登録情報 | データベース: PDB / ID: 5fie |
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タイトル | Crystal structure of N-terminal domain of shaft pilin spaA from Lactobacillus rhamnosus GG |
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要素 | Cell surface protein SpaA |
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キーワード | CELL ADHESION / Pilin / spaA / probiotic / isopeptide / SpaCBA pili / adhesin |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
Gram-positive pilin subunit D1, N-terminal / Gram-positive pilin subunit D1, N-terminal domain / Prealbumin-like fold domain / Prealbumin-like fold domain / LPXTG cell wall anchor motif / Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile. / LPXTG cell wall anchor domain / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like fold / Immunoglobulin-like ...Gram-positive pilin subunit D1, N-terminal / Gram-positive pilin subunit D1, N-terminal domain / Prealbumin-like fold domain / Prealbumin-like fold domain / LPXTG cell wall anchor motif / Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile. / LPXTG cell wall anchor domain / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like fold / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Lactobacillus rhamnosus GG (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2 Å |
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データ登録者 | Chaurasia, P. / Pratap, S. / von Ossowski, I. / Palva, A. / Krishnan, V. |
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資金援助 | インド, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Department of Biotechnology | BT/PR5891/BRB/10/1098/2012 | インド |
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引用 | ジャーナル: Sci Rep / 年: 2016 タイトル: New insights about pilus formation in gut-adapted Lactobacillus rhamnosus GG from the crystal structure of the SpaA backbone-pilin subunit 著者: Chaurasia, P. / Pratap, S. / von Ossowski, I. / Palva, A. / Krishnan, V. |
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履歴 | 登録 | 2015年12月23日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2016年7月20日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_oper_list / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry |
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