PDB-5hca: Globular Domain of the Entamoeba histolytica calreticulin in comp...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5hca

タイトル

Globular Domain of the Entamoeba histolytica calreticulin in complex with glucose

要素

Calreticulin,Calreticulin

キーワード

SUGAR BINDING PROTEIN / chaperone / legume lectin domain

機能・相同性

機能・相同性情報

symbiont-mediated suppression of host complement activation / complement component C1q complex binding / uropod / host cell surface binding / phagocytic cup / positive regulation of phagocytosis / protein export from nucleus / unfolded protein binding / protein folding / carbohydrate binding ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Entamoeba histolytica HM-1:IMSS (赤痢アメーバ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.15 Å

データ登録者

Moreau, C.P. / Gaboriaud, C.

資金援助

フランス, 1件

引用

ジャーナル: IUCrJ / 年: 2016
タイトル: Structures of parasite calreticulins provide insights into their flexibility and dual carbohydrate/peptide-binding properties.
著者: Moreau, C. / Cioci, G. / Iannello, M. / Laffly, E. / Chouquet, A. / Ferreira, A. / Thielens, N.M. / Gaboriaud, C.

履歴

登録	2016年1月4日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2016年8月31日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年11月9日	Group: Database references
改定 1.2	2016年12月21日	Group: Database references
改定 1.3	2017年9月6日	Group: Advisory / Author supporting evidence カテゴリ: pdbx_audit_support / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2019年6月12日	Group: Data collection / Structure summary カテゴリ: audit_author / database_PDB_rev / database_PDB_rev_record Item: _audit_author.name
改定 1.5	2020年7月29日	Group: Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5hca.cif.gz	338.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5hca.ent.gz	282 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5hca.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	5hca_validation.pdf.gz	491.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5hca_full_validation.pdf.gz	497.6 KB	表示
XML形式データ	5hca_validation.xml.gz	32 KB	表示
CIF形式データ	5hca_validation.cif.gz	45 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hc/5hca ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hc/5hca	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5hcbC 5hcfC 5lk5C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	2euo-d 4oq7-d 4nvn-d 4jmt-d 3m25-d 1cmu-d 6o9w-2 2p87-d 2ddr-2 3v2g-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#32 - 2002年8月シャペロン (Chaperones) 類似性 (1) #108 - 2008年12月 Hsp90 (Hsp90) 類似性 (1) #110 - 2009年2月オーキシンとTIR1ユビキチンリガーゼ (Auxin and TIR1 Ubiquitin Ligase) 類似性 (1) #135 - 2011年3月インテグラーゼ (Integrase) 類似性 (1) #198 - 2016年6月 β-ガラクトシダーゼ (Beta-galactosidase) 類似性 (1) #75 - 2006年3月組織因子 (Tissue Factor) 類似性 (1) #77 - 2006年5月ブドウ糖酸化酵素 (Glucose Oxidase) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#32 - 2002年8月
シャペロン (Chaperones)
類似性 (1)
#108 - 2008年12月
Hsp90 (Hsp90)
類似性 (1)
#110 - 2009年2月
オーキシンとTIR1ユビキチンリガーゼ (Auxin and TIR1 Ubiquitin Ligase)
類似性 (1)
#135 - 2011年3月
インテグラーゼ (Integrase)
類似性 (1)
#198 - 2016年6月
β-ガラクトシダーゼ (Beta-galactosidase)
類似性 (1)
#75 - 2006年3月
組織因子 (Tissue Factor)
類似性 (1)
#77 - 2006年5月
ブドウ糖酸化酵素 (Glucose Oxidase)
類似性 (1)

登録構造単位

C: Calreticulin,Calreticulin

A: Calreticulin,Calreticulin

B: Calreticulin,Calreticulin

ヘテロ分子

95.3 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

C: Calreticulin,Calreticulin

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
31.6 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

A: Calreticulin,Calreticulin

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
32 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

3

B: Calreticulin,Calreticulin

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
31.7 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	74.360, 143.440, 171.590
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 / 糖 , 2種, 4分子 CAB

#1: タンパク質

Calreticulin,Calreticulin

分子量: 31471.197 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Entamoeba histolytica HM-1:IMSS (赤痢アメーバ)
プラスミド: pJexpress411 / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: F2VN92

#7: 糖

ChemComp-BGC / beta-D-glucopyranose / β-D-グルコピラノ-ス

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 180.156 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₆H₁₂O₆

-
非ポリマー , 6種, 267分子

#2: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-NH4 / AMMONIUM ION / アンモニウム分子量: 18.038 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: H₄N
#5: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: Cl
#6: 化合物	ChemComp-ACT / ACETATE ION / 酢酸イオン分子量: 59.044 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 式: C₂H₃O₂
#8: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 255 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 4.85 Å³/Da / 溶媒含有率: 74.62 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5 / 詳細: 2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M Tri-sodium citrate

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID23-1 / 波長: 0.97625 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年12月7日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97625 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.14→43 Å / Num. obs: 96632 / % possible obs: 99.2 % / 冗長度: 16.07 % / Net I/σ(I): 13.4
反射シェル	解像度: 2.15→2.2 Å / 冗長度: 3.48 % / Mean I/σ(I) obs: 1.57 / % possible all: 99.1

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.10.1_2155: ???)	精密化
PHASER		位相決定
Coot		モデル構築
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.15→43.229 Å / SU ML: 0.28 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.36 / 位相誤差: 21.89 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2213	4982	5 %
R_work	0.1933	-	-
obs	0.1947	99629	99.2 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.15→43.229 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6409	0	47	255	6711

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009	6697
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.913	9041
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	16.024	4059
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.064	939
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	1181

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.15-2.1744	0.3551	164	0.328	3129	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1744-2.2	0.3397	166	0.3256	3137	X-RAY DIFFRACTION	99
2.2-2.2268	0.3234	162	0.2928	3088	X-RAY DIFFRACTION	99
2.2268-2.255	0.299	165	0.2837	3127	X-RAY DIFFRACTION	100
2.255-2.2847	0.3165	165	0.2651	3148	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2847-2.316	0.2849	166	0.2534	3147	X-RAY DIFFRACTION	100
2.316-2.3491	0.2663	163	0.2387	3104	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3491-2.3841	0.239	167	0.2362	3173	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3841-2.4214	0.2605	165	0.2326	3129	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4214-2.4611	0.2601	166	0.2343	3155	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4611-2.5035	0.2533	165	0.2259	3131	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5035-2.549	0.3027	167	0.2302	3168	X-RAY DIFFRACTION	100
2.549-2.5981	0.2638	165	0.223	3129	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5981-2.6511	0.2692	166	0.2216	3162	X-RAY DIFFRACTION	99
2.6511-2.7087	0.2756	164	0.2134	3111	X-RAY DIFFRACTION	99
2.7087-2.7717	0.2008	165	0.2161	3142	X-RAY DIFFRACTION	99
2.7717-2.841	0.2447	167	0.2136	3169	X-RAY DIFFRACTION	100
2.841-2.9178	0.2515	165	0.2122	3142	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9178-3.0037	0.2315	167	0.2174	3171	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0037-3.1006	0.2256	168	0.2179	3182	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1006-3.2114	0.2304	166	0.2168	3155	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2114-3.3399	0.1972	166	0.2092	3164	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3399-3.4918	0.1996	164	0.184	3121	X-RAY DIFFRACTION	98
3.4918-3.6758	0.2	167	0.1814	3167	X-RAY DIFFRACTION	99
3.6758-3.906	0.2148	168	0.1636	3184	X-RAY DIFFRACTION	99
3.906-4.2074	0.1762	166	0.1626	3164	X-RAY DIFFRACTION	99
4.2074-4.6303	0.1919	168	0.1468	3183	X-RAY DIFFRACTION	98
4.6303-5.2993	0.1878	163	0.143	3110	X-RAY DIFFRACTION	96
5.2993-6.6726	0.2082	171	0.1885	3240	X-RAY DIFFRACTION	99
6.6726-43.2373	0.2251	175	0.19	3315	X-RAY DIFFRACTION	97

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.0496	0.1746	-0.6651	1.7688	-0.2888	2.6383	-0.0927	0.2469	-0.6034	0.3042	0.0698	0.2975	0.3671	-0.3291	0.0098	0.3982	-0.0365	0.0749	0.2801	-0.0547	0.3912	-27.4989	13.2636	-3.9821
2	6.6816	-2.4177	1.5523	3.8123	-1.8685	4.6075	-0.1534	-0.3843	-0.3072	0.7199	0.2153	0.4015	-0.0702	-0.099	-0.0436	0.4575	-0.0197	0.0721	0.2045	-0.0042	0.3394	-21.9552	19.4458	2.5163
3	7.499	-1.6064	0.2439	2.2343	-0.4297	1.5123	-0.0673	0.1694	0.1355	0.2051	0.0093	0.0297	-0.1425	-0.0646	0.0424	0.2942	-0.0219	0.0277	0.2027	-0.0242	0.2194	-15.2953	23.2073	-10.0247
4	4.0156	1.0942	5.4152	6.5585	1.8574	5.9093	-0.1698	-0.0848	0.1767	0.5741	-0.0038	-0.0416	-0.2875	0.0499	0.1404	0.3739	-0.0215	0.0435	0.36	0.0391	0.2922	-7.6436	28.4269	-6.4705
5	5.3774	-0.7655	-0.0868	1.27	-0.4058	2.5074	-0.1067	-0.0196	-0.3969	0.2841	0.0779	0.1046	0.2003	0.0329	0.0193	0.3568	0.014	0.0301	0.2052	-0.0359	0.2213	-16.6054	16.7323	-3.6539
6	8.1309	-5.2266	3.2573	10.8204	-4.2927	4.5385	-0.3139	1.2864	-0.3742	-0.1625	0.1582	1.0173	0.2993	-0.7704	-0.1018	0.4232	-0.1663	-0.0119	0.8222	-0.1008	0.432	-31.1566	15.3331	-22.473
7	2.1311	0.1468	-0.3336	3.2383	-0.098	1.8328	-0.0172	0.197	-0.1906	0.0064	0.0051	-0.5643	0.2118	0.425	0.0202	0.2828	0.0542	-0.0145	0.4668	-0.1047	0.3876	10.9832	10.8892	-23.251
8	2.2475	1.1939	-0.081	5.6444	1.8743	1.8345	-0.0068	0.3547	0.223	-0.1169	-0.0264	0.4378	-0.0898	-0.2943	0.0566	0.2627	0.0498	0.0113	0.4715	-0.0046	0.3526	1.5411	23.9446	-29.1686
9	6.4679	-5.7897	-0.741	5.9555	2.9549	4.1123	-0.596	-0.5559	-1.801	0.7946	-0.1574	0.8882	-0.0323	-0.8754	0.7011	0.5009	-0.0514	0.0437	0.5752	0.0392	0.6903	-1.6419	42.4932	-15.5556
10	1.3518	0.1854	-0.6331	4.2334	0.0776	2.67	-0.16	0.4199	-0.2464	-0.4139	0.0673	-0.0888	0.2181	0.1084	0.1122	0.2479	0.0692	-0.0002	0.4962	-0.0981	0.3452	7.4709	12.9234	-32.2214
11	2.2609	-0.2209	-0.3707	1.5878	-1.29	3.1216	0.0006	0.3474	0.734	0.0441	0.0627	0.0789	-0.5443	-0.138	-0.0844	0.573	-0.0046	-0.0802	0.2995	0.1252	0.5048	-6.7167	67.5556	-22.0112
12	2.7185	0.3348	-0.4112	1.8961	-0.9695	2.0392	-0.0671	0.1539	0.18	0.034	0.197	0.1643	0.0989	-0.2647	-0.1362	0.5082	-0.0016	-0.0647	0.3436	0.088	0.3456	-15.3014	54.9636	-18.2761
13	8.3011	5.2191	-8.8875	8.657	-5.3059	8.2717	-0.265	-0.4534	-0.0444	0.6682	-0.2724	-0.3078	-0.3258	0.3687	0.6649	0.4633	0.0216	-0.0858	0.3043	-0.0371	0.4587	-23.7203	40.2423	-9.8551
14	2.6121	0.1145	-1.4913	1.9873	-0.8496	2.0854	0.1557	0.2437	0.506	0.0272	0.1191	0.3389	-0.2317	-0.2603	-0.2547	0.4911	-0.0103	-0.0742	0.335	0.0827	0.3755	-17.0828	58.1891	-16.4541
15	6.9364	0.2509	-4.661	2.7262	-1.0477	7.0027	0.3298	0.8884	0.2709	-0.6343	-0.0188	0.1915	-0.1761	-0.5594	-0.2903	0.6536	-0.0798	-0.1145	0.7041	0.2038	0.4511	-14.3738	61.5128	-38.9194

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'C' and (resid 14 through 91 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'C' and (resid 92 through 123 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'C' and (resid 124 through 181 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'C' and (resid 182 through 293 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'C' and (resid 294 through 330 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'C' and (resid 331 through 360 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 13 through 133 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 134 through 192 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 193 through 294 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resid 295 through 360 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 14 through 71 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 72 through 181 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 182 through 294 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 295 through 330 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 331 through 359 )

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 / 糖 , 2種, 4分子 CAB

-
非ポリマー , 6種, 267分子

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-タンパク質 / 糖 , 2種, 4分子 CAB

-非ポリマー , 6種, 267分子

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 / 糖 , 2種, 4分子 CAB

-
非ポリマー , 6種, 267分子

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)