登録情報 | データベース: PDB / ID: 5gmc |
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タイトル | Methylation at position 32 of tRNA catalyzed by TrmJ alters oxidative stress response in Pseudomonas aeruiginosa |
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要素 | tRNA (cytidine/uridine-2'-O-)-methyltransferase TrmJ |
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キーワード | TRANSFERASE / Pseudomonas aeruginosa / tRNA methyltransferase / TrmJ / oxidative stress / tRNA modification / wobble base |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
tRNA (cytidine32/uridine32-2'-O)-methyltransferase / tRNA nucleoside ribose methylation / : / RNA binding / cytosol類似検索 - 分子機能 RNA methyltransferase TrmJ/LasT / tRNA/rRNA methyltransferase, SpoU type / SpoU rRNA Methylase family / SPOUT methyltransferase, trefoil knot domain / Alpha/beta knot / tRNA (guanine-N1-)-methyltransferase, N-terminal / Alpha/beta knot methyltransferases / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 tRNA (cytidine/uridine-2'-O-)-methyltransferase TrmJ類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.7 Å |
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データ登録者 | Jaroensuk, J. / Atichartpongkul, S. / Chionh, Y.H. / Wong, Y.H. / Liew, C.W. / McBee, M.E. / Thongdee, N. / Prestwich, E.G. / DeMott, M.S. / Mongkolsuk, S. ...Jaroensuk, J. / Atichartpongkul, S. / Chionh, Y.H. / Wong, Y.H. / Liew, C.W. / McBee, M.E. / Thongdee, N. / Prestwich, E.G. / DeMott, M.S. / Mongkolsuk, S. / Dedon, P.C. / Lescar, J. / Fuangthong, M. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2016 タイトル: Methylation at position 32 of tRNA catalyzed by TrmJ alters oxidative stress response in Pseudomonas aeruginosa. 著者: Jaroensuk, J. / Atichartpongkul, S. / Chionh, Y.H. / Wong, Y.H. / Liew, C.W. / McBee, M.E. / Thongdee, N. / Prestwich, E.G. / DeMott, M.S. / Mongkolsuk, S. / Dedon, P.C. / Lescar, J. / Fuangthong, M. |
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履歴 | 登録 | 2016年7月13日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2016年10月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 2.0 | 2017年12月13日 | Group: Database references / Derived calculations / Polymer sequence カテゴリ: citation / entity_poly / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _entity_poly.pdbx_target_identifier / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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改定 2.1 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
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