PDB-5eou: Pseudomonas aeruginosa PilM:PilN1-12 bound to ATP

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5eou

タイトル

Pseudomonas aeruginosa PilM:PilN1-12 bound to ATP

要素

Type 4 fimbrial biogenesis protein PilM,Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN

キーワード

PEPTIDE BINDING PROTEIN / PilM / PilN / Type IV Pilus / T4P

機能・相同性

機能・相同性情報

type IV pilus assembly / type IV pilus / type IV pilus-dependent motility / cell division / ATP binding / metal ion binding / plasma membrane / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.4 Å

データ登録者

McCallum, M. / Tammam, S. / Robinson, H. / Shah, M. / Calmettes, C. / Moraes, T. / Burrows, L. / Howell, L.P.

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2016
タイトル: PilN Binding Modulates the Structure and Binding Partners of the Pseudomonas aeruginosa Type IVa Pilus Protein PilM.
著者: McCallum, M. / Tammam, S. / Little, D.J. / Robinson, H. / Koo, J. / Shah, M. / Calmettes, C. / Moraes, T.F. / Burrows, L.L. / Howell, P.L.

履歴

登録	2015年11月10日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年4月27日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年6月8日	Group: Database references
改定 2.0	2023年9月27日	Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: atom_site / chem_comp_atom ...atom_site / chem_comp_atom / chem_comp_bond / citation / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_struct_oper_list / struct_conn Item: _atom_site.occupancy / _citation.journal_id_CSD ..._atom_site.occupancy / _citation.journal_id_CSD / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5eou.cif.gz	271.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5eou.ent.gz	219.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5eou.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	5eou_validation.pdf.gz	768 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5eou_full_validation.pdf.gz	772.7 KB	表示
XML形式データ	5eou_validation.xml.gz	26 KB	表示
CIF形式データ	5eou_validation.cif.gz	35.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/eo/5eou ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/eo/5eou	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5eoxC 5eoySC 5eq6C C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3i0w-d 3i0x-d 3dyl-2 4g2j-1 2fme-2 5kef-d 3dy8-2 4e90-2 2noe-d 5j5u-3 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#211 - 2017年7月線毛機械 (Pilus Machine) 類似性 (7)

登録構造単位

A: Type 4 fimbrial biogenesis protein PilM,Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN

B: Type 4 fimbrial biogenesis protein PilM,Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN

ヘテロ分子

81.6 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Type 4 fimbrial biogenesis protein PilM,Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
40.6 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: Type 4 fimbrial biogenesis protein PilM,Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
41 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	131.790, 131.790, 78.993
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	150
Space group name H-M	P321

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	B-523- HOH

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

#1: タンパク質	Type 4 fimbrial biogenesis protein PilM,Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN 分子量: 40044.574 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228) (緑膿菌), (組換発現) Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) 株: ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228 / 遺伝子: pilM, PA5044, pilN, PA5043 / プラスミド: pET28a / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: G3XD28, UniProt: G3XD30

#1: タンパク質

Type 4 fimbrial biogenesis protein PilM,Type 4 fimbrial biogenesis protein PilN

分子量: 40044.574 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228) (緑膿菌), (組換発現)

Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌)
株: ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228 / 遺伝子: pilM, PA5044, pilN, PA5043 / プラスミド: pET28a / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: G3XD28, UniProt: G3XD30

-
非ポリマー , 6種, 118分子

#2: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#3: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#4: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#5: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#6: 化合物	ChemComp-ATP / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP 分子量: 507.181 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃ / コメント: ATP, エネルギー貯蔵分子*YM
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 101 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.47 Å³/Da / 溶媒含有率: 50.26 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: ammonium sulphate, tris / PH範囲: 8

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: NSLS / ビームライン: X29A / 波長: 1.075 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2014年3月5日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.075 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.4→50 Å / Num. obs: 37322 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 19.9 % / R_sym value: 0.135 / Net I/σ(I): 21.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	dev_1639	精密化
Coot		モデル構築
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定
HKL-2000		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5EOY

5eoy

解像度: 2.4→39.497 Å / SU ML: 0.31 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 25.08 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2387	1600	5.1 %
R_work	0.2123	-	-
obs	0.2137	29964	99.93 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.4→39.497 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4904	0	79	101	5084

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	5021
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.639	6835
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	11.227	1750
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.025	844
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	868

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.4001-2.4376	0.3386	178	0.3148	2550	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4376-2.4775	0.3324	185	0.2962	2521	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4775-2.5202	10000000	0	0.2754	2687	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5202-2.5661	0.2975	186	0.2565	2542	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5661-2.6154	0.2794	186	0.2789	2527	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6154-2.6688	0.3233	183	0.2733	2553	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6688-2.7268	10000000	0	0.2642	2714	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7268-2.7902	0.2593	182	0.2659	2561	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7902-2.86	0.3112	182	0.2683	2564	X-RAY DIFFRACTION	100
2.86-2.9373	0.3108	180	0.2767	2512	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9373-3.0237	10000000	0	0.2609	2757	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0237-3.1212	0.3385	186	0.2684	2540	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1212-3.2327	0.2948	178	0.2535	2524	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2327-3.3621	0.2618	184	0.2346	2567	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3621-3.515	10000000	0	0.2287	2729	X-RAY DIFFRACTION	100
3.515-3.7002	0.2275	184	0.2069	2525	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7002-3.9319	0.2372	178	0.1913	2580	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9319-4.2351	0.2027	182	0.1839	2528	X-RAY DIFFRACTION	100
4.2351-4.6607	0.1793	170	0.1662	2586	X-RAY DIFFRACTION	100
4.6607-5.3337	10000000	0	0.1769	2708	X-RAY DIFFRACTION	100
5.3337-6.7146	0.2308	174	0.1962	2572	X-RAY DIFFRACTION	100
6.7146-39.5018	0.1857	161	0.1763	2543	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.8018	1.0473	0.6584	5.1285	1.0048	5.6875	-0.1119	-0.1163	-0.168	-0.0043	-0.1035	-0.3401	0.0069	0.1335	0.2381	0.2803	-0.0554	0.0007	0.594	-0.0664	0.4932	332.4295	217.7378	179.3715
2	8.4863	0.9978	1.5906	10.2971	-4.3598	6.5373	0.5706	0.2648	0.1101	-0.3192	-0.0291	1.2491	-0.833	-1.5708	-0.3432	0.6781	0.3056	0.1354	0.8442	-0.158	0.6693	323.0865	242.9331	171.6443
3	7.8302	4.4628	4.8374	3.329	0.9682	2.3344	-0.2486	-0.0656	0.6473	0.0134	-0.1378	0.4539	-0.0294	-0.6051	0.394	0.3478	-0.007	0.0567	0.6418	-0.0873	0.4922	329.8025	226.9749	176.0108
4	8.8516	-1.0568	-0.1878	6.4956	-2.531	6.3692	0.0277	0.6805	0.282	-0.2799	0.2515	0.1838	-0.951	-0.0902	-0.3225	0.4619	0.0142	0.0536	0.5297	0.0584	0.5072	311.9424	225.6468	179.0365
5	8.9452	-1.7577	1.8526	7.1122	-2.2701	8.8754	-0.2795	-0.0249	-0.1504	1.9526	-0.2965	-0.7521	0.8425	0.543	0.4442	1.0208	0.0327	-0.0284	1.0217	0.1321	0.671	316.5019	211.731	201.0026
6	10.335	-0.5066	1.3735	8.8998	0.0544	7.6908	0.0779	-0.3685	0.0082	0.0993	0.1145	1.0736	-0.4146	-0.681	-0.294	0.3168	-0.001	0.0438	0.5353	0.0055	0.4657	305.3907	221.7692	185.0142
7	7.6113	3.4	-0.5202	6.6693	-3.0022	6.7331	-0.2988	0.5028	-0.3186	-0.485	0.379	0.0472	0.5997	-0.3078	-0.0923	0.3191	-0.0523	0.0351	0.6301	-0.1818	0.4464	323.2577	212.9322	173.4313
8	2.3448	0.1143	0.9189	2.9494	-0.5448	4.9087	-0.1015	-0.104	0.3298	-0.0178	-0.0364	0.3803	-0.2993	-0.2897	0.1652	0.2704	-0.0276	-0.0593	0.3734	-0.054	0.4704	355.4461	238.8668	179.5549
9	3.6671	1.7833	-3.5826	4.7687	1.3853	9.9931	-0.5368	-0.5465	-0.8329	-0.4173	-0.2352	-0.2053	0.973	1.0124	0.8017	0.6528	0.1398	-0.0854	0.6048	0.1467	0.8568	363.514	211.9026	171.1587
10	8.0132	1.6556	-1.6508	1.5668	0.024	0.5438	-0.0201	-0.0704	-0.3645	-0.1237	-0.0517	0.1413	0.0785	-0.0067	0.08	0.3397	-0.0125	-0.0993	0.5653	-0.0606	0.4695	357.8679	229.7845	176.0171
11	9.3854	-0.5111	0.8781	5.4539	5.4505	3.7952	0.1274	0.8134	-0.217	-0.4253	0.0717	0.174	1.082	0.7377	-0.202	0.435	0.1313	-0.0793	0.4634	-0.0624	0.4308	376.0325	230.7078	179.1276
12	9.9843	-3.3951	-5.5996	6.3155	2.5527	9.0538	-0.0497	-0.2856	0.7777	0.5049	-0.0891	0.4318	-0.4617	-0.1206	0.1517	0.3029	0.0349	-0.0416	0.2764	-0.05	0.5972	371.8144	244.046	201.484
13	9.8477	-1.6883	0.8856	2.47	0.3782	8.5333	-0.0759	0.226	-0.106	0.0909	0.047	-0.3124	0.5037	1.0328	-0.0203	0.3137	0.0091	-0.0513	0.4485	0.0115	0.3567	382.7851	234.3321	184.6878
14	5.2954	3.3179	3.6335	6.8708	-2.8752	4.0119	-0.6247	0.6466	0.2737	-0.2066	0.356	-0.0622	-0.9808	0.1858	0.3195	0.4146	-0.0517	-0.0817	0.4979	-0.0073	0.5146	364.5619	243.546	173.5751
15	2.1779	5.9106	-1.5372	2.2256	-4.4426	6.0378	0.2296	1.4041	-1.5097	-2.0301	-0.6297	-0.4109	-1.0361	1.4623	0.4494	0.7442	0.2087	0.0996	0.9318	-0.1165	0.874	333.0507	234.7527	168.8169
16	9.5698	0.1907	-2.6455	7.1665	-6.91	8.12	0.0208	1.5952	-1.248	-1.0341	0.1021	-1.3425	0.6614	-0.7392	0.3051	0.5706	-0.051	-0.1412	0.5047	-0.2491	0.8239	357.8423	223.3802	168.8835

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 9 through 81)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 82 through 147 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 148 through 182 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 183 through 223 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 224 through 265 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 266 through 318 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 319 through 354 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 10 through 81)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 82 through 147 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 148 through 182 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 183 through 223 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 224 through 265 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 266 through 318 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 319 through 355 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'A' and (resid 359 through 367)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 358 through 366)

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

-
非ポリマー , 6種, 118分子

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-タンパク質 , 1種, 2分子 AB

-非ポリマー , 6種, 118分子

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

-
非ポリマー , 6種, 118分子

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)