登録情報 データベース : PDB / ID : 5jan 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Exploitation of a Novel Binding Pocket in Human Lipoprotein-Associated Phospholipase A2 (Lp-PLA2 ) Discovered Through X-Ray Fragment Screening 要素Platelet-activating factor acetylhydrolase 詳細 キーワード HYDROLASE / phospholipase / lipid metabolism機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
plasma lipoprotein particle oxidation / platelet activating factor catabolic process / calcium-independent phospholipase A2 activity / 1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase / platelet activating factor metabolic process / 1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase activity / lipid oxidation / phosphatidylcholine catabolic process / low-density lipoprotein particle / high-density lipoprotein particle ... plasma lipoprotein particle oxidation / platelet activating factor catabolic process / calcium-independent phospholipase A2 activity / 1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase / platelet activating factor metabolic process / 1-alkyl-2-acetylglycerophosphocholine esterase activity / lipid oxidation / phosphatidylcholine catabolic process / low-density lipoprotein particle / high-density lipoprotein particle / low-density lipoprotein particle remodeling / positive regulation of monocyte chemotaxis / peptide hormone processing / hydrolase activity, acting on ester bonds / Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin / phospholipid binding / positive regulation of inflammatory response / extracellular region 類似検索 - 分子機能 Platelet-activating factor acetylhydrolase, eucaryote / Platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform II / Lipases, serine active site. / Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain / Alpha/Beta hydrolase fold / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Chem-6HP / Platelet-activating factor acetylhydrolase 類似検索 - 構成要素生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / 解像度 : 2.12 Å 詳細データ登録者 Day, P.J. 引用ジャーナル : J.Med.Chem. / 年 : 2016タイトル : Exploitation of a Novel Binding Pocket in Human Lipoprotein-Associated Phospholipase A2 (Lp-PLA2) Discovered through X-ray Fragment Screening.著者: Woolford, A.J. / Pero, J.E. / Aravapalli, S. / Berdini, V. / Coyle, J.E. / Day, P.J. / Dodson, A.M. / Grondin, P. / Holding, F.P. / Lee, L.Y. / Li, P. / Manas, E.S. / Marino, J. / Martin, A.C. ... 著者 : Woolford, A.J. / Pero, J.E. / Aravapalli, S. / Berdini, V. / Coyle, J.E. / Day, P.J. / Dodson, A.M. / Grondin, P. / Holding, F.P. / Lee, L.Y. / Li, P. / Manas, E.S. / Marino, J. / Martin, A.C. / McCleland, B.W. / McMenamin, R.L. / Murray, C.W. / Neipp, C.E. / Page, L.W. / Patel, V.K. / Potvain, F. / Rich, S. / Rivero, R.A. / Smith, K. / Somers, D.O. / Trottet, L. / Velagaleti, R. / Williams, G. / Xie, R. 履歴 登録 2016年4月12日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2016年5月25日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2016年6月22日 Group : Database references改定 1.2 2019年10月16日 Group : Data collection / カテゴリ : reflns_shell改定 1.3 2024年5月8日 Group : Data collection / Database references / Derived calculationsカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry
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