PDB-5hj3: Crystal structure of host-primed Ebola virus GP, GPcl.

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5hj3

タイトル

Crystal structure of host-primed Ebola virus GP, GPcl.

要素

(Envelope glycoprotein) x 2
(KZ52 Antibody Fragment) x 2

キーワード

VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM / Ebola virus / EOV / Ebolavirus / GP / glycoprotein / GPcl / cleaved / primed / proteolytically / receptor binding pocket / crest / trough / MR72 / KZ52 / broadly neutralizing / VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex

機能・相同性

機能・相同性情報

host cell endoplasmic reticulum / viral budding from plasma membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / symbiont-mediated-mediated suppression of host tetherin activity / entry receptor-mediated virion attachment to host cell / host cell cytoplasm / symbiont-mediated suppression of host innate immune response / membrane raft / symbiont entry into host cell / fusion of virus membrane with host endosome membrane ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Ebola virus sp. (エボラウイルス)

Zaire ebolavirus (エボラウイルス)

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.3 Å

データ登録者

Bornholdt, Z.A. / Fusco, M.L. / Saphire, E.O.

引用

ジャーナル: Mbio / 年: 2016
タイトル: Host-Primed Ebola Virus GP Exposes a Hydrophobic NPC1 Receptor-Binding Pocket, Revealing a Target for Broadly Neutralizing Antibodies.
著者: Bornholdt, Z.A. / Ndungo, E. / Fusco, M.L. / Bale, S. / Flyak, A.I. / Crowe, J.E. / Chandran, K. / Saphire, E.O.

履歴

登録	2016年1月12日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年3月9日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年5月4日	Group: Database references
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_oper_list / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年10月30日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_conn Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI ..._chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5hj3.cif.gz	1.5 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5hj3.ent.gz	1.3 MB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5hj3.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	5hj3_validation.pdf.gz	1.6 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5hj3_full_validation.pdf.gz	1.6 MB	表示
XML形式データ	5hj3_validation.xml.gz	98.1 KB	表示
CIF形式データ	5hj3_validation.cif.gz	127.2 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hj/5hj3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hj/5hj3	HTTPS FTP

-
関連構造データ

類似構造データ	6oz9-1 7956 3csy-2 7955 3csy-1 7928 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#178 - 2014年10月エボラウイルスタンパク質 (Ebola Virus Proteins) 類似性 (6) #21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (4)

登録構造単位

C: Envelope glycoprotein

D: Envelope glycoprotein

E: KZ52 Antibody Fragment

F: KZ52 Antibody Fragment

G: Envelope glycoprotein

H: Envelope glycoprotein

I: KZ52 Antibody Fragment

J: KZ52 Antibody Fragment

K: Envelope glycoprotein

L: Envelope glycoprotein

M: KZ52 Antibody Fragment

N: KZ52 Antibody Fragment

O: Envelope glycoprotein

P: Envelope glycoprotein

A: KZ52 Antibody Fragment

B: KZ52 Antibody Fragment

ヘテロ分子

336 kDa, 16 ポリマー
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1

C: Envelope glycoprotein

D: Envelope glycoprotein

I: KZ52 Antibody Fragment

J: KZ52 Antibody Fragment

ヘテロ分子

C: Envelope glycoprotein

D: Envelope glycoprotein

I: KZ52 Antibody Fragment

J: KZ52 Antibody Fragment

ヘテロ分子

C: Envelope glycoprotein

D: Envelope glycoprotein

I: KZ52 Antibody Fragment

J: KZ52 Antibody Fragment

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
252 kDa, 12 ポリマー
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2

E: KZ52 Antibody Fragment

F: KZ52 Antibody Fragment

G: Envelope glycoprotein

H: Envelope glycoprotein

K: Envelope glycoprotein

L: Envelope glycoprotein

M: KZ52 Antibody Fragment

N: KZ52 Antibody Fragment

O: Envelope glycoprotein

P: Envelope glycoprotein

A: KZ52 Antibody Fragment

B: KZ52 Antibody Fragment

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
252 kDa, 12 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	193.103, 193.103, 350.320
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	146
Space group name H-M	H3

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:
NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Selection details	Auth asym-ID
1	1	1	chain A and segid E000	A
2	1	1	chain E and segid	E
3	1	1	chain I and segid	I
4	1	1	chain M and segid	M
1	1	2	chain B and segid E000	B
2	1	2	chain F and segid	F
3	1	2	chain J and segid	J
4	1	2	chain N and segid	N
1	1	3	chain C and segid	C
2	1	3	chain G and segid	G
3	1	3	chain K and segid	K
4	1	3	chain O and segid	O
1	1	4	chain D and segid	D
2	1	4	chain H and segid	H
3	1	4	chain L and segid	L
4	1	4	chain P and segid	P

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4

#1: タンパク質

Envelope glycoprotein / GP1 / 2 / GP

分子量: 19604.180 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 32-194 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Ebola virus sp. (エボラウイルス)
遺伝子: GP / 発現宿主:

Drosophila (ハエ) / 参照: UniProt: Q05320

#2: タンパク質

Envelope glycoprotein / GP1 / 2 / GP

分子量: 15335.362 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 502-637 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Zaire ebolavirus (エボラウイルス)
株: Kikwit-95 / 遺伝子: GP / 発現宿主:

Drosophila (ハエ) / 参照: UniProt: P87666

#3: 抗体

KZ52 Antibody Fragment

分子量: 24020.977 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主:

Drosophila (ハエ)

#4: 抗体

KZ52 Antibody Fragment

分子量: 23896.557 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主:

Drosophila (ハエ)

#5: 多糖

alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D- ...

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 1235.105 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-6DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/3,7,6/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-f1_d2-e1_f6-g1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}[(6+1)][a-D-Manp]{[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}}	LINUCS	PDB-CARE

Has protein modification

Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.79 Å³/Da / 溶媒含有率: 67.55 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.7 詳細: 25% PEG 550 MME, 10% 2-propanol, 5% ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 4.7, and 100 mM calcium chloride.

-
データ収集

回折

平均測定温度: 80 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 23-ID-D / 波長: 1.03316 Å

検出器

タイプ: PSI PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2013年6月23日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.03316 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 3.3→48.28 Å / Num. obs: 73208 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 3.89 % / B_iso Wilson estimate: 124.67 Å² / R_merge(I) obs: 0.1 / Χ²: 1.17 / Net I/σ(I): 7 / Num. measured all: 286816 / Scaling rejects: 2152

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Num. measured all	Num. unique all	Χ²	Rejects	% possible all
3.3-3.42	3.88	0.731	1.3	28668	7325	1.51	274	100
3.42-3.55	3.88	0.609	1.7	28564	7292	1.45	272	100
3.55-3.72	3.88	0.484	2.3	28719	7330	1.39	267	100
3.72-3.91	3.89	0.377	3	28826	7359	1.32	222	100
3.91-4.16	3.89	0.268	4.1	28554	7288	1.24	193	100
4.16-4.48	3.9	0.169	6.2	28860	7353	1.09	211	100
4.48-4.93	3.9	0.121	8.7	28700	7307	0.99	178	100
4.93-5.64	3.91	0.105	10	28768	7320	0.97	181	100
5.64-7.1	3.91	0.095	11	28854	7339	0.93	168	100
7.1-48.28	3.85	0.045	21.9	28303	7295	0.84	186	99.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
d*TREK	9.9.9.6L	データスケーリング
PHASER	2.5.4	位相決定
PDB_EXTRACT	3.15	データ抽出
d*TREK		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 3.3→48.276 Å / SU ML: 0.48 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.96 / 位相誤差: 29.25 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2584	3688	5.04 %
R_work	0.2269	69455	-
obs	0.2284	73143	99.86 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 374.24 Å² / B_iso mean: 144.6901 Å² / B_iso min: 20 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 3.3→48.276 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	20544	0	612	0	21156
B_iso mean	-	-	218.01	-	-
残基数	-	-	-	-	2680

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	21390
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.699	29044
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.026	3320
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	3680
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.723	7774

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	4531	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
1	2	E	4531	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
1	3	I	4531	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
1	4	M	4531	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
2	1	B	4637	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
2	2	F	4637	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
2	3	J	4637	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
2	4	N	4637	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
3	1	C	3720	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
3	2	G	3720	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
3	3	K	3720	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
3	4	O	3720	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
4	1	D	2635	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
4	2	H	2635	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
4	3	L	2635	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL
4	4	P	2635	X-RAY DIFFRACTION	6.665	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 26

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
3.3-3.3434	0.3723	134	0.3803	2673	2807	100
3.3434-3.3892	0.4427	126	0.3785	2706	2832	100
3.3892-3.4376	0.3726	147	0.3605	2661	2808	100
3.4376-3.4889	0.3123	144	0.3514	2657	2801	100
3.4889-3.5434	0.3749	168	0.334	2657	2825	100
3.5434-3.6015	0.3214	154	0.3219	2671	2825	100
3.6015-3.6636	0.3563	151	0.3194	2640	2791	100
3.6636-3.7302	0.3395	145	0.3068	2674	2819	100
3.7302-3.8019	0.3361	155	0.3101	2669	2824	100
3.8019-3.8795	0.2804	139	0.2938	2656	2795	100
3.8795-3.9638	0.329	161	0.2905	2665	2826	100
3.9638-4.0559	0.2805	152	0.2771	2667	2819	100
4.0559-4.1573	0.2723	138	0.2545	2661	2799	100
4.1573-4.2697	0.2704	132	0.2323	2712	2844	100
4.2697-4.3952	0.2605	114	0.2325	2685	2799	100
4.3952-4.537	0.2347	139	0.2008	2673	2812	100
4.537-4.699	0.2132	143	0.2012	2692	2835	100
4.699-4.887	0.2564	139	0.2028	2680	2819	100
4.887-5.1092	0.2397	132	0.1938	2686	2818	100
5.1092-5.3782	0.2521	129	0.2054	2703	2832	100
5.3782-5.7147	0.2786	139	0.2165	2648	2787	100
5.7147-6.1551	0.2575	140	0.2168	2692	2832	100
6.1551-6.773	0.2328	140	0.2156	2667	2807	100
6.773-7.7496	0.2133	136	0.2088	2685	2821	100
7.7496-9.7504	0.2276	151	0.1694	2659	2810	100
9.7504-48.2809	0.2093	140	0.1845	2616	2756	97

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	9.1914	4.6644	-4.474	4.8913	-2.8487	5.3915	-0.3844	0.4598	-1.142	2.1376	-0.0803	-0.278	-1.0759	-0.7004	0.4762	1.2574	-0.0555	-0.062	1.2559	-0.2145	1.1249	179.9291	96.2966	-0.4796
2	6.3542	-2.574	1.7684	7.314	3.2016	3.633	-0.2469	-1.6849	-1.4498	1.6412	0.2092	0.9803	-0.4617	-0.431	0.044	1.4251	-0.0797	0.2148	1.5818	0.2128	1.5174	183.448	102.0185	5.942
3	3.0335	0.8423	0.0767	4.4356	0.3973	4.0116	0.101	0.5369	-0.3408	-0.7552	0.1103	0.308	0.3875	-0.0521	-0.195	1.1006	-0.0048	0.0283	1.1948	-0.0833	1.0772	179.6222	94.8649	-26.0676
4	5.6738	-3.5606	0.2973	2.8462	2.3974	8.5564	0.0222	0.8721	-0.9569	-0.5932	0.1367	-0.2819	0.8918	-0.3407	-0.2946	1.2223	0.0143	-0.0596	1.3429	-0.1834	1.1041	186.0185	90.4154	-30.3706
5	5.5594	5.3905	0.2698	9.2746	1.2353	0.475	-0.2263	1.3665	0.8396	-0.9788	1.1085	1.7919	0.297	-0.4394	-0.6786	1.2738	0.0781	-0.1941	1.4176	0.0443	1.2054	172.5685	101.1998	-30.8956
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91	4.6711	-3.289	-3.2122	7.796	1.3834	3.5903	-0.0472	2.6895	1.2125	0.0775	-0.6143	-0.1258	-3.599	1.7758	1.0336	1.745	-0.4905	-0.0327	2.5944	0.0086	1.6662	173.7176	109.924	54.115
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102	3.0966	0.2832	2.7959	5.9528	0.7887	7.4234	-1.3454	-0.978	-1.691	1.3975	1.4441	-1.9626	-0.6913	0.5272	-0.0615	2.1286	0.4842	-0.3157	1.897	-0.3376	1.7117	177.6592	134.6067	129.4558
103	5.9498	-1.6796	-6.0084	0.952	1.4235	6.7093	1.2627	-1.0383	1.5987	-0.6574	-0.075	-0.7727	0.7749	2.037	-1.2612	2.3331	0.4239	-0.7139	1.8834	-0.8316	2.0538	178.5385	141.1013	139.9173

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN C AND RESID 31:45 )	C	31 - 45
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN C AND RESID 46:59 )	C	46 - 59
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN C AND RESID 60:124 )	C	60 - 124
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN C AND RESID 125:144 )	C	125 - 144
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN C AND RESID 145:158 )	C	145 - 158
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN C AND RESID 159:176 )	C	159 - 176
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN C AND RESID 177:189 )	C	177 - 189
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN D AND RESID 504:519 )	D	504 - 519
9	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN D AND RESID 520:524 )	D	520 - 524
10	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN D AND RESID 525:529 )	D	525 - 529
11	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN D AND RESID 530:583 )	D	530 - 583
12	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN D AND RESID 584:601 )	D	584 - 601
13	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN D AND RESID 602:613 )	D	602 - 613
14	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN E AND RESID 1:95 )	E	1 - 95
15	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN E AND RESID 96:100 )	E	96 - 100
16	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN E AND RESID 101:137 )	E	101 - 137
17	X-RAY DIFFRACTION	17	( CHAIN E AND RESID 138:221 )	E	138 - 221
18	X-RAY DIFFRACTION	18	( CHAIN F AND RESID 1:9 )	F	1 - 9
19	X-RAY DIFFRACTION	19	( CHAIN F AND RESID 10:75 )	F	10 - 75
20	X-RAY DIFFRACTION	20	( CHAIN F AND RESID 76:113 )	F	76 - 113
21	X-RAY DIFFRACTION	21	( CHAIN F AND RESID 114:129 )	F	114 - 129
22	X-RAY DIFFRACTION	22	( CHAIN F AND RESID 130:158 )	F	130 - 158
23	X-RAY DIFFRACTION	23	( CHAIN F AND RESID 159:211 )	F	159 - 211
24	X-RAY DIFFRACTION	24	( CHAIN G AND RESID 31:45 )	G	31 - 45
25	X-RAY DIFFRACTION	25	( CHAIN G AND RESID 46:176 )	G	46 - 176
26	X-RAY DIFFRACTION	26	( CHAIN G AND RESID 177:188 )	G	177 - 188
27	X-RAY DIFFRACTION	27	( CHAIN H AND RESID 504:519 )	H	504 - 519
28	X-RAY DIFFRACTION	28	( CHAIN H AND RESID 520:524 )	H	520 - 524
29	X-RAY DIFFRACTION	29	( CHAIN H AND RESID 525:529 )	H	525 - 529
30	X-RAY DIFFRACTION	30	( CHAIN H AND RESID 530:583 )	H	530 - 583
31	X-RAY DIFFRACTION	31	( CHAIN H AND RESID 584:601 )	H	584 - 601
32	X-RAY DIFFRACTION	32	( CHAIN H AND RESID 602:613 )	H	602 - 613
33	X-RAY DIFFRACTION	33	( CHAIN I AND RESID 1:51 )	I	1 - 51
34	X-RAY DIFFRACTION	34	( CHAIN I AND RESID 52:95 )	I	52 - 95
35	X-RAY DIFFRACTION	35	( CHAIN I AND RESID 96:100 )	I	96 - 100
36	X-RAY DIFFRACTION	36	( CHAIN I AND RESID 101:118 )	I	101 - 118
37	X-RAY DIFFRACTION	37	( CHAIN I AND RESID 119:157 )	I	119 - 157
38	X-RAY DIFFRACTION	38	( CHAIN I AND RESID 162:173 )	I	162 - 173
39	X-RAY DIFFRACTION	39	( CHAIN I AND RESID 174:207 )	I	174 - 207
40	X-RAY DIFFRACTION	40	( CHAIN I AND RESID 208:222 )	I	208 - 222
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43	X-RAY DIFFRACTION	43	( CHAIN J AND RESID 62:113 )	J	62 - 113
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45	X-RAY DIFFRACTION	45	( CHAIN J AND RESID 129:150 )	J	129 - 150
46	X-RAY DIFFRACTION	46	( CHAIN J AND RESID 151:163 )	J	151 - 163
47	X-RAY DIFFRACTION	47	( CHAIN J AND RESID 164:187 )	J	164 - 187
48	X-RAY DIFFRACTION	48	( CHAIN J AND RESID 188:206 )	J	188 - 206
49	X-RAY DIFFRACTION	49	( CHAIN K AND RESID 32:44 )	K	32 - 44
50	X-RAY DIFFRACTION	50	( CHAIN K AND RESID 45:59 )	K	45 - 59
51	X-RAY DIFFRACTION	51	( CHAIN K AND RESID 60:114 )	K	60 - 114
52	X-RAY DIFFRACTION	52	( CHAIN K AND RESID 115:124 )	K	115 - 124
53	X-RAY DIFFRACTION	53	( CHAIN K AND RESID 125:136 )	K	125 - 136
54	X-RAY DIFFRACTION	54	( CHAIN K AND RESID 137:176 )	K	137 - 176
55	X-RAY DIFFRACTION	55	( CHAIN K AND RESID 177:188 )	K	177 - 188
56	X-RAY DIFFRACTION	56	( CHAIN L AND RESID 504:519 )	L	504 - 519
57	X-RAY DIFFRACTION	57	( CHAIN L AND RESID 520:524 )	L	520 - 524
58	X-RAY DIFFRACTION	58	( CHAIN L AND RESID 525:529 )	L	525 - 529
59	X-RAY DIFFRACTION	59	( CHAIN L AND RESID 530:583 )	L	530 - 583
60	X-RAY DIFFRACTION	60	( CHAIN L AND RESID 584:596 )	L	584 - 596
61	X-RAY DIFFRACTION	61	( CHAIN L AND RESID 597:606 )	L	597 - 606
62	X-RAY DIFFRACTION	62	( CHAIN L AND RESID 607:613 )	L	607 - 613
63	X-RAY DIFFRACTION	63	( CHAIN M AND RESID 1:31 )	M	1 - 31
64	X-RAY DIFFRACTION	64	( CHAIN M AND RESID 32:51 )	M	32 - 51
65	X-RAY DIFFRACTION	65	( CHAIN M AND RESID 52:95 )	M	52 - 95
66	X-RAY DIFFRACTION	66	( CHAIN M AND RESID 96:100 )	M	96 - 100
67	X-RAY DIFFRACTION	67	( CHAIN M AND RESID 101:108 )	M	101 - 108
68	X-RAY DIFFRACTION	68	( CHAIN M AND RESID 109:157 )	M	109 - 157
69	X-RAY DIFFRACTION	69	( CHAIN M AND RESID 162:194 )	M	162 - 194
70	X-RAY DIFFRACTION	70	( CHAIN M AND RESID 195:222 )	M	195 - 222
71	X-RAY DIFFRACTION	71	( CHAIN N AND RESID 1:24 )	N	1 - 24
72	X-RAY DIFFRACTION	72	( CHAIN N AND RESID 25:75 )	N	25 - 75
73	X-RAY DIFFRACTION	73	( CHAIN N AND RESID 76:102 )	N	76 - 102
74	X-RAY DIFFRACTION	74	( CHAIN N AND RESID 103:118 )	N	103 - 118
75	X-RAY DIFFRACTION	75	( CHAIN N AND RESID 119:158 )	N	119 - 158
76	X-RAY DIFFRACTION	76	( CHAIN N AND RESID 159:174 )	N	159 - 174
77	X-RAY DIFFRACTION	77	( CHAIN N AND RESID 175:187 )	N	175 - 187
78	X-RAY DIFFRACTION	78	( CHAIN N AND RESID 188:211 )	N	188 - 211
79	X-RAY DIFFRACTION	79	( CHAIN O AND RESID 32:45 )	O	32 - 45
80	X-RAY DIFFRACTION	80	( CHAIN O AND RESID 46:59 )	O	46 - 59
81	X-RAY DIFFRACTION	81	( CHAIN O AND RESID 60:124 )	O	60 - 124
82	X-RAY DIFFRACTION	82	( CHAIN O AND RESID 125:176 )	O	125 - 176
83	X-RAY DIFFRACTION	83	( CHAIN O AND RESID 177:188 )	O	177 - 188
84	X-RAY DIFFRACTION	84	( CHAIN P AND RESID 504:519 )	P	504 - 519
85	X-RAY DIFFRACTION	85	( CHAIN P AND RESID 520:524 )	P	520 - 524
86	X-RAY DIFFRACTION	86	( CHAIN P AND RESID 525:529 )	P	525 - 529
87	X-RAY DIFFRACTION	87	( CHAIN P AND RESID 530:583 )	P	530 - 583
88	X-RAY DIFFRACTION	88	( CHAIN P AND RESID 584:596 )	P	584 - 596
89	X-RAY DIFFRACTION	89	( CHAIN P AND RESID 597:601 )	P	597 - 601
90	X-RAY DIFFRACTION	90	( CHAIN P AND RESID 602:606 )	P	602 - 606
91	X-RAY DIFFRACTION	91	( CHAIN P AND RESID 607:613 )	P	607 - 613
92	X-RAY DIFFRACTION	92	( CHAIN A AND RESID 1:19 )	A	1 - 19
93	X-RAY DIFFRACTION	93	( CHAIN A AND RESID 20:95 )	A	20 - 95
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103	X-RAY DIFFRACTION	103	( CHAIN B AND RESID 188:211 )	B	188 - 211

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新型コロナ情報

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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