0.07480.06030.21190.04990.263228.3942-28.56296.6652
67.7577-1.5098-0.06955.0954-0.94584.47890.03620.27110.02-0.4027-0.13690.3654-0.4962-0.46040.07880.29020.0212-0.05130.2297-0.03540.131919.1659-31.52938.7076
72.8756-4.1413-2.66687.8034.25282.56540.39650.60740.0928-0.9689-0.4534-0.2001-0.9554-0.47050.11320.51030.09510.03370.36460.06720.21122.6305-33.2962-3.0765
82.56931.4169-1.84042.26690.90884.82580.08480.5862-0.021-0.369-0.54710.7229-0.5615-0.97490.5020.31370.1005-0.03950.4158-0.06310.285316.6919-37.65911.1662
94.14241.7653-0.45184.06630.9760.63930.1384-0.64790.17990.2071-0.1131-0.03480.02950.1188-0.03370.1562-0.03640.01160.3193-0.06010.19277.0559-45.238820.8327
102.8066-0.0359-0.52650.53930.1050.91550.1579-0.14240.2817-0.0122-0.01660.0071-0.09810.0381-0.13550.1354-0.00180.02580.13270.00210.1773-11.7228-45.639113.405
116.2012-0.39853.88393.6322-1.43822.82770.2320.32520.91990.0720.1140.4388-0.6434-0.594-0.10560.17210.09410.07990.30760.13950.3823-30.9217-40.170211.0115
121.8128-0.0354-0.53422.01730.47060.28290.2321.0027-0.4691-0.5804-0.19450.5969-0.198-0.2811-0.0190.19670.12-0.10750.5123-0.09010.3468-28.8385-55.7747-0.1117
136.417-2.4336-3.68996.87224.51337.7814-0.17070.7888-1.46330.357-0.0870.63770.2967-0.76880.17380.1844-0.00790.02440.433-0.08070.5051-30.0583-56.90447.8965
146.1641-4.67423.21033.7293-1.55725.9731-0.21760.09930.7848-0.17240.2425-0.6346-0.71470.22510.06460.4177-0.03150.03860.2211-0.05230.3052-7.7722-4.154-11.9142
152.5921-3.8548-3.9597.04524.76217.01870.7694-0.31490.5115-0.86630.0089-0.7141-1.0760.5245-0.58410.5467-0.11770.01980.2615-0.09080.3076-6.35-0.658-4.5986
165.32340.36251.09372.20170.91475.51770.0223-0.1985-0.0389-0.14680.1333-0.2246-0.2010.0543-0.16840.18660.00210.01270.1178-0.0610.1528-14.1689-7.5731-3.3667
171.2042-0.3153-0.46892.36350.74464.1741-0.0074-0.1687-0.12830.2460.0332-0.17770.24970.075-0.02060.17240.0116-0.02590.1404-0.01170.1885-15.4428-9.535611.8769
186.0859-6.56325.03028.4745-6.52715.26380.1508-0.1735-1.27610.42340.03961.04741.0527-1.0023-0.24640.4968-0.20820.08120.4338-0.01680.3596-29.575-17.54220.6057
191.81373.14642.98456.65375.30774.92560.4613-0.4228-0.16041.216-0.4468-0.17681.1339-0.42080.04140.4755-0.1012-0.03470.33890.05590.2383-19.3227-8.665531.8964
203.20592.04263.48958.70041.94253.81470.1461-0.5993-0.02060.4885-0.60920.94440.6327-0.93910.4730.3116-0.09040.04990.4216-0.08030.3175-25.4546-4.371127.644
215.9887-5.35045.69715.657-6.48728.05910.141-0.1371-0.1699-0.1589-0.0640.31420.0906-0.0301-0.1840.21110.0017-0.03860.1968-0.07010.2434-11.7566-74.45382.1876
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365.5033-5.08845.86315.1145-5.12726.7629-0.2032-0.1732-0.2436-0.03140.16380.09710.0269-0.1122-0.05740.19740.00370.06330.20830.04220.241-31.9617-53.7281-14.1821
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397.761-1.1267-6.62170.17941.0195.83250.0855-0.32560.0378-0.05960.0115-0.0677-0.15550.2841-0.0880.2127-0.0030.010.1441-0.03090.1539-12.2987-23.1916-12.8404
406.4828-4.0602-1.86542.98851.21711.44350.10520.0750.0702-0.2614-0.0178-0.0057-0.112-0.0473-0.09560.2045-0.0230.0190.1104-0.00480.1341-16.5918-24.4027-22.0368
414.00522.04254.88096.30672.79925.9702-0.1539-0.48080.2036-0.17580.0020.2919-0.4058-0.45490.18610.22340.03160.00690.1866-0.01410.1577-26.597-13.5198-13.1862
426.4881-1.21561.45642.70621.21871.22280.0859-0.03110.5283-0.17620.1412-0.3231-0.30710.0986-0.2890.2313-0.04650.04010.0719-0.01180.1762-9.1386-14.5063-20.3085
434.3209-3.3293-5.336.65422.11297.83920.32520.4150.0256-0.5525-0.22010.2637-0.8209-0.5233-0.1440.34660.0278-0.00490.23250.00360.1662-15.6485-15.4775-26.4086
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection details
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 10 through 24 )
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 25 through 40 )
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 41 through 66 )
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 67 through 135 )
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 136 through 150 )
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'A' and (resid 151 through 177 )
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'A' and (resid 178 through 192 )
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'A' and (resid 193 through 208 )
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resid 11 through 40 )
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 41 through 166 )
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resid 167 through 177 )
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'B' and (resid 178 through 192 )
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'B' and (resid 193 through 208 )
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'C' and (resid 10 through 24 )
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'C' and (resid 25 through 40 )
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'C' and (resid 41 through 66 )
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'C' and (resid 67 through 166 )
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'C' and (resid 167 through 177 )
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'C' and (resid 178 through 192 )
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'C' and (resid 193 through 208 )
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'D' and (resid 8 through 24 )
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'D' and (resid 25 through 40 )
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'D' and (resid 41 through 93 )
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'D' and (resid 94 through 108 )
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'D' and (resid 109 through 135 )
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'D' and (resid 136 through 150 )
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'D' and (resid 151 through 166 )
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'D' and (resid 167 through 177 )
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'D' and (resid 178 through 192 )
30X-RAY DIFFRACTION30chain 'D' and (resid 193 through 207 )
31X-RAY DIFFRACTION31chain 'E' and (resid 12 through 40 )
32X-RAY DIFFRACTION32chain 'E' and (resid 41 through 165 )
33X-RAY DIFFRACTION33chain 'E' and (resid 166 through 177 )
34X-RAY DIFFRACTION34chain 'E' and (resid 178 through 192 )
35X-RAY DIFFRACTION35chain 'E' and (resid 193 through 209 )
36X-RAY DIFFRACTION36chain 'F' and (resid 8 through 24 )
37X-RAY DIFFRACTION37chain 'F' and (resid 25 through 40 )
38X-RAY DIFFRACTION38chain 'F' and (resid 41 through 135 )
39X-RAY DIFFRACTION39chain 'F' and (resid 136 through 150 )
40X-RAY DIFFRACTION40chain 'F' and (resid 151 through 166 )
41X-RAY DIFFRACTION41chain 'F' and (resid 167 through 177 )
42X-RAY DIFFRACTION42chain 'F' and (resid 178 through 192 )
43X-RAY DIFFRACTION43chain 'F' and (resid 193 through 208 )

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る