登録情報 | データベース: PDB / ID: 5lop |
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タイトル | Structure of the active form of /K. lactis/ Dcp1-Dcp2-Edc3 decapping complex bound to m7GDP |
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要素 | - KLLA0A11308p
- KLLA0E01827p
- KLLA0F23980p
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キーワード | RNA BINDING PROTEIN / RNA decay / multiprotein complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA / mRNA 5'-diphosphatase activity / 5'-(N(7)-methylguanosine 5'-triphospho)-[mRNA] hydrolase activity / deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA / nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay / enzyme activator activity / P-body / manganese ion binding / mRNA binding / RNA binding類似検索 - 分子機能 FDF domain / DFDF domain / DFDF domain profile. / FDF / mRNA-decapping enzyme subunit 1 / Dcp1-like decapping family / YjeF N-terminal domain superfamily / YjeF-related protein N-terminus / YjeF N-terminal domain / YjeF N-terminal domain profile. ...FDF domain / DFDF domain / DFDF domain profile. / FDF / mRNA-decapping enzyme subunit 1 / Dcp1-like decapping family / YjeF N-terminal domain superfamily / YjeF-related protein N-terminus / YjeF N-terminal domain / YjeF N-terminal domain profile. / mRNA decapping protein 2, Box A domain / mRNA decapping protein 2, Box A domain superfamily / mRNA decapping enzyme 2 , NUDIX hydrolase domain / Dcp2, box A domain / Dcp2, box A domain / : / Sm domain profile. / NUDIX hydrolase, conserved site / Nudix box signature. / Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB) / NUDIX domain / PH-domain like / Nudix hydrolase domain profile. / NUDIX hydrolase domain / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / PH-like domain superfamily / Roll / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / KLLA0F23980p / KLLA0E01827p / Enhancer of mRNA-decapping protein 3類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Kluyveromyces lactis NRRL Y-1140 (酵母) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 多波長異常分散 / 解像度: 3.5 Å |
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データ登録者 | Charenton, C. / Taverniti, V. / Gaudon-Plesse, C. / Back, R. / Seraphin, B. / Graille, M. |
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資金援助 | フランス, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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French National Research Agency | ANR-11-BSV800902 | フランス |
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引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Mol.Biol. / 年: 2016 タイトル: Structure of the active form of Dcp1-Dcp2 decapping enzyme bound to m(7)GDP and its Edc3 activator. 著者: Charenton, C. / Taverniti, V. / Gaudon-Plesse, C. / Back, R. / Seraphin, B. / Graille, M. |
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履歴 | 登録 | 2016年8月9日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2016年10月5日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年10月19日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2016年11月16日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2017年9月6日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
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改定 2.0 | 2024年5月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / entity / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight ..._chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _entity.formula_weight / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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