PDB-5knl: Crystal structure of S. pombe ubiquitin E1 (Uba1) in complex with...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5knl

タイトル

Crystal structure of S. pombe ubiquitin E1 (Uba1) in complex with Ubc15 and ubiquitin

要素

Ubiquitin
Ubiquitin-activating enzyme E1 1
Ubiquitin-conjugating enzyme E2 15

キーワード

LIGASE / UBIQUITIN / E1 / E2 / UBA1 / UBC15 / CONFORMATIONAL CHANGE / THIOESTER / ADENYLATION / THIOESTER TRANSFER (TRANSTHIOESTERIFICATION) / ATP-Binding / UBIQUITIN E2 BINDING / UBIQUITINATION

機能・相同性

機能・相同性情報

Synthesis of active ubiquitin: roles of E1 and E2 enzymes / Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation / E1 ubiquitin-activating enzyme / ubiquitin activating enzyme activity / E2 ubiquitin-conjugating enzyme / ubiquitin conjugating enzyme activity / protein polyubiquitination / ubiquitin-dependent protein catabolic process / proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process / protein ubiquitination ...
類似検索 - 分子機能

Ubiquitin-activating enzyme E1, inactive adenylation domain, subdomain 2 / Ubiquitin-activating enzyme E1, inactive adenylation domain, subdomain 1 / Ubiquitin-activating enzyme E1, SCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme E1, UFD domain / Ubiquitin-activating enzyme E1, FCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme E1 / Ubiquitin-activating enzyme E1, C-terminal / Ubiquitin-activating enzyme E1, FCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme E1, four-helix bundle / Ubiquitin-activating enzyme E1, C-terminal domain superfamily ...Ubiquitin-activating enzyme E1, inactive adenylation domain, subdomain 2 / Ubiquitin-activating enzyme E1, inactive adenylation domain, subdomain 1 / Ubiquitin-activating enzyme E1, SCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme E1, UFD domain / Ubiquitin-activating enzyme E1, FCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme E1 / Ubiquitin-activating enzyme E1, C-terminal / Ubiquitin-activating enzyme E1, FCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme E1, four-helix bundle / Ubiquitin-activating enzyme E1, C-terminal domain superfamily / Ubiquitin-activating enzyme E1, SCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme E1, FCCH domain superfamily / Ubiquitin fold domain / Ubiquitin-activating enzyme E1 FCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme E1 four-helix bundle / Ubiquitin-activating enzyme e1 C-terminal domain / Ubiquitin-activating enzyme, SCCH domain / Ubiquitin-activating enzyme, SCCH domain / Ubiquitin/SUMO-activating enzyme E1-like / Ubiquitin-activating enzyme E1, inactive adenylation domain, subdomain 1 / Ubiquitin-activating enzyme E1, Cys active site / Ubiquitin-activating enzyme active site. / ThiF/MoeB/HesA family / THIF-type NAD/FAD binding fold / ThiF family / Ubiquitin-activating enzyme / Structural Genomics Hypothetical 15.5 Kd Protein In mrcA-pckA Intergenic Region; Chain A / : / Ubiquitin Conjugating Enzyme / Ubiquitin Conjugating Enzyme / Ubiquitin-conjugating enzyme, active site / Ubiquitin-conjugating (UBC) active site signature. / Ubiquitin-conjugating enzyme E2 / Ubiquitin-conjugating enzyme / Ubiquitin-conjugating (UBC) core domain profile. / Ubiquitin-conjugating enzyme E2, catalytic domain homologues / Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like / Ribosomal L40e family / Ribosomal_L40e / Ribosomal protein L40e / Ribosomal protein L40e superfamily / Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3 / FAD/NAD(P)-binding domain / 3-Layer(bba) Sandwich / : / Ubiquitin domain signature. / Ubiquitin conserved site / Ubiquitin domain / Ubiquitin family / Ubiquitin homologues / Ubiquitin domain profile. / Ubiquitin-like domain / Arc Repressor Mutant, subunit A / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / Ubiquitin-like domain superfamily / Roll / Beta Barrel / Rossmann fold / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Schizosaccharomyces pombe (分裂酵母)

Pseudozyma antarctica (菌類)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.5 Å

データ登録者

Olsen, S.K. / Lv, Z. / Yuan, L. / Williams, K.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Mol. Cell / 年: 2017
タイトル: S. pombe Uba1-Ubc15 Structure Reveals a Novel Regulatory Mechanism of Ubiquitin E2 Activity.
著者: Lv, Z. / Rickman, K.A. / Yuan, L. / Williams, K. / Selvam, S.P. / Woosley, A.N. / Howe, P.H. / Ogretmen, B. / Smogorzewska, A. / Olsen, S.K.

履歴

登録	2016年6月28日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2017年2月15日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年3月1日	Group: Database references
改定 1.2	2017年9月20日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2019年12月25日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2023年9月27日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.5	2024年11月6日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5knl_validation.pdf.gz	498 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5knl_full_validation.pdf.gz	513.7 KB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kn/5knl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kn/5knl	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4ii2S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	6q0r-d 6nya-2 6sj7-d 3icq-1 3k77-d 4ii2-d 4dm0-1 4j8f-1 6nya-1 21105 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (17) #203 - 2016年11月アミノペプチダーゼ1とオートファジー (Aminopeptidase 1 and Autophagy) 類似性 (3) #234 - 2019年6月 MDM2とがん (MDM2 and Cancer) 類似性 (7) #161 - 2013年5月リシン (Ricin) 類似性 (4)

登録構造単位

A: Ubiquitin-activating enzyme E1 1

B: Ubiquitin

C: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 15

D: Ubiquitin-activating enzyme E1 1

E: Ubiquitin

F: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 15

ヘテロ分子

287 kDa, 6 ポリマー
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1

A: Ubiquitin-activating enzyme E1 1

B: Ubiquitin

C: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 15

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
143 kDa, 3 ポリマー
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2

D: Ubiquitin-activating enzyme E1 1

E: Ubiquitin

F: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 15

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
143 kDa, 3 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	77.111, 82.238, 135.376
Angle α, β, γ (deg.)	102.10, 95.78, 90.86
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

#1: タンパク質	Ubiquitin-activating enzyme E1 1 / Poly(A)+ RNA transport protein 3 分子量: 111764.047 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (分裂酵母) 株: 972 / ATCC 24843 / 遺伝子: ptr3, SPBC1604.21c, SPBC211.09 / プラスミド: pSMT3 / 詳細 (発現宿主): pSMT3 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) codon plus / 参照: UniProt: O94609, E1 ubiquitin-activating enzyme
#2: タンパク質	Ubiquitin 分子量: 10904.229 Da / 分子数: 2 Mutation: K6R, K11R, K27R, S28A, K29R, K33R, K48R, S57A, K63R 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Pseudozyma antarctica (菌類) / 遺伝子: PAN0_008c3613 / プラスミド: pET-28 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) Codon Plus / 参照: UniProt: A0A081CFF0, UniProt: A0A081CEG8*PLUS
#3: タンパク質	Ubiquitin-conjugating enzyme E2 15 / E2 ubiquitin-conjugating enzyme 15 / Ubiquitin carrier protein 15 / Ubiquitin-protein ligase 15 分子量: 20199.912 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (分裂酵母) 株: 972 / ATCC 24843 / 遺伝子: ubc15, SPBC1105.09 / プラスミド: pET-29 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) codon plus / 参照: UniProt: Q9Y818, E2 ubiquitin-conjugating enzyme
#4: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 9 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 94 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.92 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.89 %
結晶化	温度: 291.15 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 0.1 M Tris-HCl pH 8.0-8.5, 0.3-0.4 M lithium sulfate, 15-18% w/v polyethylene glycol 8000 PH範囲: 8.0-8.5

-
データ収集

回折	平均測定温度: 108 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: RAYONIX MX300-HS / 検出器: CCD / 日付: 2014年7月31日
放射	モノクロメーター: Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.5→29.7 Å / Num. obs: 108289 / % possible obs: 96.9 % / 冗長度: 3.5 % / CC_1/2: 0.97 / R_merge(I) obs: 0.051 / Net I/σ(I): 10.2
反射シェル	解像度: 2.5→2.55 Å / 冗長度: 3.5 % / R_merge(I) obs: 0.289 / Mean I/σ(I) obs: 3.1 / CC_1/2: 0.34 / % possible all: 93.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
XDS		データ削減
XDS		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4II2

4ii2

解像度: 2.5→28.314 Å / SU ML: 0.43 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 2.53 / 位相誤差: 26.78

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2513	10828	10 %	random selection
R_work	0.216	-	-	-
obs	0.2196	108284	96.88 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.5→28.314 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	19279	0	45	94	19418

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	19751
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.699	26745
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.994	7409
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.027	2965
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	3482

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.5001-2.5284	0.3781	341	0.3546	3067	X-RAY DIFFRACTION	93
2.5284-2.5582	0.3859	352	0.3542	3175	X-RAY DIFFRACTION	93
2.5582-2.5893	0.3858	353	0.3418	3176	X-RAY DIFFRACTION	95
2.5893-2.6221	0.3517	350	0.326	3145	X-RAY DIFFRACTION	95
2.6221-2.6566	0.3551	366	0.3274	3295	X-RAY DIFFRACTION	95
2.6566-2.6929	0.3387	346	0.311	3118	X-RAY DIFFRACTION	95
2.6929-2.7314	0.3319	357	0.3117	3215	X-RAY DIFFRACTION	96
2.7314-2.7721	0.3439	359	0.2995	3220	X-RAY DIFFRACTION	96
2.7721-2.8154	0.349	357	0.2928	3217	X-RAY DIFFRACTION	96
2.8154-2.8615	0.3214	359	0.2893	3229	X-RAY DIFFRACTION	96
2.8615-2.9108	0.3288	354	0.2924	3194	X-RAY DIFFRACTION	96
2.9108-2.9637	0.3232	361	0.2924	3239	X-RAY DIFFRACTION	96
2.9637-3.0206	0.3248	359	0.2846	3238	X-RAY DIFFRACTION	97
3.0206-3.0822	0.2971	365	0.2657	3277	X-RAY DIFFRACTION	97
3.0822-3.1491	0.2937	363	0.2645	3279	X-RAY DIFFRACTION	97
3.1491-3.2223	0.3043	360	0.2551	3233	X-RAY DIFFRACTION	97
3.2223-3.3028	0.2639	365	0.2452	3292	X-RAY DIFFRACTION	98
3.3028-3.3919	0.2685	369	0.2304	3314	X-RAY DIFFRACTION	98
3.3919-3.4916	0.2659	363	0.2182	3269	X-RAY DIFFRACTION	98
3.4916-3.604	0.2374	366	0.1995	3300	X-RAY DIFFRACTION	98
3.604-3.7326	0.2527	368	0.1955	3303	X-RAY DIFFRACTION	99
3.7326-3.8817	0.2233	366	0.1902	3292	X-RAY DIFFRACTION	98
3.8817-4.0579	0.2004	368	0.168	3328	X-RAY DIFFRACTION	99
4.0579-4.2711	0.1953	366	0.1607	3287	X-RAY DIFFRACTION	99
4.2711-4.5377	0.1801	369	0.1523	3321	X-RAY DIFFRACTION	99
4.5377-4.8864	0.1787	368	0.141	3307	X-RAY DIFFRACTION	99
4.8864-5.3751	0.1854	362	0.1476	3273	X-RAY DIFFRACTION	98
5.3751-6.146	0.2104	366	0.1647	3288	X-RAY DIFFRACTION	98
6.146-7.7172	0.198	368	0.1562	3311	X-RAY DIFFRACTION	98
7.7172-28.3162	0.1629	362	0.1437	3254	X-RAY DIFFRACTION	97

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.2355	0.0016	-0.0206	0.0711	0.1096	0.2071	0.1853	-0.1692	-0.3904	0.1198	-0.0142	-0.2145	0.1228	0.1822	0.7179	0.1119	0.0229	-0.0741	0.1747	0.0093	0.3464	28.1116	-95.7338	1.2257
2	0.0187	-0.0039	0.0054	0.0024	0.0014	0.0029	0.0606	-0.03	-0.0318	-0.0247	-0.0595	-0.0645	-0.0076	-0.0844	0	0.2962	0.0648	-0.0709	0.8976	-0.0436	0.5949	-14.5963	-96.9714	0.739
3	0.0644	-0.0362	0.1252	0.1329	-0.0334	0.4494	0.1383	-0.0474	-0.2366	0.0038	-0.0167	0.0247	0.2701	-0.1921	0.125	0.2831	0.0447	-0.1682	0.1824	0.1144	0.5918	15.8735	-112.407	-3.6621
4	0.2698	0.0542	0.3072	0.1998	-0.0733	0.4332	0.1189	0.1092	-0.2884	-0.1904	0.0879	-0.1898	0.1871	0.3602	1.2561	0.0828	0.0453	0.0474	0.1952	-0.0924	0.2652	30.1154	-95.0603	-19.693
5	0.2699	-0.195	0.0366	0.2131	-0.0157	0.1135	-0.071	-0.0069	0.1621	0.0219	0.0433	-0.1832	-0.1874	-0.1419	-0.1705	0.2382	0.2023	0.0597	0.0361	-0.1939	0.0176	-0.4906	-67.0306	-16.9409
6	0.0457	-0.0075	0.05	0.2616	-0.041	0.07	-0.1696	-0.0953	0.2169	-0.0402	0.001	-0.2519	-0.1802	-0.0775	-0.1776	0.2936	0.0813	-0.05	0.1431	-0.0364	0.2714	-0.1755	-61.5856	-14.0224
7	0.2478	0.0426	-0.0023	0.0508	-0.0192	0.0284	0.148	0.3134	-0.1439	-0.1566	-0.0101	-0.1054	0.1178	-0.0021	0.392	0.4434	0.0837	-0.0312	0.2907	-0.1028	0.1577	12.4136	-92.0513	-44.8619
8	0.0143	0.0255	0.0035	0.0524	-0	0.0125	-0.0567	0.0017	-0.0248	0.0261	-0.0326	-0.002	0.0089	0.0124	-0.0413	0.315	-0.1668	-0.0564	0.1436	0.0542	0.3964	-0.3831	-106.941	-13.2167
9	0.0009	0.0002	-0.0012	0.0002	-0.0002	0.0038	0.0001	-0.0052	0.0034	-0.009	-0.0042	0.0025	0.0008	0.0007	0	0.713	-0.0812	-0.1072	0.7509	-0.041	0.7321	-6.1274	-115.2908	-24.5958
10	0.0011	0.0002	-0.0013	0.0031	-0.0004	0.0013	0.0483	-0.0012	-0.0187	0.0148	0.0252	-0.0014	-0.0146	-0.0092	-0	0.4143	-0.0199	0.03	0.4123	0.0538	0.706	-5.651	-104.0922	-22.9983
11	0.0024	0.001	-0.0008	0.0006	-0.0005	-0.0001	0.0185	0.0223	-0.0103	0.0212	-0.0148	0.0041	-0.0352	-0.0395	0	0.3302	0.0474	-0.0802	0.1775	-0.0222	0.4331	1.008	-98.7682	-23.6359
12	0.0018	0.0007	0.0005	0.0025	-0.0035	0.0034	-0.0194	0.0011	-0.0334	-0.0389	-0.0177	-0.0375	0.0249	0.0005	-0	0.4408	0.0392	-0.1328	0.2603	-0.0761	0.4425	5.1845	-110.6601	-27.4678
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14	0.0108	-0.0033	0.0081	0.0036	-0.0032	0.0039	0.0343	-0.0205	0.0119	0.0345	0.0579	-0.0149	0.0464	-0.02	0	0.2312	0.0029	-0.1023	0.2662	0.0212	0.3639	8.4862	-98.5564	-18.9881
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32	0.0049	-0.0002	0.0023	0.0053	0.0007	0.0029	0.0259	0.0041	-0.0119	0.0496	-0.0056	-0.0026	-0.0214	-0.0194	0	0.7696	0.0876	-0.334	0.4247	-0.1575	0.5875	32.2521	-47.0006	45.9584
33	0.0029	-0.0065	0.0017	0.0244	-0.0031	0.004	-0.0153	-0.0305	-0.006	0.0032	-0.0288	0.0056	-0.0212	-0.0109	-0.0001	0.3262	0.0708	-0.0163	0.3654	-0.046	0.3611	31.8747	-58.8424	41.6438
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36	0.0031	-0.0032	-0	0.0034	-0.0003	0.0001	0.0343	-0.0294	-0.0299	-0.0249	0.0682	-0.0081	0.0385	-0.0265	0.0001	0.3808	-0.0445	-0.0674	0.3894	-0.0551	0.2231	47.069	-84.9293	69.9861
37	0.0375	-0.0026	0.0085	0.0343	0.0265	0.0196	-0.0138	-0.1892	-0.0649	-0.0351	0.0562	-0.0029	-0.0676	-0.053	0.0012	0.3377	-0.0829	-0.0224	0.5577	0.14	0.3486	35.0352	-90.5561	67.5231
38	0.0044	-0.0024	-0.0058	0.0031	0.001	0.0053	-0.0843	-0.1398	0.0542	0.004	-0.0102	0.0648	0.0144	-0.0599	0	0.3574	0.0266	-0.0013	0.5004	-0.0129	0.385	28.9486	-82.8869	65.6124
39	0.0049	-0.0169	-0.0067	0.0707	0.0195	0.0054	0.0245	0.0856	-0.0406	0.1267	-0.0548	-0.0526	0.0608	-0.1738	-0.003	0.3903	-0.2242	-0.0208	0.8332	0.2391	0.5057	27.8788	-101.7495	76.5807

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 14 through 181 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 182 through 228 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 229 through 331 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 332 through 538 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 539 through 753 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 754 through 855 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 856 through 1012 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 1 through 16 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 17 through 22 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 23 through 33 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 34 through 44 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 45 through 56 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 57 through 64 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 65 through 76 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 1 through 17 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 18 through 36 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 37 through 99 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 100 through 109 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 110 through 129 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 130 through 148 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 149 through 171 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 14 through 538 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 539 through 752 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 753 through 904 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 905 through 1012 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 1 through 7 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 8 through 16 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 17 through 22 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'E' and (resid 23 through 33 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'E' and (resid 34 through 44 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'E' and (resid 45 through 56 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'E' and (resid 57 through 65 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'E' and (resid 66 through 70 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'E' and (resid 71 through 76 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resid 1 through 17 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resid 18 through 36 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 37 through 94 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 95 through 138 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'F' and (resid 139 through 171 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

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