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- PDB-5im5: Crystal structure of designed two-component self-assembling icosa... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5im5 | ||||||
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Title | Crystal structure of designed two-component self-assembling icosahedral cage I53-40 | ||||||
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![]() | PROTEIN BINDING / icosahedron / designed protein cage / two-component / computational design / protein engineering / Rosetta / self-assembling / co-assembling / multimerization / symmetry / nanomaterial / nanostructure | ||||||
Function / homology | ![]() riboflavin synthase / 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase / riboflavin synthase activity / 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase activity / riboflavin synthase complex / riboflavin biosynthetic process Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Liu, Y.A. / Cascio, D. / Sawaya, M.R. / Bale, J.B. / Collazo, M.J. / Thomas, C. / Sheffler, W. / King, N.P. / Baker, D. / Yeates, T.O. | ||||||
![]() | ![]() Title: Accurate design of megadalton-scale two-component icosahedral protein complexes. Authors: Bale, J.B. / Gonen, S. / Liu, Y. / Sheffler, W. / Ellis, D. / Thomas, C. / Cascio, D. / Yeates, T.O. / Gonen, T. / King, N.P. / Baker, D. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 1.9 MB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 1.6 MB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | ![]() 5im4C ![]() 5im6C ![]() 2b98S ![]() 4e38S S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 1
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