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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5iq2 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of Esterase mutant - L255W | ||||||
![]() | Esterase | ||||||
![]() | HYDROLASE / Esterase / Est25 / Hormone-Sensitive Lipase | ||||||
機能・相同性 | short-chain carboxylesterase activity / Alpha/beta hydrolase fold-3 / alpha/beta hydrolase fold / Alpha/Beta hydrolase fold, catalytic domain / Alpha/Beta hydrolase fold / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta / Esterase![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Seok, S.-H. / Seo, M.-D. / Kim, J. / Ryu, Y. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of Esterase mutant - F72G 著者: Seok, S.-H. / Seo, M.-D. / Kim, J. / Ryu, Y. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 293.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 237.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 450.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 464.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 61.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 92.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 38411.957 Da / 分子数: 4 / 変異: L255W / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.01 Å3/Da / 溶媒含有率: 59.12 % |
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結晶化 | 温度: 299 K / 手法: マイクロバッチ法 / pH: 7 / 詳細: 2.4 M sodium malonate (pH 7.0) |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 270 / 検出器: CCD / 日付: 2015年2月14日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.97935 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.78→25 Å / Num. obs: 174151 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 7.5 % / Net I/σ(I): 38.83 |
反射 シェル | 解像度: 1.78→1.81 Å / 冗長度: 7.5 % / Mean I/σ(I) obs: 6.5 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.78→22.725 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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