PDB-5izn: The crystal structure of 50S ribosomal protein L25 from Vibrio vu...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5izn

タイトル

The crystal structure of 50S ribosomal protein L25 from Vibrio vulnificus CMCP6

要素

50S ribosomal protein L25

キーワード

RIBOSOMAL PROTEIN / structural genomics / The Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID

機能・相同性

機能・相同性情報

5S rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / structural constituent of ribosome / translation
類似検索 - 分子機能

生物種

Vibrio vulnificus (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 2.35 Å

データ登録者

Tan, K. / Zhou, M. / Kwon, K. / Anderson, W.F. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: The crystal structure of 50S ribosomal protein L25 from Vibrio vulnificus CMCP6
著者: Tan, K. / Zhou, M. / Kwon, K. / Anderson, W.F. / Joachimiak, A.

履歴

登録	2016年3月25日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年4月6日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年9月21日	Group: Structure summary
改定 1.2	2017年9月20日	Group: Author supporting evidence / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list / software Item: _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _software.classification
改定 1.3	2019年12月11日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2024年10月9日	Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5izn.cif.gz	305.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5izn.ent.gz	256.5 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5izn.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/iz/5izn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/iz/5izn	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5izi PDB 未公開エントリ
類似構造データ	3hw8-d 2emt-1 6x1g-2 2y84-3 2y84-4 4rzr-1 6sq8-5 6m2d-d 5otw-d 2y7w-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: IDP91357

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#253 - 2021年1月エクスプレソーム (Expressome) 類似性 (1) #157 - 2013年1月転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA) 類似性 (1) #262 - 2021年10月 PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures ) 類似性 (1)

登録構造単位

A: 50S ribosomal protein L25

B: 50S ribosomal protein L25

C: 50S ribosomal protein L25

D: 50S ribosomal protein L25

E: 50S ribosomal protein L25

F: 50S ribosomal protein L25

G: 50S ribosomal protein L25

H: 50S ribosomal protein L25

ヘテロ分子

86.4 kDa, 8 ポリマー
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1

A: 50S ribosomal protein L25

B: 50S ribosomal protein L25

C: 50S ribosomal protein L25

D: 50S ribosomal protein L25

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
43.3 kDa, 4 ポリマー
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2

E: 50S ribosomal protein L25

F: 50S ribosomal protein L25

G: 50S ribosomal protein L25

H: 50S ribosomal protein L25

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
43.1 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	128.451, 58.797, 122.004
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.51, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

#1: タンパク質	50S ribosomal protein L25 分子量: 10703.843 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Vibrio vulnificus (strain CMCP6) (バクテリア) 株: CMCP6 / 遺伝子: rplY, VV1_2850 / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)magic / 参照: UniProt: Q8D8W6
#2: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 88 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.73 Å³/Da / 溶媒含有率: 54.88 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.2 / 詳細: 1.0M NaH2PO4/K2HPO4

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 0.97932 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2015年12月6日 / 詳細: mirror
放射	モノクロメーター: Si 111 / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97932 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.35→50 Å / Num. obs: 38178 / % possible obs: 98.6 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3.5 % / R_merge(I) obs: 0.089 / Net I/σ(I): 22.446
反射シェル	解像度: 2.35→2.39 Å / 冗長度: 3.2 % / R_merge(I) obs: 0.843 / Mean I/σ(I) obs: 1.3 / % possible all: 95.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
HKL-3000		位相決定
HKL-3000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散 / 解像度: 2.35→34.22 Å / SU ML: 0.31 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 27.63

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2521	1667	4.98 %	random
R_work	0.2049	-	-	-
obs	0.2072	33500	87.58 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.35→34.22 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5721	0	40	88	5849

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.002	5879
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.447	7946
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.73	2180
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.02	880
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.002	1043

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.35-2.4191	0.3379	82	0.2719	1364	X-RAY DIFFRACTION	46
2.4191-2.4972	0.3523	115	0.272	1681	X-RAY DIFFRACTION	57
2.4972-2.5864	0.308	109	0.2829	2171	X-RAY DIFFRACTION	72
2.5864-2.6899	0.3067	107	0.2854	2589	X-RAY DIFFRACTION	85
2.6899-2.8123	0.338	161	0.2725	2883	X-RAY DIFFRACTION	95
2.8123-2.9605	0.2953	149	0.2483	2982	X-RAY DIFFRACTION	99
2.9605-3.1459	0.287	164	0.2414	2983	X-RAY DIFFRACTION	99
3.1459-3.3886	0.3063	170	0.2276	3005	X-RAY DIFFRACTION	99
3.3886-3.7292	0.2411	128	0.1947	3044	X-RAY DIFFRACTION	99
3.7292-4.2679	0.2117	152	0.1703	3016	X-RAY DIFFRACTION	100
4.2679-5.3738	0.1869	144	0.1484	3080	X-RAY DIFFRACTION	100
5.3738-34.2237	0.205	186	0.1721	3035	X-RAY DIFFRACTION	97

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	9.5284	3.3552	-5.7523	3.186	-1.5352	7.7431	0.7281	1.5209	0.4993	-1.7782	-0.618	-0.9117	0.1577	1.7769	0.1367	0.4118	-0.0911	0.0872	0.545	0.0135	0.2705	48.0418	38.857	47.1704
2	5.7752	1.9015	-0.8311	8.9897	4.8504	3.6615	0.2536	-0.3518	-0.3495	0.7121	-0.2121	0.126	0.6188	0.3901	-0.0222	0.2421	0.0848	0.0023	0.2123	0.0708	0.3192	50.6137	35.0808	66.7302
3	2.5286	-0.5489	-0.7095	5.7405	-0.3921	3.9053	-0.4705	0.1231	0.1205	-0.7996	0.2471	0.1476	0.1027	0.2616	0.1032	0.1366	-0.0351	0.013	0.1127	0.0495	0.3145	44.2108	35.9354	56.1578
4	3.4015	-3.0574	1.6347	2.9617	-0.2493	8.2877	-0.2297	0.0146	-0.0994	-0.4314	0.0332	0.0627	0.2896	0.2403	0.2071	0.2001	-0.0096	0.0122	0.1609	-0.0177	0.3001	40.5665	37.8062	48.6696
5	1.9807	-0.7966	-3.277	1.8021	0.4286	5.9579	0.4417	0.7403	-1.8113	-0.2746	0.1224	-0.1308	0.9824	-0.7037	-0.6001	0.3458	-0.0617	-0.126	0.352	-0.1054	0.6563	35.8727	49.0925	63.9583
6	5.3905	1.2637	-2.1728	5.48	2.1437	4.5944	-0.3769	-0.2605	0.1083	-0.371	0.2361	0.3162	-1.2168	0.742	-0.1119	0.3341	0.0074	-0.1211	0.241	-0.1005	0.2971	46.7262	62.1535	80.3374
7	8.9465	-3.8187	-3.0239	2.7361	0.009	3.8917	0.2656	0.1807	1.3211	-0.23	-0.2149	0.3832	-1.6407	-1.6144	-0.6572	0.6044	0.1938	-0.2157	0.3657	-0.1582	0.7405	34.4921	67.3318	77.7265
8	5.8905	-0.366	2.233	8.6926	4.4608	4.7831	0.3375	-0.6732	-0.3793	0.8483	0.1729	0.2265	0.535	-0.197	-0.4267	0.1821	-0.0941	0.0478	0.2213	0.0136	0.3416	37.2385	47.3462	82.0224
9	3.2614	0.3213	0.5892	3.9156	0.241	3.1214	-0.4153	-0.3065	0.6695	-0.1261	-0.0142	0.302	-0.5971	-0.1105	0.2756	0.2081	-0.019	-0.0477	0.1355	-0.0933	0.3225	41.0732	60.8748	76.861
10	1.6908	-1.6875	-1.7206	2.9829	2.4125	5.602	0.1162	-0.1099	0.8297	-0.0507	-0.1605	0.0167	-1.4206	-0.0876	-0.1517	0.4615	0.0026	-0.2177	0.1222	-0.0784	0.8118	41.2534	67.7712	78.4169
11	5.065	0.1546	-0.3298	5.6609	1.3016	4.0959	0.034	-0.7991	1.3318	-0.0531	-0.2385	0.2189	-0.8397	0.0592	0.2204	0.4285	0.0122	-0.1744	0.2891	-0.1201	0.3682	44.0901	66.358	81.4867
12	4.4598	2.3887	3.6132	7.8881	5.6592	8.6636	-0.2416	0.2388	-0.4266	-0.2784	-0.1015	0.1862	-0.4741	0.0872	0.1821	0.0334	0.0595	-0.0355	0.2383	-0.0727	0.3097	47.1787	50.8848	66.571
13	4.3915	3.4191	3.8587	3.9956	4.1514	4.4151	0.1665	-0.031	-0.0435	0.1132	-0.2854	0.3096	0.786	-0.2383	0.1918	0.3062	-0.0558	0.0592	0.1644	-0.0217	0.2322	38.5096	33.0418	54.1818
14	2.5215	-0.3767	2.3705	3.3054	-1.6348	4.8755	0.466	-0.5425	-0.7208	0.2258	0.2178	-0.0201	1.0191	-0.1489	-1.2389	0.431	0.312	-0.0842	0.5757	0.2987	0.2742	62.171	38.3862	83.6457
15	4.9089	1.5966	-3.6089	7.5883	-3.6962	6.214	0.1554	0.5011	0.0244	0.0532	0.0263	-0.8266	-0.6736	0.4368	-0.2337	0.197	-0.0603	-0.0262	0.5686	0.0335	0.2859	69.652	55.9213	77.3642
16	4.3182	-2.2873	-0.2192	5.3349	1.4096	2.2246	-0.1704	-0.6513	0.205	0.3292	0.22	-0.0645	0.4384	0.2383	0.0263	0.1156	0.0412	-0.0255	0.3312	0.068	0.0464	57.575	51.6963	80.355
17	3.5612	0.6005	-0.5325	4.6192	1.4686	4.3586	-0.128	-0.4466	-0.3111	0.5392	-0.1352	-0.8681	1.0109	0.4491	0.0262	0.3117	0.129	-0.0253	0.4242	0.1461	0.2026	65.8692	43.1912	77.4506
18	7.1347	0.7004	1.1934	7.9591	-0.2748	7.6689	-0.1272	-0.0406	-1.9387	-0.4439	-0.3629	0.0267	1.873	-0.2624	0.1022	0.5807	-0.086	0.0205	0.2608	-0.001	0.417	56.9847	35.4135	74.6082
19	6.2972	1.1039	0.2519	5.5052	0.2538	4.3689	0.337	-0.9805	-0.1742	0.3544	0.044	-0.0642	0.5836	-0.1294	0.1447	0.1375	-0.0724	-0.0595	0.4995	0.1599	0.2219	59.4638	44.4315	86.7632
20	4.1297	0.5855	-1.3041	4.3403	-1.369	8.8396	0.0508	-0.3209	-0.1145	-0.0723	-0.1932	0.1597	0.4189	-0.4414	-0.1406	0.2232	-0.0434	-0.0178	0.2923	0.2287	0.1477	55.4838	45.3944	79.1608
21	3.4153	0.0749	-1.3385	1.9153	-0.601	7.426	0.018	-0.1065	-0.3473	-0.3154	-0.0292	-0.1672	1.0107	0.5927	-0.0061	0.2428	0.0566	-0.0112	0.2822	0.0561	0.2341	61.9708	47.3873	70.5104
22	6.3714	0.6631	4.8338	4.555	1.2055	4.0276	0.5718	-1.0444	-0.4348	0.4628	-0.2788	0.1002	0.5738	-1.12	-0.2532	0.1969	-0.0929	-0.0589	0.3648	0.0647	0.3587	23.9304	28.7467	70.5192
23	0.7454	-0.0536	1.1104	2.3236	1.0344	4.1666	-0.0333	-0.5904	0.1199	-0.2592	-0.3226	0.2989	0.0639	-1.1119	0.0968	0.1451	-0.101	-0.0049	0.347	0.0009	0.3499	19.1176	34.1653	66.9632
24	5.2691	0.7108	-1.7448	2.0767	1.0125	4.0736	-0.1037	-0.7504	-0.3737	0.3164	-0.4416	0.0406	0.4762	-0.2976	0.1786	0.0545	-0.1776	0.0443	0.2545	0.0098	0.3247	27.1251	33.086	72.6009
25	6.6736	0.4439	1.4862	8.9156	2.0529	1.3122	0.1689	-0.8816	0.2237	1.085	-0.0711	-0.8731	0.563	-0.4365	0.045	0.3249	-0.0958	-0.0474	0.3056	0.1004	0.2363	31.896	34.6452	79.5381
26	5.0902	0.7522	-2.1046	8.4568	0.2284	0.9644	0.4798	-0.6013	-0.4757	-0.9102	-0.3109	-0.1409	0.3752	-0.0622	-0.0486	0.3177	-0.1168	-0.1957	0.1685	0.086	0.3347	33.7048	34.18	72.6635
27	6.5853	-0.8983	1.2785	3.3593	0.4681	4.6746	-0.1391	-0.4212	1.2276	0.2659	-0.3345	-0.1657	-0.5497	-0.5753	0.3048	0.2353	-0.0238	-0.0154	0.1342	-0.0033	0.498	25.3769	41.8612	70.8643
28	5.4925	-1.104	0.6469	1.1286	-0.2926	0.108	-0.0822	0.1718	0.2978	0.1893	-0.3621	-0.3566	0.5487	-0.3843	0.2195	1.0682	-0.1206	0.0035	0.7115	0.2914	0.3757	8.1357	19.8731	121.6171
29	4.7521	0.6133	-1.553	2.3385	1.7168	3.4427	0.0369	0.0758	-0.3857	0.2102	0.157	-0.3073	0.5823	-0.6594	-0.0405	0.8263	-0.1124	0.0102	0.576	0.1405	0.2294	13.6825	17.537	117.2443
30	6.4587	-1.5693	-0.7268	2.6072	2.6376	3.3661	-0.2593	0.1715	-1.2219	0.8147	-0.3328	0.034	0.6948	-1.1698	0.087	1.0566	-0.4968	0.1861	0.9712	-0.0237	0.5692	8.2322	9.7078	116.4124
31	5.0245	6.0007	2.7175	7.5336	2.938	1.6954	0.3337	0.5425	0.1804	0.756	0.3989	0.1875	-0.0892	-0.1956	-0.6702	0.9947	-0.2136	0.0659	0.6405	-0.0153	0.4522	28.896	32.7872	110.6167
32	1.035	1.0939	1.3703	3.2436	1.3105	2.2823	-1.1441	1.098	0.1823	-0.4328	0.4588	0.3684	0.083	-0.0517	0.4164	0.8365	-0.3036	0.0469	0.8662	0.0104	0.5873	26.7098	40.6501	104.3239
33	2.5291	1.1855	0.7985	2.6427	0.5965	0.2747	-0.0702	0.9884	-0.1354	0.1382	0.139	0.09	-0.2601	-0.1313	-0.2099	1.1141	-0.5371	0.1287	0.8706	-0.1702	0.307	29.2811	40.125	107.8562
34	3.1951	0.9236	0.2571	5.8666	0.58	4.2634	-0.4462	0.4864	-0.4705	0.2188	0.078	0.0851	0.2193	-0.1804	0.2124	0.7932	-0.2812	0.1285	0.6414	-0.0501	0.4601	34.6739	40.4517	108.5667
35	3.1758	0.1353	3.2527	3.1021	-1.6067	8.7239	0.3388	0.4306	-0.8885	-0.2775	-0.1589	-0.3206	0.7575	0.439	-0.1954	0.9625	-0.1816	0.079	0.4967	-0.1082	0.5236	41.8087	35.669	110.008
36	6.3834	-0.359	1.0242	9.3051	-6.2844	4.3442	-0.3293	0.0947	-0.4155	-0.3789	0.173	0.3111	0.7162	-0.5648	0.3227	0.8243	-0.2202	0.1809	0.5424	-0.1021	0.4219	40.5374	43.1033	110.2144
37	2.9685	2.2573	1.6944	9.1068	1.7209	1.2902	-0.8327	-0.2261	0.4056	-0.2492	1.7706	-2.4763	-0.8866	2.2704	-0.9746	1.2315	0.0017	-0.0217	0.9605	-0.0866	0.7765	31.0671	27.2168	119.427
38	3.5202	1.2293	3.1004	4.245	2.6536	3.7902	-0.686	0.2415	-0.663	-0.6042	0.6445	-0.0409	0.0039	-0.804	0.0991	0.7793	-0.2055	0.0317	0.5922	0.1335	0.4135	12.6253	17.1012	112.5832
39	9.9381	2.6614	6.5811	5.3078	-1.3944	6.5269	0.0062	-0.7307	1.6342	0.3735	-1.0476	1.0087	-1.0655	-1.0959	0.3475	0.4594	0.0512	0.175	0.565	-0.114	0.328	2.0773	33.5657	95.8243
40	7.837	2.0697	3.726	3.9624	-2.8784	6.1671	0.5925	0.8183	-1.5767	-0.4116	-0.7241	-0.7862	-0.0015	0.4835	0.0037	0.5504	0.283	0.1066	1.0248	0.2375	0.5589	10.3521	19.0681	88.0316
41	2.9668	1.6291	0.1678	5.1149	-3.5386	8.3282	0.2903	-0.1381	0.3398	0.7419	-0.2466	0.1696	-0.7747	-0.2922	0.4285	0.4484	-0.1224	-0.1436	0.7728	0.2477	0.1059	7.7686	28.4381	96.6317
42	2.6695	-2.1272	1.2315	2.3918	1.088	6.6946	0.4478	-1.4293	1.6134	1.0474	-0.0592	-0.0825	-1.7443	1.0394	-0.3271	1.186	-0.32	0.0221	0.9974	-0.2655	0.5369	8.0269	36.9072	100.1989
43	4.772	-0.2363	-0.7794	4.9157	0.402	9.1024	0.1359	-1.2679	0.3774	0.8235	-0.6665	0.1215	-0.9728	0.6656	0.5059	0.8933	-0.2241	-0.0041	0.7707	-0.0027	0.3236	8.1447	30.5248	102.8736
44	8.2988	-0.0346	-3.4637	4.4894	-1.7746	6.9116	0.577	0.0569	0.3939	0.3388	-0.4253	-0.5636	-0.6147	0.357	0.203	0.5119	-0.149	-0.0819	0.72	0.0839	0.2542	16.1584	29.2933	95.6041
45	4.5474	0.2074	-4.5152	4.9019	-0.1782	5.4603	0.1544	-1.4206	0.5212	1.1104	-0.1822	0.0907	-1.2673	0.7089	0.1513	1.0814	0.01	-0.049	0.7388	-0.1783	0.5255	26.1261	45.0731	135.3028
46	4.9793	2.8208	0.6613	6.3229	-0.1927	4.6899	0.456	-0.8399	0.9251	0.3623	0.2974	0.9369	-0.6231	-0.3079	-0.4236	0.7689	0.0826	0.1749	0.5061	-0.1503	0.4822	19.0707	40.9448	128.9165
47	6.2171	0.6223	0.5866	7.3597	0.1891	8.4028	-0.1903	-0.39	0.8469	0.5877	0.9692	0.6815	-0.6876	-0.0805	-0.7498	0.5139	0.0631	0.1045	0.3987	-0.0299	0.6261	19.0172	39.5902	127.3797
48	7.7307	0.6935	-0.0784	2.9751	-2.9443	2.9628	0.2034	0.0299	1.1622	0.1807	-0.0987	0.1889	-0.3152	0.6457	-0.6483	0.5964	0.009	0.0838	0.4136	-0.0403	0.4481	22.3368	39.1879	125.1281

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid -1 through 5 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 6 through 22 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 23 through 49 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 50 through 75 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 76 through 85 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 86 through 92 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid -1 through 5 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 6 through 22 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 23 through 55 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 56 through 63 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 64 through 75 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 76 through 85 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 86 through 92 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 0 through 4 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 5 through 22 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 23 through 36 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 37 through 49 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 50 through 58 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 59 through 65 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 66 through 76 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 77 through 92 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 1 through 12 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 13 through 30 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 31 through 49 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 50 through 65 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 66 through 76 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 77 through 92 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 0 through 14 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'E' and (resid 15 through 58 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'E' and (resid 59 through 75 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'E' and (resid 76 through 92 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 1 through 22 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 23 through 29 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resid 30 through 49 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resid 50 through 63 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resid 64 through 75 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 76 through 81 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 82 through 92 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'G' and (resid 0 through 7 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'G' and (resid 8 through 22 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'G' and (resid 23 through 49 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'G' and (resid 50 through 65 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'G' and (resid 66 through 76 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'G' and (resid 77 through 92 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'H' and (resid 1 through 21 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'H' and (resid 22 through 56 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'H' and (resid 57 through 83 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'H' and (resid 84 through 92 )

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