PDB-5inn: Mouse Tdp2 D358N protein, apo state with increased disorder among...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5inn

タイトル

Mouse Tdp2 D358N protein, apo state with increased disorder amongst variable DNA-binding grasp conformations

要素

Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

キーワード

HYDROLASE / dna repair / endonuclease/exonuclease/phosphatase (EEP) domain

機能・相同性

機能・相同性情報

tyrosyl-RNA phosphodiesterase activity / 5'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity / Nonhomologous End-Joining (NHEJ) / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; リン酸ジエステル加水分解酵素 / phosphoric diester hydrolase activity / aggresome / neuron development / PML body / double-strand break repair / manganese ion binding ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Mus musculus (ハツカネズミ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.8 Å

データ登録者

Schellenberg, M.J. / Appel, C.D. / Williams, R.S.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2016
タイトル: Reversal of DNA damage induced Topoisomerase 2 DNA-protein crosslinks by Tdp2.
著者: Schellenberg, M.J. / Perera, L. / Strom, C.N. / Waters, C.A. / Monian, B. / Appel, C.D. / Vilas, C.K. / Williams, J.G. / Ramsden, D.A. / Williams, R.S.

履歴

登録	2016年3月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年4月27日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年5月18日	Group: Database references
改定 1.2	2017年9月20日	Group: Author supporting evidence / Database references ...Author supporting evidence / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: citation / pdbx_audit_support ...citation / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list / struct_keywords Item: _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization ..._citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_keywords.pdbx_keywords
改定 1.3	2019年12月18日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2023年9月27日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5inn.cif.gz	484.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5inn.ent.gz	402.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5inn.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/in/5inn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/in/5inn	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5ht2C 5inkC 5inlC 5inmC 5inoC 5inpC 5inqC 4gz1S S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4jpq-1 2jc4-d 4gyz-6 6cac-1 4gyz-1 4ey2-1 6orr-4 5inm-4 3uz5-1 1gt6-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#18 - 2001年6月ミオシン (Myosin) 類似性 (3) #19 - 2001年7月アクチン (Actin) 類似性 (3)

登録構造単位

A: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

B: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

C: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

D: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

E: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

ヘテロ分子

145 kDa, 5 ポリマー
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1

A: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
29.1 kDa, 1 ポリマー
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2

B: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
28.9 kDa, 1 ポリマー
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3

C: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
29 kDa, 1 ポリマー
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4

D: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
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5

E: Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
29 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	95.440, 114.880, 115.450
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 / Tyr-DNA phosphodiesterase 2 / 5'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase / 5'-Tyr-DNA phosphodiesterase / ...Tyr-DNA phosphodiesterase 2 / 5'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase / 5'-Tyr-DNA phosphodiesterase / TRAF and TNF receptor-associated protein 分子量: 28904.246 Da / 分子数: 5 / 断片: unp residues 118-370 / 変異: D358N / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: Tdp2, Ttrap / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) 参照: UniProt: Q9JJX7, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; リン酸ジエステル加水分解酵素
#2: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION 分子量: 96.063 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#3: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL 分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION 分子量: 35.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 148 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.19 Å³/Da / 溶媒含有率: 43.83 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 14-18% PEG3350, 100mM HEPES, 200mM lithium sulfate, 10mM magnesium acetate

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 22-ID / 波長: 1 Å

検出器

タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2015年3月14日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.8→50 Å / Num. obs: 30546 / % possible obs: 95.7 % / 冗長度: 4.2 % / B_iso Wilson estimate: 45.96 Å² / R_merge(I) obs: 0.113 / R_pim(I) all: 0.061 / R_rim(I) all: 0.129 / Χ²: 0.971 / Net I/av σ(I): 10.556 / Net I/σ(I): 6.2 / Num. measured all: 127542

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Diffraction-ID	% possible all
2.8-2.9	3.4	0.459	1	93
2.9-3.02	4	0.379	1	97.8
3.02-3.15	4.3	0.277	1	97.9
3.15-3.32	4.3	0.192	1	97.7
3.32-3.53	4.3	0.14	1	97.3
3.53-3.8	4.3	0.108	1	96.9
3.8-4.18	4.3	0.083	1	96.2
4.18-4.79	4.3	0.07	1	95.4
4.79-6.03	4.3	0.079	1	94.1
6.03-50	4.2	0.052	1	90.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SCALEPACK		データスケーリング
PHENIX		精密化
PDB_EXTRACT	3.2	データ抽出
DENZO		データ削減
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4GZ1

4gz1

解像度: 2.8→49.393 Å / SU ML: 0.38 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 27.19

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2555	1543	5.17 %
R_work	0.2128	-	-
obs	0.2151	29851	49.45 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 175.71 Å² / B_iso mean: 52.9844 Å² / B_iso min: 5.68 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.8→49.393 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9386	0	28	148	9562
B_iso mean	-	-	83.97	28.33	-
残基数	-	-	-	-	1182

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.002	9647
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.577	13045
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.027	1444
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.002	1661
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	9.928	3555

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 11

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.8003-2.8907	0.3463	116	0.3023	1960	2076	38
2.8907-2.994	0.376	126	0.2817	2500	2626	48
2.994-3.1139	0.3125	140	0.2697	2657	2797	51
3.1139-3.2556	0.2746	142	0.2432	2657	2799	51
3.2556-3.4272	0.2931	127	0.2405	2672	2799	51
3.4272-3.6418	0.2752	143	0.2158	2650	2793	51
3.6418-3.9229	0.2517	147	0.1941	2635	2782	51
3.9229-4.3175	0.2303	136	0.1852	2642	2778	51
4.3175-4.9417	0.1846	144	0.156	2642	2786	51
4.9417-6.2241	0.2319	157	0.2032	2616	2773	51
6.2241-49.4009	0.2586	165	0.2218	2677	2842	52

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	6.1011	-0.8248	0.4511	6.2599	0.3738	4.44	0.2209	0.0657	-0.0384	-0.4988	-0.1842	-0.5022	-0.1718	0.4804	-0.0104	0.2423	-0.0728	0.0019	0.2723	0.0481	0.2676	57.5698	-29.8425	-3.7974
2	3.4576	0.1295	0.8558	8.1267	-0.4438	4.047	0.0887	-0.2605	0.0429	0.5059	-0.0839	0.0677	-0.1299	0.1621	-0.0199	0.1606	-0.0378	-0.0225	0.2897	0.028	0.2204	49.7396	-32.8533	6.9987
3	8.8472	1.0249	0.6845	5.1888	-2.2919	6.7507	0.0892	-0.0801	-0.5329	0.3051	0.3155	0.3582	0.5451	-0.3308	-0.2503	0.247	-0.0635	-0.0783	0.2458	0.0643	0.3651	41.317	-43.6612	4.685
4	6.9705	-0.4799	1.1955	4.7757	-2.7576	4.8613	0.1726	0.8771	-0.6625	-0.9882	0.0954	0.194	1.1566	-0.0037	-0.2936	0.5781	-0.0207	-0.2285	0.3692	-0.0487	0.4757	44.4572	-43.2247	-9.2717
5	2.3772	0.467	-1.614	4.2399	-1.0447	7.4889	0.2238	-0.3488	0.4056	-0.0888	0.5505	0.5686	-0.2307	-0.9697	-0.5753	0.3765	-0.0697	-0.1703	0.4356	0.1425	0.4329	37.1829	-33.7083	-4.9109
6	8.3506	-1.4843	0.0008	5.3108	-0.8489	3.69	-0.1054	1.3754	-0.7084	-1.0101	-0.2358	-0.0599	0.3339	0.0766	0.196	0.4653	-0.065	0.0624	0.2996	-0.0574	0.3225	53.6878	-33.8176	-11.202
7	6.0089	0.6291	0.0826	6.5233	-1.0929	4.5844	0.0683	-0.7277	0.126	0.6317	-0.1106	-0.3522	-0.1526	0.2467	-0.0065	0.2533	0.0146	-0.0354	0.2712	-0.0478	0.2182	59.2921	-6.167	-18.3635
8	3.4156	0.7694	0.2011	4.4088	0.6034	4.2004	-0.0094	0.1136	-0.0104	-0.3876	0.0061	0.222	0.3196	0.1244	0.0413	0.192	0.0385	0.011	0.2663	0.0394	0.1883	48.8925	-14.0093	-29.8165
9	4.5386	1.7823	-1.8324	6.054	0.6384	7.1395	-0.1076	0.6912	-0.829	-0.8948	-0.639	-0.7215	1.4737	1.0249	0.4814	0.4438	0.024	0.148	0.446	0.0591	0.3032	58.468	-17.8876	-32.5636
10	7.1304	-0.332	1.1907	5.7435	-1.6262	6.7667	-0.0252	0.1868	-0.1358	-0.041	-0.3143	-0.3983	-0.1092	1.0528	0.4322	0.2416	-0.0263	-0.0031	0.252	-0.0084	0.3853	65.492	-9.9342	-28.7698
11	4.8388	2.1988	1.9431	6.6655	1.7909	6.0009	0.3083	-0.3662	-0.4208	1.0801	-0.2798	-0.2282	-0.1987	0.1925	-0.9462	0.5494	-0.2047	0.1621	-0.0243	-0.3106	0.4194	22.6219	-0.8662	-7.4674
12	5.6039	1.944	-0.7843	4.7504	-0.3561	2.5804	0.0761	-0.258	-0.2919	0.1884	-0.0219	-0.1993	0.0717	0.0562	-0.0407	0.2321	0.0097	0.0501	0.2219	-0.0029	0.3203	29.2432	-4.3285	-11.6974
13	6.9792	1.8647	-0.0913	4.8759	-0.0056	2.1701	0.0452	0.229	1.2847	-0.1538	-0.0104	0.2891	-0.2391	-0.3305	-0.0075	0.2347	0.0327	0.05	0.3678	0.0685	0.4869	22.4868	9.5435	-21.1644
14	7.0729	0.204	1.9625	6.8225	0.9083	3.3017	-0.2399	0.0103	0.3124	0.6836	0.2407	0.2505	0.162	0.3767	0.0133	0.2603	0.0462	0.1089	0.2874	0.0513	0.5508	15.9684	0.0047	-14.3501
15	5.7238	0.2475	2.5388	6.2119	-0.7843	1.6854	-0.257	-0.7573	-0.9836	1.1191	-0.5159	0.7248	0.1434	0.2513	0.6432	0.3873	-0.1654	0.0389	0.3306	0.1267	0.408	39.2538	21.8138	3.0137
16	2.9192	-0.0926	0.647	4.8407	-0.483	0.1821	-0.4204	-0.3677	-0.2658	0.9927	0.1439	0.3233	1.0212	-0.4643	0.2768	0.6377	-0.208	0.1722	0.4333	-0.0717	0.3925	36.7175	17.6951	3.9606
17	1.2659	-3.3515	-2.9109	9.3747	7.308	7.0549	-0.7383	-0.6333	-1.1183	1.3262	-0.4958	1.6427	1.6976	-0.343	1.0815	1.0531	-0.0222	0.2675	0.5304	0.091	0.7598	38.9171	13.1764	11.1717
18	3.8306	-0.6333	-2.2699	4.0298	1.3862	4.2044	-0.202	-0.9728	0.0906	0.6761	0.6531	-0.5445	0.7922	0.7207	-0.3072	0.5446	0.2295	-0.1392	0.6121	-0.043	0.3428	50.9194	22.3827	9.2138
19	1.8809	1.6198	-0.416	3.1789	-2.3939	2.4571	-0.176	-0.761	0.4541	0.6215	0.3686	-1.1582	-0.1126	1.2011	-0.0942	0.336	0.0779	-0.1078	0.7605	-0.2506	0.5432	57.6535	28.6147	3.6236
20	9.4747	-6.5517	-6.3918	7.247	5.2856	8.4926	0.9937	0.1118	1.3665	-0.6103	-0.0496	-1.584	-1.1903	1.0935	-0.852	0.5233	-0.1667	-0.0256	0.699	-0.1455	0.6954	54.1122	36.1434	-3.1574
21	5.3773	2.5429	-0.7652	7.019	0.9296	8.0956	0.1382	0.1184	0.408	-0.0628	0.0306	0.3271	-0.3998	0.101	-0.1212	0.3043	-0.0068	-0.0453	0.2844	-0.0267	0.2714	46.0188	27.9372	-7.6713
22	5.1835	2.409	-0.3371	2.0799	-0.2732	3.5158	0.1954	0.7745	0.1984	0.3029	-0.7276	0.8387	0.2602	-1.3815	0.6369	0.441	-0.123	0.0299	0.5527	-0.2363	0.4952	35.7046	22.6002	-2.6282
23	0.7525	-0.94	-1.2535	4.8573	-1.5786	4.992	0.1032	-0.9955	-0.4848	0.36	-0.1212	-0.7756	0.0717	0.1754	-0.0727	0.3411	-0.0231	-0.1281	0.5029	0.0904	0.3628	64.786	-16.1954	37.5783
24	4.8041	0.558	0.5394	7.2668	-0.4035	3.9686	-0.093	0.3961	-0.0399	-0.3781	0.0817	-0.37	0.4444	0.1453	0.0524	0.3045	-0.0161	0.0139	0.2844	-0.0117	0.2107	64.4398	-11.8107	22.5818
25	5.0263	0.5236	1.1552	6.577	1.8964	7.1763	-0.6104	0.2784	1.0647	-0.7084	0.3908	0.3913	-0.5669	-0.5722	0.2089	0.2491	-0.0177	-0.0983	0.3756	0.0209	0.4754	54.6283	-3.749	20.8162
26	1.9623	0.8405	0.3192	3.4895	0.7652	0.8258	0.0146	-0.998	0.4653	-0.0991	0.2054	0.1632	-0.5464	-0.5341	0.0815	0.0238	0.066	-0.0251	1.1021	-0.1813	0.7138	46.0693	-4.8899	30.002
27	0.445	0.6252	-0.6043	3.8324	0.0045	5.2205	0.3832	-2.1944	1.1678	1.2327	-1.3086	0.9117	-0.4912	-0.7815	0.4483	0.5913	-0.3339	0.1217	0.9594	-0.5001	0.8293	56.3279	0.7138	36.3559
28	2.558	-0.5067	-1.7295	5.2011	-1.1519	1.8914	-0.1894	-0.8007	0.2013	0.5669	-0.0473	0.6075	-0.0609	-0.8299	0.0432	0.3041	-0.0872	0.0371	0.5686	-0.0304	0.2948	53.7215	-11.2457	34.7439

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 122 through 174 )	A	122 - 174
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 175 through 243 )	A	175 - 243
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 244 through 283 )	A	244 - 283
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 284 through 325 )	A	284 - 325
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 326 through 345 )	A	326 - 345
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 346 through 369 )	A	346 - 369
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 122 through 190 )	B	122 - 190
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 191 through 303 )	B	191 - 303
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 304 through 336 )	B	304 - 336
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 337 through 369 )	B	337 - 369
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 122 through 138 )	C	122 - 138
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 139 through 240 )	C	139 - 240
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 241 through 325 )	C	241 - 325
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 326 through 369 )	C	326 - 369
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 122 through 138 )	D	122 - 138
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 139 through 164 )	D	139 - 164
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 165 through 182 )	D	165 - 182
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 183 through 243 )	D	183 - 243
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 244 through 272 )	D	244 - 272
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 273 through 292 )	D	273 - 292
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 293 through 345 )	D	293 - 345
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 346 through 369 )	D	346 - 369
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 122 through 174 )	E	122 - 174
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 175 through 260 )	E	175 - 260
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'E' and (resid 261 through 289 )	E	261 - 289
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 290 through 303 )	E	290 - 303
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 304 through 325 )	E	304 - 325
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 326 through 369 )	E	326 - 369

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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