登録情報 データベース : PDB / ID : 5m1e 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of N-terminally tagged UbiD from E. coli reconstituted with prFMN cofactor 要素3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase 詳細 キーワード LYASE / UbiD / decarboxylase / ubiquinone biosynthesis / prFMN binding機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase activity / ferulate metabolic process / cinnamic acid catabolic process / ubiquinone biosynthetic process / metal ion binding / plasma membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 UbiD decarboxylyase, bacteria / UbiD C-terminal domain-like / UbiD C-terminal domain-like / : / : / : / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase N-terminal domain / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase C-terminal domain / UbiD decarboxylyase family / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase Rift-related domain ... UbiD decarboxylyase, bacteria / UbiD C-terminal domain-like / UbiD C-terminal domain-like / : / : / : / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase N-terminal domain / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase C-terminal domain / UbiD decarboxylyase family / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase Rift-related domain / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-7D9 / : / 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli O6:H1 (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度 : 2.62 Å 詳細データ登録者 Marshall, S.A. / Leys, D. 引用ジャーナル : J. Biol. Chem. / 年 : 2017タイトル : Oxidative Maturation and Structural Characterization of Prenylated FMN Binding by UbiD, a Decarboxylase Involved in Bacterial Ubiquinone Biosynthesis.著者 : Marshall, S.A. / Fisher, K. / Ni Cheallaigh, A. / White, M.D. / Payne, K.A. / Parker, D.A. / Rigby, S.E. / Leys, D. 履歴 登録 2016年10月7日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2017年1月11日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2017年1月18日 Group : Database references改定 1.2 2017年3月29日 Group : Database references改定 1.3 2024年1月17日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ncs_dom_lim Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
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