- PDB-5f0w: Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1 -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5f0w
タイトル
Crystal structure of human copper homeostatic proteins atox1
要素
Copper transport protein ATOX1
キーワード
METAL BINDING PROTEIN / copper / homeostatic
機能・相同性
機能・相同性情報
metallochaperone activity / Ion influx/efflux at host-pathogen interface / copper-dependent protein binding / copper chaperone activity / copper ion transport / Detoxification of Reactive Oxygen Species / cuprous ion binding / intracellular copper ion homeostasis / response to oxidative stress / copper ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.5419 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.7→50 Å / Num. obs: 10336 / % possible obs: 90.2 % / 冗長度: 6.2 % / Net I/σ(I): 17.776
反射 シェル
解像度: 2.7→2.75 Å / 冗長度: 6.3 % / Mean I/σ(I) obs: 4.667 / % possible all: 87.4
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0049
精密化
HKL-3000
データ削減
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.7→24.48 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.899 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.876 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.736 / ESU R Free: 0.362 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.28935
487
4.5 %
RANDOM
Rwork
0.261
-
-
-
obs
0.26235
10336
94.54 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK